【已解决】real.exe运行出错

lqouc

好吧，这个问题在同学的帮助下已经解决了，在这简单说一下，希望对一些朋友能有帮助。
我用的是3.5.1的wrf，其中包含化学版本chem。在编译wrf的时候需要先将环境变量改一下，这个在官网的手册上有，修改之后将解压的chem复制到wrf文件夹下，再进行编译就可以了。步骤可以参照兰溪的指南来操作。

至于我的mpi的问题，其实我的服务器是安装了openmpi的，不是我安的，我也不会。如果使用这个的话configure选择dm的，然后还需要在一开始的configure.wrf里面修改一下。这样就可以用mpirun了。要说serial也可以的，但是貌似有点浪费服务器了，而且据同学说速度差很多，有条件的同学可以尝试。

嗯，我知道的就这样了，有问题的话别问我，我什么都不知道，我是大菜鸟。
最后感谢对本帖回复的热心同学。


运行real.exe的时候出现了如下错误：
[pub@tornado em_real]$ ./real.exe
starting wrf task             0  of             1
[tornado:26600] *** An error occurred in MPI_Bcast
[tornado:26600] *** on communicator MPI_COMM_WORLD
[tornado:26600] *** MPI_ERR_COMM: invalid communicator
[tornado:26600] *** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (your MPI job will now abort)
查看rsl.error.0000发现如下记录：
taskid: 0 hostname: tornado
Namelist logging not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in logging.
Namelist dfi_control not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in dfi_control
Namelist tc not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in tc
Namelist noah_mp not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in noah_mp
Namelist scm not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in scm
Namelist fire not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in fire
Namelist diags not found in namelist.input. Using registry defaults for variables in diags
在论坛看过一些类似的错误，但是貌似解决不了我的问题。
下面是我的namelist.input
&time_control
run_days                            = 0,
run_hours                           = 06,
run_minutes                         = 0,
run_seconds                         = 0,
start_year                          = 2006, 2006, 2006,
start_month                         = 08,   08,   08,
start_day                           = 16,   16,   16,
start_hour                          = 12,   12,   12,
start_minute                        = 00,   00,   00,
start_second                        = 00,   00,   00,
end_year                            = 2006, 2006, 2006,
end_month                           = 08,   08,   08,
end_day                             = 16,   16,   16,
end_hour                            = 18,   18,   18,
end_minute                          = 00,   00,   00,
end_second                          = 00,   00,   00,
interval_seconds                    = 21600
input_from_file                     = .true.,.false.,.false.,
fine_input_stream                   = 0,    0,    0,
history_interval                    = 180,  60,   60,
frames_per_outfile                  = 1000, 1000, 1000,
restart                             = .false.,
restart_interval                    = 5000,
io_form_history                     = 2
io_form_restart                     = 2
io_form_input                       = 2
io_form_boundary                    = 2
debug_level                         = 0
/
&domains
time_step                           = 180,
time_step_fract_num                 = 0,
time_step_fract_den                 = 1,
max_dom                             = 2,
s_we                                = 1,     1,     1,
e_we                                = 74,    112,   94,
s_sn                                = 1,     1,     1,
e_sn                                = 61,    97,    91,
s_vert                              = 1,     1,     1,
e_vert                              = 28,    28,    28,
p_top_requested                     = 5000,
num_metgrid_levels                  = 27,
num_metgrid_soil_levels             = 4,
dx                                  = 30000, 10000,  3333.33,
dy                                  = 30000, 10000,  3333.33,
grid_id                             = 1,     2,     3,
parent_id                           = 0,     1,     2,
i_parent_start                      = 1,     31,    30,
j_parent_start                      = 1,     17,    30,
parent_grid_ratio                   = 1,     3,     3,
parent_time_step_ratio              = 1,     3,     3,
feedback                            = 1,
smooth_option                       = 0
/
&physics
mp_physics                          = 3,     3,     3,
ra_lw_physics                       = 1,     1,     1,
ra_sw_physics                       = 1,     1,     1,
radt                                = 30,    30,    30,
sf_sfclay_physics                   = 1,     1,     1,
sf_surface_physics                  = 2,     2,     2,
bl_pbl_physics                      = 1,     1,     1,
bldt                                = 0,     0,     0,
cu_physics                          = 1,     1,     0,
cudt                                = 5,     5,     5,
isfflx                              = 1,
ifsnow                              = 1,
icloud                              = 1,
surface_input_source                = 1,
num_soil_layers                     = 4,
sf_urban_physics                    = 0,     0,     0,
/
&fdda
/
&dynamics
w_damping                           = 0,
diff_opt                            = 1,
km_opt                              = 4,
diff_6th_opt                        = 0,      0,      0,
diff_6th_factor                     = 0.12,   0.12,   0.12,
base_temp                           = 290.
damp_opt                            = 0,
zdamp                               = 5000.,  5000.,  5000.,
dampcoef                            = 0.2,    0.2,    0.2
khdif                               = 0,      0,      0,
kvdif                               = 0,      0,      0,
non_hydrostatic                     = .true., .true., .true.,
moist_adv_opt                       = 1,      1,      1,     
scalar_adv_opt                      = 1,      1,      1,     
/
&bdy_control
spec_bdy_width                      = 5,
spec_zone                           = 1,
relax_zone                          = 4,
specified                           = .true., .false.,.false.,
nested                              = .false., .true., .true.,
/
&grib2
/
&namelist_quilt
nio_tasks_per_group = 0,
nio_groups = 1,
/
至于wps是怎么运行出来的，还有怎么设置的其实我也不大清楚，就是摸索着混混噩噩的弄到这一步了。
求喷求指导。

补充一个namelist.wps
&share
wrf_core = 'ARW',
max_dom = 2,
start_date = '2006-08-16_12:00:00','2006-08-16_12:00:00',
end_date   = '2006-08-16_18:00:00','2006-08-16_12:00:00',
interval_seconds = 21600
io_form_geogrid = 2,
/
&geogrid
parent_id         =   1,   1,
parent_grid_ratio =   1,   3,
i_parent_start    =   1,  31,
j_parent_start    =   1,  17,
e_we              =  74, 112,
e_sn              =  61,  97,
geog_data_res     = '10m','2m',
dx = 30000,
dy = 30000,
map_proj = 'lambert',
ref_lat   =  34.83,
ref_lon   = -81.03,
truelat1  =  30.0,
truelat2  =  60.0,
stand_lon = -98.0,
geog_data_path = '/home/pub/wrf/WPS/WPS_GEOG/geog'
/
&ungrib
out_format = 'WPS',
prefix = 'FILE',
/
&metgrid
fg_name = 'FILE'
io_form_metgrid = 2,
/

lsd1984

input_from_file                     = .true.,.false.,.false.,
而max_dom                             = 2,
这是冲突的，两层网格的话，应该是两个.true.

寄居蟹

MPI安装没？还有，要仔细检查下namelist.input和namelist.wps要保持一致

lqouc

lsd1984 发表于 2013-7-1 17:08

                               
登录/注册后可看大图

input_from_file                     = .true.,.false.,.false.,
而max_dom                             ...

多谢！
改成都是true，也不对，还是一样的报错。

lqouc

寄居蟹 发表于 2013-7-1 17:20

                               
登录/注册后可看大图

MPI安装没？还有，要仔细检查下namelist.input和namelist.wps要保持一致

多谢，不过MPI是个啥啊？怎么知道有没有安装？
namelist.wps和namelist.input应该是一样的啊，就是时间什么的吧。我也贴出来好了。

Rplay

lqouc 发表于 2013-7-1 17:51

                               
登录/注册后可看大图

多谢，不过MPI是个啥啊？怎么知道有没有安装？
namelist.wps和namelist.input应该是一样的啊，就是时间什 ...

你是单机运行WRF吗？我觉得你在WRF安装的时候选得可能是并行，实在不行你可以尝试重装，记得选serial

lqouc

Rplay 发表于 2013-7-1 18:27

                               
登录/注册后可看大图

你是单机运行WRF吗？我觉得你在WRF安装的时候选得可能是并行，实在不行你可以尝试重装，记得选serial

多谢~
是在服务器上运行的，当时configure选的啥不记得了......

lsd1984

lqouc 发表于 2013-7-1 17:49

                               
登录/注册后可看大图

多谢！
改成都是true，也不对，还是一样的报错。

max_dom=2，两个true，max_dom=3，3个true.
mpi像是并行的程序，不知道你有没有安装mpich2

liutaoz21

前来学习~~~顶一下

lqouc

lsd1984 发表于 2013-7-1 22:40

                               
登录/注册后可看大图

max_dom=2，两个true，max_dom=3，3个true.
mpi像是并行的程序，不知道你有没有安装mpich2

额，我说的有问题，确实是两个ture。但还是上面的报错。
which了一下，貌似没有发现mpi。很奇怪啊。
不过一直有别的人在这个服务器上跑wrf，为啥我这里就出问题呢。