编译wrfchem出错

weiweicf

编译wrfchem不能生成.exe文件，是在虚拟机上装的，找不到原因，重装了系统也不行，使用的是CENTOS6.5系统，论坛里破解版PGI10.6，netcdf4.3.3.1和netcdf fortran4.4.2，可以顺利编译并运行WRF，但加入chem怎么也不能编译，弄了好几天了也还是不行，各位大神看看出错的原因是什么呢？我的.bashrc文件：

# .bashrc

# User specific aliases and functions

alias rm='rm -i'

alias cp='cp -i'

alias mv='mv -i'

#for PGI

export PGI=/opt/pgi/linux86-64/10.6

export PATH=$PGI/bin:$PATH

export MANPATH=$PGI/man:$MANPATH

export LM_LICENSE_FILE=/opt/pgi/license.dat

export CC=gcc

export CXX=g++

export FC=pgf90

export CFLAGS="-O2 -fPIC"

export FCFLAGS="-O2 -fPIC"

export FFLAGS="-O2 -fPIC"

export CXXFLAGS="-O2 -fPIC"

export LD_LIBRARY_PATH=/opt/zlib-1.2.8/lib:$LD_LIBRARY_PATH

#for HDF5

export HDF5=/opt/hdf5

export HDF5_INC=/opt/hdf5/include

export HDF5_LIB=/opt/hdf5/lib

export LD_LIBRARY_PATH=/opt/hdf5/lib:$LD_LIBRARY_PATH

#for netcdf

export NETCDF=/opt/netcdf-4.3.3.1

export NETCDF_LIB=$NETCDF/lib

export NETCDF_INC=$NETCDF/include

export PATH=$NETCDF/bin:$PATH

export LD_RUN_PATH=${NETCDF}/lib:${LD_RUN_PATH}

export LD_LIBRARY_PATH=/opt/libping-1.6.17/lib:$LD_LIBRARY_PATH

#for JASPER

export JASPER=/opt/jasper-1.900.1

export JASPERLIB=/$JASPER/lib

export JASPERINC=/$JASPER/include

#for WRF

export WRF_EM_CORE=1

export WRF_NMM_CORE=0

export WRF_CHEM=1

export WRF_KPP=0

# Source global definitions

if [ -f /etc/bashrc ]; then

        . /etc/bashrc

fi

出错日志见附件，谢谢各位大神指导啊，感激不尽

lhaikun@163.com

这是pgi和gnu混搭着用吗

lhaikun@163.com

另外compile.log把最后边部分贴出来就行了，上传附件别人看的时候还要下载扣金币....

weiweicf

出错日志还是见这个吧，要不附件还扣钱http://yun.baidu.com/s/1hl4Iy

weiweicf

lhaikun@163.com 发表于 2015-6-25 18:19
这是pgi和gnu混搭着用吗

嘿嘿，我也是瞎弄的，参考各种贴子弄的变量，大侠知道我哪错了吗？

weiweicf

weiweicf 发表于 2015-6-25 18:21
出错日志还是见这个吧，要不附件还扣钱http://yun.baidu.com/s/1nt5lBGP

貌似不行，我再看看

haozl07

编译是串行还是并行？

haozl07

可否把configure.wrf贴出来

weiweicf

haozl07 发表于 2015-6-25 19:49
可否把configure.wrf贴出来

# configure.wrf
#
# This file was automatically generated by the configure script in the
# top level directory. You may make changes to the settings in this
# file but be aware they will be overwritten each time you run configure.
# Ordinarily, it is necessary to run configure once, when the code is
# first installed.
#
# To permanently change options, change the settings for your platform
# in the file arch/configure.defaults then rerun configure.
#
SHELL           =       /bin/sh
DEVTOP          =       `pwd`
LIBINCLUDE      =       .
.SUFFIXES: .F .i .o .f90 .c

#### Get core settings from environment (set in compile script)
#### Note to add a core, this has to be added to.

COREDEFS = -DEM_CORE=$(WRF_EM_CORE) \
           -DNMM_CORE=$(WRF_NMM_CORE) -DNMM_MAX_DIM=2600 \
           -DCOAMPS_CORE=$(WRF_COAMPS_CORE) \
           -DDA_CORE=$(WRF_DA_CORE) \
-DEXP_CORE=$(WRF_EXP_CORE)

#### Single location for defining total number of domains.  You need
#### at least 1 + 2*(number of total nests).  For example, 1 coarse
#### grid + three fine grids = 1 + 2(3) = 7, so MAX_DOMAINS=7.

MAX_DOMAINS     =       21

#### DM buffer length for the configuration flags.

CONFIG_BUF_LEN  =       65536

#### Size of bitmasks (in 4byte integers) of stream masks for WRF I/O

MAX_HISTORY = 25

IWORDSIZE = 4
DWORDSIZE = 8
LWORDSIZE = 4
#### The settings in this section are defaults that may be overridden by the
#### architecture-specific settings in the next section.
##############################################################################

##############################################################################
#### NOTE:  Do not modify these default values here.  To override these
####        values, make changes after "Architecture specific settings".
##############################################################################

#### Native size (in bytes) of Fortran REAL data type on this architecture ####
#### Note:  to change real wordsize (for example, to promote REALs from
####        4-byte to 8-byte), modify the definition of RWORDSIZE in the
####        section following "Architecture specific settings".  Do not
####        change NATIVE_RWORDSIZE as is it architecture-specific.
NATIVE_RWORDSIZE = 4

#### Default sed command and script for Fortran source files ####
#SED_FTN = sed -f $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/arch/standard.sed
SED_FTN = $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/tools/standard.exe

# Hack to work around $(PWD) not changing during OSF1 build.
# $(IO_GRIB_SHARE_DIR) is reset during the OSF1 build only.
IO_GRIB_SHARE_DIR =
#### ESMF switches                 ####
#### These are set up by Config.pl ####
# switch to use separately installed ESMF library for coupling:  1==true
ESMF_COUPLING       = 0
# select dependences on module_utility.o
ESMF_MOD_DEPENDENCE = $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/esmf_time_f90/module_utility.o
# select -I options for external/io_esmf vs. external/esmf_time_f90
ESMF_IO_INC         = -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/esmf_time_f90
# select -I options for separately installed ESMF library, if present
ESMF_MOD_INC        =  $(ESMF_IO_INC)
# select cpp token for external/io_esmf vs. external/esmf_time_f90
ESMF_IO_DEFS        =
# select build target for external/io_esmf vs. external/esmf_time_f90
ESMF_TARGET         = esmf_time

# ESMFINCLUDEGOESHERE


#### NETCDF4 pieces
NETCDF4_IO_OPTS = -DUSE_NETCDF4_FEATURES -DWRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT
GPFS            =
CURL            =
HDF5            =
ZLIB            =
DEP_LIB_PATH    =
NETCDF4_DEP_LIB = $(DEP_LIB_PATH) $(HDF5) $(ZLIB) $(GPFS) $(CURL)

# NETCDF4INCLUDEGOESHERE


##############################################################################

LIBWRFLIB = libwrflib.a


#### Architecture specific settings ####

# Settings for x86_64 Linux, gfortran compiler with gcc   (serial)
#
DMPARALLEL      =        1
OMPCPP          =       # -D_OPENMP
OMP             =       # -fopenmp
OMPCC           =       # -fopenmp
SFC             =       gfortran
SCC             =       gcc
CCOMP           =       gcc
DM_FC           =       mpif90
DM_CC           =       mpicc
FC              =        $(SFC)
CC              =       $(SCC) -DFSEEKO64_OK
LD              =       $(FC)
RWORDSIZE       =       $(NATIVE_RWORDSIZE)
PROMOTION       =       # -fdefault-real-8  # uncomment manually
ARCH_LOCAL      =       -DNONSTANDARD_SYSTEM_SUBR -DWRF_USE_CLM -DNO_IEEE_MODULE
CFLAGS_LOCAL    =       -w -O3 -c
LDFLAGS_LOCAL   =
CPLUSPLUSLIB    =
ESMF_LDFLAG     =       $(CPLUSPLUSLIB)
FCOPTIM         =       -O2 -ftree-vectorize -funroll-loops
FCREDUCEDOPT    =       $(FCOPTIM)
FCNOOPT         =       -O0
FCDEBUG         =       # -g $(FCNOOPT) # -ggdb -fbacktrace -fbounds-check -ffpe-trap=invalid,zero,overflow
FORMAT_FIXED    =       -ffixed-form
FORMAT_FREE     =       -ffree-form -ffree-line-length-none
FCSUFFIX        =
BYTESWAPIO      =       -fconvert=big-endian -frecord-marker=4
FCBASEOPTS_NO_G =       -w $(FORMAT_FREE) $(BYTESWAPIO)
FCBASEOPTS      =       $(FCBASEOPTS_NO_G) $(FCDEBUG)
MODULE_SRCH_FLAG =
TRADFLAG        =      -traditional
CPP             =      /lib/cpp -P
AR              =      ar
ARFLAGS         =      ru
M4              =      m4 -G
RANLIB          =      ranlib
CC_TOOLS        =      $(SCC)

###########################################################
######################
# POSTAMBLE

FGREP = fgrep -iq
ARCHFLAGS       =    $(COREDEFS) -DIWORDSIZE=$(IWORDSIZE) -DDWORDSIZE=$(DWORDSIZE) -DRWORDSIZE=$(RWORDSIZE) -DLWORDSIZE=$(LWORDSIZE) \
                     $(ARCH_LOCAL) \
                     $(DA_ARCHFLAGS) \
                      -DDM_PARALLEL \
                      -DSTUBMPI \
                      -DNETCDF \
                       \
                       \
                       \
                       \
                       \
                       \
                       \
                       \
                      -DUSE_ALLOCATABLES \
                      -DGRIB1 \
                      -DINTIO \
                      -DLIMIT_ARGS \
                      -DCONFIG_BUF_LEN=$(CONFIG_BUF_LEN) \
                      -DMAX_DOMAINS_F=$(MAX_DOMAINS) \

-DMAX_HISTORY=$(MAX_HISTORY) \
                      -DNMM_NEST=$(WRF_NMM_NEST)
CFLAGS          =    $(CFLAGS_LOCAL) -DDM_PARALLEL -DSTUBMPI \
                      -DMAX_HISTORY=$(MAX_HISTORY) -DNMM_CORE=$(WRF_NMM_CORE)
FCFLAGS         =    $(FCOPTIM) $(FCBASEOPTS)
ESMF_LIB_FLAGS  =
# ESMF 5 -- these are defined in esmf.mk, included above
ESMF_IO_LIB     =    -L$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/esmf_time_f90 -lesmf_time
ESMF_IO_LIB_EXT =    -L$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/esmf_time_f90 -lesmf_time
INCLUDE_MODULES =    $(MODULE_SRCH_FLAG) \
                     $(ESMF_MOD_INC) $(ESMF_LIB_FLAGS) \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/main \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_netcdf \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_int \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/frame \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/share \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/phys \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/chem -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc \
-I$(NETCDFPATH)/include \

REGISTRY        =    Registry
CC_TOOLS_CFLAGS = -DNMM_CORE=$(WRF_NMM_CORE)

LIB_BUNDLED     = \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/fftpack/fftpack5/libfftpack.a \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_grib1/libio_grib1.a \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_grib_share/libio_grib_share.a \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_int/libwrfio_int.a \
                      $(ESMF_IO_LIB) \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/RSL_LITE/librsl_lite.a \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/frame/module_internal_header_util.o \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/frame/pack_utils.o

LIB_EXTERNAL    = \
                      -L$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_netcdf -lwrfio_nf -L/opt/netcdf-4.3.3.1/lib -lnetcdff -lnetcdf
LIB             =    $(LIB_BUNDLED) $(LIB_EXTERNAL) $(LIB_LOCAL) $(LIB_WRF_HYDRO)
LDFLAGS         =    $(OMP) $(FCFLAGS) $(LDFLAGS_LOCAL)
ENVCOMPDEFS     =     -DWRF_CHEM -DBUILD_CHEM=1
WRF_CHEM        =       1
CPPFLAGS        =    $(ARCHFLAGS) $(ENVCOMPDEFS) -I$(LIBINCLUDE) $(TRADFLAG)
NETCDFPATH      =    /opt/netcdf-4.3.3.1
PNETCDFPATH     =

bundled:  io_only
external: io_only $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/RSL_LITE/librsl_lite.a gen_comms_rsllite module_dm_rsllite $(ESMF_TARGET)
io_only:  esmf_time wrfio_nf   \
          wrf_ioapi_includes wrfio_grib_share wrfio_grib1 wrfio_int fftpack


######################
externals: io_only bundled external

gen_comms_serial :
( /bin/rm -f $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/tools/gen_comms.c )

module_dm_serial :
        ( if [ ! -e module_dm.F ] ; then /bin/cp module_dm_warning module_dm.F ; cat module_dm_stubs.F >> module_dm.F ; fi )

gen_comms_rsllite :
        ( if [ ! -e $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/tools/gen_comms.c ] ; then \
          /bin/cp $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/tools/gen_comms_warning $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/tools/gen_comms.c ; \
          cat $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/RSL_LITE/gen_comms.c >> $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/tools/gen_comms.c ; fi )

module_dm_rsllite :
        ( if [ ! -e module_dm.F ] ; then /bin/cp module_dm_warning module_dm.F ; \
cat $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/RSL_LITE/module_dm.F >> module_dm.F ; fi )

wrfio_nf :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_netcdf ; \
          make $(J) NETCDFPATH="$(NETCDFPATH)" RANLIB="$(RANLIB)" CPP="$(CPP)" \
          CC="$(SCC)" CFLAGS="$(CFLAGS)" \
          FC="$(SFC) $(PROMOTION) $(OMP) $(FCFLAGS)" TRADFLAG="$(TRADFLAG)" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" )

wrfio_pnf :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_pnetcdf ; \
          make $(J) NETCDFPATH="$(PNETCDFPATH)" RANLIB="$(RANLIB)" CPP="$(CPP) $(ARCHFLAGS)" \
          FC="$(FC) $(PROMOTION) $(OMP) $(FCFLAGS)" TRADFLAG="$(TRADFLAG)" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" )

wrfio_grib_share :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_grib_share ; \
          make $(J) CC="$(SCC)" CFLAGS="$(CFLAGS)" RM="$(RM)" RANLIB="$(RANLIB)" CPP="$(CPP)" \
FC="$(SFC) $(PROMOTION) -I. $(FCDEBUG) $(FCBASEOPTS) $(FCSUFFIX)" TRADFLAG="$(TRADFLAG)" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" archive)

wrfio_grib1 :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_grib1 ; \
          make $(J) CC="$(SCC)" CFLAGS="$(CFLAGS)" RM="$(RM)" RANLIB="$(RANLIB)" CPP="$(CPP)" \
          FC="$(SFC) $(PROMOTION) -I. $(FCDEBUG) $(FCBASEOPTS) $(FCSUFFIX)" TRADFLAG="$(TRADFLAG)" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" archive)

wrfio_grib2 :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_grib2 ; \
          make $(J) CC="$(SCC)" CFLAGS="$(CFLAGS) " RM="$(RM)" RANLIB="$(RANLIB)" \
          CPP="$(CPP)" \
          FC="$(SFC) $(PROMOTION) -I. $(FCDEBUG) $(FCBASEOPTS) $(FCSUFFIX)" TRADFLAG="-traditional" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" \
          FIXED="$(FORMAT_FIXED)" archive)
wrfio_int :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_int ; \
          make $(J) CC="$(CC)" RM="$(RM)" RANLIB="$(RANLIB)" CPP="$(CPP)" \
          FC="$(FC) $(PROMOTION) $(FCDEBUG) $(FCBASEOPTS) $(OMP)" FGREP="$(FGREP)" \
          TRADFLAG="$(TRADFLAG)" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" ARCHFLAGS="$(ARCHFLAGS)" all )

esmf_time :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/esmf_time_f90 ; \
          make $(J) FC="$(SFC) $(PROMOTION) $(FCDEBUG) $(FCBASEOPTS)" RANLIB="$(RANLIB)" \
          CPP="$(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc -I. $(ARCHFLAGS) $(TRADFLAG)" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" )

fftpack :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/fftpack/fftpack5 ; \
          make $(J) FC="$(SFC)" FFLAGS="$(PROMOTION) $(FCDEBUG) $(FCBASEOPTS)" RANLIB="$(RANLIB)" AR="$(AR)" \
          ARFLAGS="$(ARFLAGS)" CPP="$(CPP)" CPPFLAGS="$(CPPFLAGS)" RM="$(RM)" )
atm_ocn :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/atm_ocn ; \
          make $(J) CC="$(SCC)" CFLAGS="$(CFLAGS) " RM="$(RM)" RANLIB="$(RANLIB)" \
          CPP="$(CPP)" CPPFLAGS="$(CPPFLAGS)" \
          FC="$(DM_FC) $(PROMOTION) -I. $(FCDEBUG) $(FCBASEOPTS) $(FCSUFFIX)" TRADFLAG="-traditional" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" \
          FIXED="$(FORMAT_FIXED)" )

$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/RSL_LITE/librsl_lite.a :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/RSL_LITE ; make $(J) CC="$(CC) $(CFLAGS)" \
          FC="$(FC) $(FCFLAGS) $(OMP) $(PROMOTION) $(BYTESWAPIO)" \
          CPP="$(CPP) -I. $(ARCHFLAGS) $(OMPCPP) $(TRADFLAG)" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" ;\
          $(RANLIB) $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/RSL_LITE/librsl_lite.a )

######################
#       Macros, these should be generic for all machines

LN      =       ln -sf
MAKE    =       make -i -r
RM      =       rm -f


# These sub-directory builds are identical across all architectures

wrf_ioapi_includes :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/ioapi_share ; \
          $(MAKE) NATIVE_RWORDSIZE="$(NATIVE_RWORDSIZE)" RWORDSIZE="$(RWORDSIZE)" AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" )

wrfio_esmf :
        ( cd $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_esmf ; \
          make FC="$(FC) $(PROMOTION) $(FCDEBUG) $(FCBASEOPTS) $(ESMF_MOD_INC)" \
          RANLIB="$(RANLIB)" CPP="$(CPP) $(POUND_DEF) " AR="$(AR)" ARFLAGS="$(ARFLAGS)" )

#       There is probably no reason to modify these rules

.F.i:
$(RM) $@
        $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $*.F > $@
        mv $*.i $(DEVTOP)/pick/$*.f90
        cp $*.F $(DEVTOP)/pick

.F.o:
        $(RM) $@
        $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $(OMPCPP) $*.F  > $*.bb
        $(SED_FTN) $*.bb | $(CPP) $(TRADFLAG) > $*.f90
        $(RM) $*.b $*.bb
        @ if echo $(ARCHFLAGS) | $(FGREP) 'DVAR4D'; then \
          echo COMPILING $*.F for 4DVAR ; \
          $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/var/build/da_name_space.pl $*.f90 > $*.f90.tmp ; \
          mv $*.f90.tmp $*.f90 ; \
        fi
        $(FC) -o $@ -c $(FCFLAGS) $(OMP) $(MODULE_DIRS) $(PROMOTION) $(FCSUFFIX) $*.f90


.F.f90:
        $(RM) $@
        $(SED_FTN) $*.F > $*.b
$(RM) $@
        $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $*.F > $@
        mv $*.i $(DEVTOP)/pick/$*.f90
        cp $*.F $(DEVTOP)/pick

.F.o:
        $(RM) $@
        $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $(OMPCPP) $*.F  > $*.bb
        $(SED_FTN) $*.bb | $(CPP) $(TRADFLAG) > $*.f90
        $(RM) $*.b $*.bb
        @ if echo $(ARCHFLAGS) | $(FGREP) 'DVAR4D'; then \
          echo COMPILING $*.F for 4DVAR ; \
          $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/var/build/da_name_space.pl $*.f90 > $*.f90.tmp ; \
          mv $*.f90.tmp $*.f90 ; \
        fi
        $(FC) -o $@ -c $(FCFLAGS) $(OMP) $(MODULE_DIRS) $(PROMOTION) $(FCSUFFIX) $*.f90


.F.f90:
        $(RM) $@
        $(SED_FTN) $*.F > $*.b
  $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $*.b  > $@
        $(RM) $*.b

.f90.o:
        $(RM) $@
        $(FC) -o $@ -c $(FCFLAGS) $(PROMOTION) $(FCSUFFIX) $*.f90

setfeenv.o : setfeenv.c
        $(RM) $@
        $(CCOMP) -o $@ -c $(CFLAGS) $(OMPCC) $*.c

.c.o:
        $(RM) $@
        $(CC) -o $@ -c $(CFLAGS) $*.c

# A little more adventurous.  Allow full opt on
# mediation_integrate.o \
# shift_domain_em.o \
# solve_em.o  <-- gets a little kick from SOLVE_EM_SPECIAL too, if defined
# mediation_feedback_domain.o : mediation_feedback_domain.F
# mediation_force_domain.o : mediation_force_domain.F
# mediation_interp_domain.o : mediation_interp_domain.F

# compile these without high optimization to speed compile
mediation_integrate.o : mediation_integrate.F
track_driver.o : track_driver.F
convert_nmm.o : convert_nmm.F
init_modules_em.o : init_modules_em.F
input_wrf.o : input_wrf.F
module_io.o : module_io.F
module_comm_dm.o : module_comm_dm.F
module_comm_dm_0.o : module_comm_dm_0.F
module_comm_dm_1.o : module_comm_dm_1.F
module_comm_dm_2.o : module_comm_dm_2.F
module_comm_dm_3.o : module_comm_dm_3.F
module_comm_nesting_dm.o : module_comm_nesting_dm.F
module_configure.o : module_configure.F
module_dm.o : module_dm.F
module_domain.o : module_domain.F
module_domain_type.o : module_domain_type.F
module_alloc_space_0.o : module_alloc_space_0.F
module_alloc_space_1.o : module_alloc_space_1.F
module_alloc_space_2.o : module_alloc_space_2.F
module_alloc_space_3.o : module_alloc_space_3.F
module_alloc_space_4.o : module_alloc_space_4.F
module_alloc_space_5.o : module_alloc_space_5.F
module_alloc_space_6.o : module_alloc_space_6.F
module_alloc_space_7.o : module_alloc_space_7.F
module_alloc_space_8.o : module_alloc_space_8.F
module_alloc_space_9.o : module_alloc_space_9.F
module_tiles.o : module_tiles.F
module_fddaobs_rtfdda.o : module_fddaobs_rtfdda.F
module_initialize.o : module_initialize.F
module_physics_init.o : module_physics_init.F
module_initialize_b_wave.o : module_initialize_b_wave.F
module_initialize_hill2d_x.o : module_initialize_hill2d_x.F
module_initialize_quarter_ss.o : module_initialize_quarter_ss.F
module_initialize_real.o : module_initialize_real.F
module_initialize_real.o: module_initialize_real.F
module_initialize_squall2d_x.o : module_initialize_squall2d_x.F
module_initialize_squall2d_y.o : module_initialize_squall2d_y.F
module_initialize_scm_xy.o : module_initialize_scm_xy.F
module_integrate.o : module_integrate.F
module_io_mm5.o : module_io_mm5.F
module_io_wrf.o : module_io_wrf.F
module_si_io.o : module_si_io.F
module_wps_io_arw.o : module_wps_io_arw.F
module_state_description.o : module_state_description.F
output_wrf.o : output_wrf.F
solve_interface.o : solve_interface.F
start_domain.o : start_domain.F
start_em.o : start_em.F
wrf_bdyin.o : wrf_bdyin.F
wrf_bdyout.o : wrf_bdyout.F
wrf_ext_read_field.o : wrf_ext_read_field.F
wrf_ext_write_field.o : wrf_ext_write_field.F
wrf_fddaobs_in.o : wrf_fddaobs_in.F
wrf_histin.o : wrf_histin.F
wrf_histout.o : wrf_histout.F
wrf_inputin.o : wrf_inputin.F
wrf_inputout.o : wrf_inputout.F
wrf_restartin.o : wrf_restartin.F
wrf_restartout.o : wrf_restartout.F
wrf_tsin.o : wrf_tsin.F
nl_get_0_routines.o : nl_get_0_routines.F
nl_get_1_routines.o : nl_get_1_routines.F
nl_set_0_routines.o : nl_set_0_routines.F
nl_set_1_routines.o : nl_set_1_routines.F

mediation_integrate.o \
track_driver.o \
convert_nmm.o \
init_modules_em.o \
module_dm.o \
module_fddaobs_rtfdda.o \
module_initialize.o \
module_initialize_b_wave.o \
module_initialize_hill2d_x.o \
module_initialize_quarter_ss.o \
module_initialize_real.o \
module_initialize_squall2d_x.o \
module_initialize_squall2d_y.o \
module_initialize_scm_xy.o \
module_integrate.o \
module_io_mm5.o \
module_io_wrf.o \
module_si_io.o \
module_wps_io_arw.o \
module_tiles.o \
output_wrf.o \
solve_interface.o \
start_domain.o \
start_em.o \
wrf_fddaobs_in.o \
wrf_tsin.o :
        $(RM) $@
        $(SED_FTN) $*.F > $*.b
        $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $(OMPCPP) $*.b  > $*.f90
        $(RM) $*.b
        @ if echo $(ARCHFLAGS) | $(FGREP) 'DVAR4D'; then \
          echo COMPILING $*.F for 4DVAR ; \
          $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/var/build/da_name_space.pl $*.f90 > $*.f90.tmp ; \
          mv $*.f90.tmp $*.f90 ; \
fi
        if $(FGREP) '!$$OMP' $*.f90 ; then \
          if [ -n "$(OMP)" ] ; then echo COMPILING $*.F WITH OMP ; fi ; \
          $(FC) -c $(PROMOTION) $(FCNOOPT) $(FCBASEOPTS) $(MODULE_DIRS) $(FCSUFFIX) $(OMP) $*.f90 ; \
        else \
          if [ -n "$(OMP)" ] ; then echo COMPILING $*.F WITHOUT OMP ; fi ; \
          $(FC) -c $(PROMOTION) $(FCNOOPT) $(FCBASEOPTS) $(MODULE_DIRS) $(FCSUFFIX) $*.f90 ; \
        fi

#solve_em.o :
#       $(RM) $@
#       $(SED_FTN) $*.F > $*.b
#       $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $*.b  > $*.f90
#       $(RM) $*.b
#       $(FC) -o $@ -c $(FCFLAGS) $(MODULE_DIRS) $(PROMOTION) $(FCSUFFIX) $(SOLVE_EM_SPECIAL) $(OMP) $*.f90
module_sf_ruclsm.o : module_sf_ruclsm.F

module_sf_ruclsm.o :
        $(RM) $@
        $(SED_FTN) $*.F > $*.b
        $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $(OMPCPP) $*.b  > $*.f90
        $(RM) $*.b
        if $(FGREP) '!$$OMP' $*.f90 ; then \
          echo COMPILING $*.F WITH OMP ; \
          if [ -n "$(OMP)" ] ; then echo COMPILING $*.F WITH OMP ; fi ; \
          $(FC) -c $(PROMOTION) $(FCREDUCEDOPT) $(FCBASEOPTS) $(MODULE_DIRS) $(FCSUFFIX) $(OMP) $*.f90 ; \
        else \
          if [ -n "$(OMP)" ] ; then echo COMPILING $*.F WITHOUT OMP ; fi ; \
          $(FC) -c $(PROMOTION) $(FCREDUCEDOPT) $(FCBASEOPTS) $(MODULE_DIRS) $(FCSUFFIX) $*.f90 ; \
        fi

# compile without OMP
input_wrf.o \
module_domain.o \
module_domain_type.o \
module_physics_init.o \
module_io.o \
wrf_bdyin.o \
wrf_bdyout.o \
wrf_ext_read_field.o \
wrf_ext_write_field.o \
wrf_histin.o \
wrf_histout.o \
wrf_inputin.o \
wrf_inputout.o \
wrf_restartin.o \
wrf_restartout.o \
module_state_description.o \
module_alloc_space.o \
module_alloc_space_0.o \
module_alloc_space_1.o \
module_alloc_space_2.o \
module_alloc_space_3.o \
module_alloc_space_4.o \
module_alloc_space_5.o \
module_alloc_space_6.o \
module_alloc_space_7.o \
module_alloc_space_8.o \
module_alloc_space_9.o \
module_comm_dm.o \
module_comm_dm_0.o \
module_comm_dm_1.o \
module_comm_dm_2.o \
module_comm_dm_3.o \
module_comm_nesting_dm.o \
module_configure.o :
        $(RM) $@
        $(CPP) -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc $(CPPFLAGS) $(OMPCPP) $*.F  > $*.bb
        $(SED_FTN) $*.bb | $(CPP) $(TRADFLAG) > $*.f90
        @ if echo $(ARCHFLAGS) | $(FGREP) 'DVAR4D'; then \
          echo COMPILING $*.F for 4DVAR ; \
          $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/var/build/da_name_space.pl $*.f90 > $*.f90.tmp ; \
          mv $*.f90.tmp $*.f90 ; \
        fi
$(RM) $*.b $*.bb
        $(FC) -c $(PROMOTION) $(FCSUFFIX) $(FCNOOPT) $(FCBASEOPTS) $(MODULE_DIRS) $*.f90

haozl07

重看了一遍你的问题描述和configure.wrf，你说你用 pgi可以成功安装wrf，但安装wrf-chem时又用gfortran编译。建议你先尝试用pgi编译串行的wrf-chem，如果这步可以成功的话，再重新编译并行的，编译并行模式的时候要确保用的是mpich的并行库，而且./configure的选项得是pgi的编译器、dm的并行方式。。成功最好，不成功再说吧