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楼主: 妞胖胖

【求助】运行WRF.EXE出错,mpiexec: Segmentation fault

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发表于 2012-11-14 19:09:56 | 显示全部楼层

不太明白你的意思。
如果串行可以提交,并成功完成,那可以排除是WRF本身的问题,也就是说跟步长没关系。
你机器上MPICH2的processor manager是什么,mpd or hydra?
密码修改失败请联系微信:mofangbao
发表于 2012-11-14 19:27:38 | 显示全部楼层
climate05 发表于 2012-11-14 19:09
不太明白你的意思。
如果串行可以提交,并成功完成,那可以排除是WRF本身的问题,也就是说跟步长没关系。 ...

额。。。我不太懂这个MPICH2的processor manager,locate了一下有/usr/share/doc/lm_sensors-2.10.7/doc/busses/i2c-hydra这个东西,应该就就是你所说的hydra吧?我用你说的哪个命令提交,交不上去,最后用的是ssh  n002(进入一个节点),再mpirun -np 4 ./wrf.exe,可以继续走了,还没完,不知道会不会出错
密码修改失败请联系微信:mofangbao
发表于 2012-11-14 19:50:28 | 显示全部楼层
climate05 发表于 2012-11-12 20:16
你指的是并行提交吧?!
注意使用变量$PBS_NODEFILE就可以了,如
mpiexec -rmk pbs -launcher ssh -f $ ...

运行了半天还是出错了:mpirun noticed that process rank 0 with PID 1490 on node n001 exited on signal 11 (Segmentation fault).vi rsl.error.0000最后显示:[n001:01490] *** Process received signal ***
[n001:01490] Signal: Segmentation fault (11)
[n001:01490] Signal code: Address not mapped (1)
[n001:01490] Failing at address: 0x18
[n001:01490] *** End of error message ***
用mpiexec -rmk pbs -launcher ssh -f $PBS_NODEFILE -n $NPROCS ./wrf.exe,交不上去,显示mpiexec was unable to launch the specified application as it could not find an executable:

Executable: -rmk
Node: n001

while attempting to start process rank 0.很是无语啊!
密码修改失败请联系微信:mofangbao
发表于 2012-11-15 10:42:11 | 显示全部楼层
你ssh 到 n002上,然后执行程序,没有用作业调度来运行,这是其一;
rank0在 n001上,这说明什么呢?
我猜会不会是这样:1. 单个节点有没有4个procs?看一下你的./wrf.exe进程
                           2. 登录节点是n001,运行过程中,由于没有使用作业调度系统,或者其他什么原因,你的连接被断掉或者进程被杀死,导致程序结束。

总之,不建议你这样的执行方式,只会使问题变复杂。
mpirun -version
把信息贴上来。
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发表于 2013-9-21 21:53:21 | 显示全部楼层
楼主解决了嘛?我也遇到一样的问题
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发表于 2014-11-28 16:30:30 | 显示全部楼层
初学者关注中
密码修改失败请联系微信:mofangbao
发表于 2016-1-31 23:02:58 | 显示全部楼层
请问一下用qsub怎么提交wrf.exe呢?
密码修改失败请联系微信:mofangbao
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