【求助】CESM2空转问题

策马彼岸

这个问题真的困扰了很久，想了很多办法也没有解决，求助各位大神。。

我是port之后，create_newcase成功，build虽然报了很多warning但是也显示了成功~
我按照我的服务器管理员推荐的pbs提交方法提交之后，队列里可以看到任务状态是“R”
但是cesm.log以及pbs返回的log全部为空，大小为0，也没有输出文件

求问有无大神遇到过类似问题。。。

策马彼岸

使用的是intel+impi
附管理员提供的pbs脚本，我自己做了一点微调。。

在工作目录test_case下创建作业脚本：cesm.pbs
#!/bin/bash -x
#PBS -l nodes=10:ppn=80
#PBS -j oe
#PBS -q test2
#PBS -N mytest

#define MPI PATH
INTELMPI_HOME=/opt/compiler/intel2018u4/compilers_and_libraries_2018.5.274/linux/mpi/intel64

# Setup the OpenMPI topology
n_proc=$(cat $PBS_NODEFILE | wc -l)
cd $PBS_O_WORKDIR

/usr/bin/awk '{a[$1]++}b[$1,$2]!=1{b[$1]++}{b[$1,$2]=1}END{for (i in a)print i":"a}' $PBS_NODEFILE > mpd.hosts

ulimit -s unlimited

qsub -q test2 -l walltime=3000:00:00 -A account -v ARGS_FOR_SCRIPT='--resubmit' .case.run
qsub -q test2 -l nodes=10:ppn=80 -A account -v ARGS_FOR_SCRIPT='--resubmit' .case.run

$INTELMPI_HOME/bin/mpirun -np $n_proc $PBS_O_WORKDIR/bld/cesm.exe >> cesm.log 2>&1

exit 0
3)        投递作业：
qsub cesm.pbs -l nodes=10:ppn=80 -q test2 -N test

冰心盎然

请问楼主问题解决了吗？怎么解决的？

策马彼岸

冰心盎然 发表于 2020-12-22 20:32
请问楼主问题解决了吗？怎么解决的？

我笨到家了，后来发现是提交问题，根本没提交上去。。

yiyaya

楼主，您好！我现在使用CESM也出现了空转，作业一直显示R  但是只有一个cesm.log文件（并且为空）没有其它log文件,我没有修改config_batch.xml文件，也没有写自己提交作业的脚本，请问您是如判断作业有没有提交上的，我已经正常运行 B1850 f19_g17,但是当我将分辨率换成f09_g17就出现了这种情况

策马彼岸

yiyaya 发表于 2022-1-8 18:25
楼主，您好！我现在使用CESM也出现了空转，作业一直显示R  但是只有一个cesm.log文件（并且为空）没有其它l ...

您好，我有点记不清了，因为用的是学校服务器，后来好像是通过机时之类的发现的没成功提交，复查log文件确定的。

Akihabara

yiyaya 发表于 2022-1-8 18:25
楼主，您好！我现在使用CESM也出现了空转，作业一直显示R  但是只有一个cesm.log文件（并且为空）没有其它l ...

您好 请问后来问题解决了吗 我也遇到了这个情况