安装WRFchem是KPP要不要加载

Sharon

如题，安装chem模块在设置环境变量时，WRF_KPP=1要不要给？手册上说是可选，不知实际应用中是否需要呢？新手不是很清楚状况，求教~

guyefu

一般给的话比较好，但配置环境的时候可能要细心点，kpp需要的lib很多，麻烦。

kpp是一个前处理模块，负责从input file里面读取反应方程到chem模块里面去。好处就是不用自己写code来表现这些mechanism.

kpp支持大部分常用的化学机制，如CB05,CBMZ。但不支持单独的气溶胶机制，比如gocart(跟气体机制coupled的不算)。

reference
Damian, V., et al. (2002), The kinetic preprocessor KPP - a software environment for solving chemical
kinetics, Comput. Chem. Eng., 26(11), 1567-1579.

Sandu, A., and R. Sander (2006), Technical note: Simulating chemical systems in Fortran90 and Matlab with the Kinetic PreProcessor KPP-2.1, Atmos. Chem. Phys., 6, 187-195.

Verwer, J., Spee, E., Blom, J. G., and Hunsdorfer, W. (1999), A second order Rosenbrock method applied to photochemical dispersion problems, SIAM Journal on Scientific Computing, 20, 1456–1480.

Sharon

guyefu 发表于 2015-4-13 23:41
一般给的话比较好，但配置环境的时候可能要细心点，kpp需要的lib很多，麻烦。

kpp是一个前处理模块，负 ...

好的，谢谢指导！

yangyangyang

请教一下，wrf chem安装的具体步骤，我按照官网配置环境变量，最后编译的log里面还有很多error。求助您是怎么解决的啊

Sharon

yangyangyang 发表于 2015-5-3 18:14
请教一下，wrf chem安装的具体步骤，我按照官网配置环境变量，最后编译的log里面还有很多error。求助您是怎 ...

请问您是在自己机器上安装，还是在服务器上安装呢？不同的机器配置方法大概略有差异，建议您根据自己机器的情况配置。如果是在服务器上，建议请相关工程师帮忙。我是新手，对这方面也不是很懂。

xyan88

请问kpp是从哪里来到啊

xyan88

请问kpp是从哪里来的啊

893116547

guyefu 发表于 2015-4-13 23:41
一般给的话比较好，但配置环境的时候可能要细心点，kpp需要的lib很多，麻烦。

kpp是一个前处理模块，负 ...

这都能看到你。。。

hegc100

9.编译KPP
9.1 编译flex
http://www.ncl.ucar.edu/Download/files/flex.tar.gz
tar -xzf flex.tar.gz
cd flex-2.5.3
./configure --prefix=/vol-th/home/zhangh/WRFCHEM36/flex-2.5.3
make
make install
9.2 编译bison
http://ftp.gnu.org/gnu/bison/
下载bison-1.25.tar.gz
tar xf bison-1.25
./configure --prefix=/vol-th/home/zhangh/WRFCHEM36/bison-1.25
make
make install


10 设置CHEM环境变量
export EM_CORE=1
export NMM_CORE=0
export WRF_CHEM=1
export WRF_KPP=1

export PATH=/vol-th/home/zhangh/WRFCHEM36/bison-1.25:$PATH
export YACC="/vol-th/home/zhangh/WRFCHEM36/bison-1.25/bison -d -o y.tab.c "

export PATH=/vol-th/home/zhangh/WRFCHEM36/flex-2.5.3/bin:$PATH
export FLEX=/vol-th/home/zhangh/WRFCHEM36/flex-2.5.3/bin/flex
export FLEX_LIB_DIR=/vol-th/home/zhangh/WRFCHEM36/flex-2.5.3/lib

可能出现的错误：
1.No such file or directory
由于clean -a ,删除文件；重新解压新文件，不使用clean -a 命令。
2.缺失y.tab.c。
修改YACC目录，export YACC="/vol-th/home/zhangh/WRFCHEM36/bison-1.25/bison -d -o y.tab.c "
3.报undefined reference to `__kmpc_global_thread_num'的错。使用DM+SM并行编译WRF时。
修改configure.wrf
WRF_LIB 添加iomp5库
            在lnetcdff -lnetcdf 后加 -L/vol-th/intel_composer_xe_2013.0.079_lib -liomp5

asimonsimon

hegc100 发表于 2018-4-7 21:52
9.编译KPP
9.1 编译flex
http://www.ncl.ucar.edu/Download/files/flex.tar.gz

请问你确定bison也可以用吗？因为我看很多都是使用的伯克利的yacc，我在mac上装伯克利的yacc装不上。