Python显著性检验求助

一大碗年糕

关于python的显著性检验常用是两种方法：一是用contourf结合hatch填充，二是利用scatter。使用的过程中一直有两个小问题，请教家园的大佬们：
一：contourf经常会出现显著区域打点边缘被截断的问题导致不够美观，类似https://stackoverflow.com/questi ... f-truncated-circles这个问题里一样，不知道大家是否也是这样用，还是有好解决方法？
二：关于散点图打点如果涉及分辨率不均匀，打出来的点就会很难看，这时候是应该先把点插值成均匀分辨率再来打点？

werid

contourf结合hatch填充能不能控制打点的密度？？？

Sigmas

1. import numpy as np
   
2. import matplotlib.pyplot as plt
   
3. 
   
4. n = 20
   
5. sig = np.ma.masked_greater(np.random.rand(n, n), 0.25)
   
6. 
   
7. f, ax1 = plt.subplots(1, 1, figsize=(4, 4))
   
8. 
   
9. # Find indices of non-masked elements
   
10. y, x = np.where(~sig.mask)
    
11. 
    
12. # Plot circles using scatter
    
13. ax1.scatter(x, y, s=100, facecolors='none', edgecolors='black', linewidth=1)
    
14. 
    
15. # Invert the y-axis to match pcolor orientation
    
16. ax1.invert_yaxis()
    
17. 
    
18. # Set x and y axis limits
    
19. ax1.set_xlim(-0.5, n - 0.5)
    
20. ax1.set_ylim(-0.5, n - 0.5)
    
21. 
    
22. # Show the grid lines in specified color
    
23. # ax1.grid(True, linewidth=0.5, color="black")
    
24. 
    
25. # Set x and y ticks
    
26. ax1.set_xticks(np.arange(0, n, 1))
    
27. ax1.set_yticks(np.arange(0, n, 1))
    
28. 
    
29. plt.show()

import numpy as np<br /> import matplotlib.pyplot as plt<br /> <br /> n = 20<br /> sig = np.ma.masked_greater(np.random.rand(n, n), 0.25)<br /> <br /> f, ax1 = plt.subplots(1, 1, figsize=(4, 4))<br /> <br /> # Find indices of non-masked elements<br /> y, x = np.where(~sig.mask)<br /> <br /> # Plot circles using scatter<br /> ax1.scatter(x, y, s=100, facecolors='none', edgecolors='black', linewidth=1)<br /> <br /> # Invert the y-axis to match pcolor orientation<br /> ax1.invert_yaxis()<br /> <br /> # Set x and y axis limits<br /> ax1.set_xlim(-0.5, n - 0.5)<br /> ax1.set_ylim(-0.5, n - 0.5)<br /> <br /> # Show the grid lines in specified color<br /> # ax1.grid(True, linewidth=0.5, color="black")<br /> <br /> # Set x and y ticks<br /> ax1.set_xticks(np.arange(0, n, 1))<br /> ax1.set_yticks(np.arange(0, n, 1))<br /> <br /> plt.show()

这样可能能解决问题

Sigmas

Sigmas 发表于 2023-3-26 18:30
这样可能能解决问题

我以Stack Overflow上的代码为例做得修改，为了保持图片一致性，我把坐标轴网格注释掉了，需要的话把注释删掉就可以

忘忧草不忘忧

多变量的话画个heatmap就行了吧，双变量的话我用的是scipy的pearsonr

chch123456

werid 发表于 2023-3-26 16:43
contourf结合hatch填充能不能控制打点的密度？？？

这个你可以改写hatches点的个数，密一点就三个点以上，稀疏一点就一个或两个点。另外，scatter应该也能控制打点的密集度

逢驿使

有没有朋友遇到过这个问题：contourf hatches 打点 的矢量图，放入word再导出pdf后，打点会变成马赛克。而scatter就不会。

逢驿使

chch123456 发表于 2024-6-11 15:44
这个你可以改写hatches点的个数，密一点就三个点以上，稀疏一点就一个或两个点。另外，scatter应该也能控 ...

scatter本身并不能控制打点的密度，可以通过增加步长(e.g., a[::step,::step])，间接调整散点的密度。

grt

请问贴主做过垂直剖面图的显著性检验吗？具体应该怎样操作呀

Iree_Aurora

请问hatch能不能控制打点的大小