（经验分享）安装WRF-CHEM以及编译前处理软件prep-chem-src

denglin19901030

苦逼的安装过程，记录一下以便以后万一再换大型机做参考。
WRF-CHEM的安装只要下载与自己编译WRF相同的chem安装包即可，我使用的是WRFV3-Chem-3.6.1.TAR,解压之后会生成chem文件夹，然后将其放在WRFV3里。修改bashrc文件，加入export EM_CORE=1，export NMM_CORE=0,export WRF_CHEM=0, export WRF_KPP=0,因为不知道kpp的具体用处，且想先简单安装，故kpp设为0，source ~/.bashrc。之后就是./configure,./compile，这里补充我使用的是深圳的大型机，编译选项为Linux x86_64 i486 i586 i686,ifort compiler with icc(dmpar),若能在test/em_real下生成real.exe、wrf.exe，说明安装成功，随后./compile emi_conv >& emcompile.log，若能后test/em_real/目录下会生成 convert_emiss.exe，说明安装成功，参考wrf-chem的安装问题
http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=41254&fromuid=27532
(出处: 气象家园)
下xyan88的回复。
prep-chem-src的重点是一定要看readme文件，按照readme文件里，必须要先安装JPEG,ZLIB,HDF5,NETCDF4,我选取的是zlib-1.2.11.tar,netcdf-4.1.3.tar,hdf5-1.8.13.tar,jpegsrc.v6b.tar,以下为README的部分节选：
Configuring/Installing HDF 5
------------------------------
When compiling PREP-CHEM-SRC codes on a Linux system using the PGI (Intel)
compiler, make sure the netCDF and HDF* library has been installed using the same PGI (Intel) compiler.
FC=pgf90(ifort) CC=pgcc(icc) CXX=pgc++(icpc) ./configure  \
--prefix=/path_libs/hdf5-1.8.13 \
--with-zlib=/path_libs/zlib-1.2.11  \
--disable-shared \
--enable-fortran
make
make check
make install
make check-install

INSTALL ZLIB
FC=pgf90(ifort) CC=pgcc(icc) ./configure --prefix=/path-zlib-1.2.11
make
make check
make install
INSTALL NETCDF
FC=pgf90(ifort) F77=pgf90(ifort) F90=pgf90(ifort) CC=pgcc(icc) ./configure \
   --prefix=path_netcdf \
   --disable-shared \
   --enable-fortran \
   --disable-netcdf-4
make
make check
make install

README中默认是pgi编译器，而我之前compileWRF时用的是intel fortran(ifort)和intel c(icc),故（）里即为使用该编译器时改用的命令，一切以readme文件为主，因为忽视了这一点，翻遍气象家园以及百度都没能准确编译完成。
tips1：编译hdf5的时间很长，并且会看到很多的warning,大多是我之前提问时碰到的incompatible的问题，其实是可以不用管的。可参考wrf-chem中prep_chem_sources编译需要的HDF5安装(已解决）
http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=44072&fromuid=27532
(出处: 气象家园)

tips2:  在编译netcdf的时候，--prefix=path_netcdf最好是区分于解压完后的文件夹，否则会在make check 的时候报错，但是我在编译hdf5的时候并没有单独mkdir文件夹也不会有报错，所以此处是小提示。
最后就是编译prep-chem-src了，首先解压文件和WRF及WPS同一级目录下，进入bin/build,会看到很多的include.mk.XXXX文件，应该vi的是include.mk.intel.wrf，进入之后修改各类库的路径，参考气象家园上的帖子。最后make OPT=intel.wrf CHEM=RADM_WRF_FIM即可最终生成我想要的prep_chem_sources_RADM_WRF_FIM.exe。
WRF-CHEM的苦逼之路才刚开始，希望有一起学习的小伙伴们都能把自己的经验多多分享，看了这么多安装贴，看到最多的一句就是自己摸CHEM好心累，真的好心累啊啊啊啊

xyan88

请问convert_emiss.exe  生成的00z  只有1个时次的吗？还是12个时次的

WENXING

这个错误 我在第二个图中加了！号后，  运行之后还是出错，然后发现加的感叹号又没有了？

WENXING

楼主可否帮忙解答一下

1946831564

请问前4个软件要装到哪，大型机已经装了后两个，我还要不要再装

denglin19901030

1946831564 发表于 2017-7-1 21:44
请问前4个软件要装到哪，大型机已经装了后两个，我还要不要再装

大型机已经装的就不用了，直接加入环境变量就好了

denglin19901030

xyan88 发表于 2017-5-14 20:59
请问convert_emiss.exe  生成的00z  只有1个时次的吗？还是12个时次的

我现在convert出来是一个时次的，感觉也是不对

WENXING

denglin19901030 发表于 2017-7-2 20:13
大型机已经装的就不用了，直接加入环境变量就好了

大神 可否帮忙回答一下我的 问题呢？

denglin19901030

WENXING 发表于 2017-7-2 20:14
大神 可否帮忙回答一下我的 问题呢？

为啥要加感叹号？还有就是需要clean以下，在make OPT=xxxx后面加个clean，然后再运行

WENXING

denglin19901030 发表于 2017-7-2 20:17
为啥要加感叹号？还有就是需要clean以下，在make OPT=xxxx后面加个clean，然后再运行

加感叹号 是我搜到的答案 也就是 加个clean  就可以了是吧。？