（分享）Fathom Toolbox for Matlab 用于环境变量统计分析工具集

smmd

声明:　源程序版板所有　Jones, D. L. 2002. Users manual for FATHOM: a MATLAB toolbox for Multivariate Ecological & Oceanographic Data Analysis.
本工具集（toolbox)偏重于生态与海洋科学，但是排序与统计方法是通用的。
在寻找matlab的RDA、CCA、DCA工具包时发现的，但是在国内的搜索结果中好像没有，下载网址也被墙了（why?)。
因为是免费share的工具包，我就上传上来供同我一样在寻找合适的matlab自然科学统计分析工具包的网友们共享。



主要分析方法包括:         
        - Dissimilarity Profile Analysis (= Similarity Profile        Analysis, SIMPROF)         
        - Canonical Analysis of Principal Coordinates (CAP)         
        - Nonparametric MANOVA (NP-MANOVA, perManova )         
        - Nonparametric Homogeneity of Multivariate Dispersion        (NP-DISP)         
        - Redundancy Analysis (RDA)         
        - Distance-based RDA (db-RDA)         
        - Canonical Discriminant Analysis (CDA)         
        - Principal Coordinates Analysis (PCoA)         
        - Canonical Correlation Analysis (CCorA)         
        - Nonlinear CAP (NCAP)         
        - Principal Coordinates of Neighbor Matrices (PCNM)         
        - Moran's Eigenvector Maps (MEM)         
        - Multivariate Mantel Correlograms         
        - Analysis of Similarity (ANOSIM)         
        - Similarity Percentages Analysis (SIMPER)         
        - Best Subsets Analysis (BIOENV, BEST)         
        - Maximum Likelihood Estimation (MLE)         
        - Random Forests (RF)         
        - Bootstrap Resampling & Randomization Tests         
        - Mantel Tests         
        - Procrustes Analysis         
        - Minimum Spanning Trees (MST)         
        - Principal Components Analysis (PCA)         
        - Multiple Regression         
        - Permutation-based Analysis of Covariance (ANCOVA)         
        - von Bertalanffy Growth Modelling         
        - AIC or BIC based stepwise variable selection in RDA and        db-RDA         
        - Species Indicator Values (IndVal)         
        - Oceanographic tools (progressive vector diagrams, vector        plots, etc.)         
        - and much more...         

        同时可以计算超过50种生态距离或相似性参数:Average        distance         
        Bray-Curtis dissimilarity         
        Binomial deviance dissimilarity         
        Canberra dissimilarity         
        Chi-square distance         
        Chao's abundance-based Jaccard dissimilarity         
        Chao's abundance-based Sorensen dissimilarity         
        Orloci's Chord distance         
        Coefficient of Divergence         
        Pearson Correlation dissimilarity         
        Spearman Rank Correlation dissimilarity         
        Chao's dissimilarity for count data         
        Czekanowski distance         
        Euclidean distance         
        Euclidean similarity         
        Geodesic metric         
        Gower's metric         
        Hellinger dissimilarity         
        Whittaker's Index of Association dissimilarity         
        Jaccard dissimilarity         
        Kulczynski quantitative dissimilarity         
        Manhattan (City-block) metric         
        Minkowski's metric         
        Morisita's Index of Overlap for count data         
        Morisita-Horn dissimilarity         
        Ochiai quantitative dissimilarity         
        Sorensen's dissimilarity         
        Watson's nonmetric coefficient dissimilarity         
        Simple Matching dissimilarity         
        Rogers & Tanimoto dissimilarity         
        Sokal & Sneath dissimilarity         
        Jaccard dissimilarity variant         
        Russel & Rao dissimilarity         
        Binary Kulczynski dissimilarity         
        Binary Ochiai dissimilarity         
        Faith dissimilarity         
        Species Profiles distance         


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2016-8-4 14:55 上传

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随缘

卖5贡献也忒贵了吧
而且是可以访问下载的
http://www.marine.usf.edu/user/djones/matlab/matlab.html

smmd

随缘 发表于 2016-8-4 15:31
卖5贡献也忒贵了吧
而且是可以访问下载的
http://www.marine.usf.edu/user/djones/matlab/matlab.html

新手，缺钱呀。