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wrf.exe中断(segment fault),未有明确错误,但仅生成一个时刻的wrfout

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新浪微博达人勋

发表于 2020-12-21 22:47:13 | 显示全部楼层 |阅读模式
10金钱
1、问题描述
mpirun -np 32 ./wrf.exe莫名中断(segment fault),未有明确错误,但仅生成一个时刻的wrfout,wrfchem小白,请大神指点!!
2、rsl.error.0000文件
taskid: 0 hostname: c3
module_io_quilt_old.F        2931 F
Quilting with   1 groups of   0 I/O tasks.
Ntasks in X            4, ntasks in Y            8
--- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
Need MYNN PBL for icloud_bl = 1, resetting to 0
*************************************
No physics suite selected.
Physics options will be used directly from the namelist.
*************************************
--- NOTE: RRTMG radiation is in use, setting:  levsiz=59, alevsiz=12, no_src_types=6
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
WRF V3.9.1 MODEL
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            1         330           1         330
ims,ime,jms,jme           -4          90          -4          49
ips,ipe,jps,jpe            1          83           1          42
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1,              556291212 bytes allocated
  med_initialdata_input: calling input_input
Timing for processing wrfinput file (stream 0) for domain        1:    3.08272 elapsed seconds
Max map factor in domain 1 =  1.02. Scale the dt in the model accordingly.
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33 CATEGORIES           2 SEASONS WATER CATEGORY =           17 SNOW CATEGORY =           15
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20 CATEGORIES
INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19 CATEGORIES
*********************************************************************
*             PROGRAM:WRF-Chem V3.9.1 MODEL
*                                                                   *
*    PLEASE REPORT ANY BUGS TO WRF-Chem HELP at                     *
*                                                                   *
*              wrfchemhelp.gsd@noaa.gov                             *
*                                                                   *
*********************************************************************
  call madronich phot initialization
Timing for Writing wrfout_d01_2013-04-13_00:00:00 for domain        1:   12.52047 elapsed seconds
mediation_integrate: med_read_wrf_chem_emissions: Open file wrfchemi_00z_d01
HOURLY EMISSIONS UPDATE TIME        0.0       0.0
mediation_integrate: med_read_wrf_chem_emissions: Read emissions for time 2013-04-13_00:00:00
Timing for processing lateral boundary for domain        1:    0.55314 elapsed seconds


3、namelist.input文件
&time_control
run_days                            = 0,
run_hours                           = 96,
run_minutes                         = 0,
run_seconds                         = 0,
start_year                          = 2013, 2000, 2000,
start_month                         = 04,   01,   01,
start_day                           = 13,   24,   24,
start_hour                          = 00,   12,   12,
start_minute                        = 00,   00,   00,
start_second                        = 00,   00,   00,
end_year                            = 2013, 2000, 2000,
end_month                           = 04,   01,   01,
end_day                             = 16,   25,   25,
end_hour                            = 18,   12,   12,
end_minute                          = 00,   00,   00,
end_second                          = 00,   00,   00,
interval_seconds                    = 21600
input_from_file                     = .true.,.true.,.true.,
history_interval                    = 60,  60,   60,
frames_per_outfile                  = 1000, 1000, 1000,
restart                             = .false.,
restart_interval                    = 5000,
io_form_history                     = 2
io_form_restart                     = 2
io_form_input                       = 2
io_form_boundary                    = 2
debug_level                         = 0
/


&domains
time_step                           = 9,
time_step_fract_num                 = 0,
time_step_fract_den                 = 1,
max_dom                             = 1,
e_we                                = 330,    112,   94,
e_sn                                = 330,    97,    91,
e_vert                              = 30,    30,    30,
p_top_requested                     = 5000,
num_metgrid_levels                  = 27,
num_metgrid_soil_levels             = 4,
dx                                  = 3000, 10000,  3333.33,
dy                                  = 3000, 10000,  3333.33,
grid_id                             = 1,     2,     3,
parent_id                           = 0,     1,     2,
i_parent_start                      = 1,     31,    30,
j_parent_start                      = 1,     17,    30,
parent_grid_ratio                   = 1,     3,     3,
parent_time_step_ratio              = 1,     3,     3,
feedback                            = 1,
smooth_option                       = 0
/


&physics
mp_physics                          = 4,     4,     4,
ra_lw_physics                       = 4,     4,     4,
ra_sw_physics                       = 4,     4,     4,
radt                                = 30,    30,    30,
sf_sfclay_physics                   = 2,     2,     2,
sf_surface_physics                  = 2,     2,     2,
bl_pbl_physics                      = 2,     2,     2,
bldt                                = 0,     0,     0,
cu_physics                          = 0,     0,     0,
cudt                                = 5,     5,     5,
isfflx                              = 1,
ifsnow                              = 1,
icloud                              = 1,
surface_input_source                = 1,
num_soil_layers                     = 4,
num_land_cat                        = 20,
sf_urban_physics                    = 0,     0,     2,
/


&fdda
/


&dynamics
w_damping                           = 1,
diff_opt                            = 1,      1,      1,
km_opt                              = 4,      4,      4,
diff_6th_opt                        = 0,      0,      0,
diff_6th_factor                     = 0.12,   0.12,   0.12,
base_temp                           = 290.
damp_opt                            = 0,
zdamp                               = 5000.,  5000.,  5000.,
dampcoef                            = 0.2,    0.2,    0.2
khdif                               = 0,      0,      0,
kvdif                               = 0,      0,      0,
non_hydrostatic                     = .true., .true., .true.,
moist_adv_opt                       = 1,      1,      1,
scalar_adv_opt                      = 1,      1,      1,
/


&bdy_control
spec_bdy_width                      = 5,
spec_zone                           = 1,
relax_zone                          = 4,
specified                           = .true., .false.,.false.,
nested                              = .false., .true., .true.,
/


&grib2
/


&chem
kemit                               = 10,
chem_opt                            = 2,        2,    2,
bioemdt                             = 60,       60,   10,
photdt                              = 30,       30,   30,
chemdt                              = 1.5,      0.5,   0.2,
io_style_emissions                  = 1,
emiss_inpt_opt                      = 1,        1,  1,
emiss_opt                           = 3,        3,  3,
chem_in_opt                         = 0,  0,    0,
phot_opt                            = 1,        1,   1,
gas_drydep_opt                      = 1,        1,  1,
aer_drydep_opt                      = 1,        1, 1,
bio_emiss_opt                       = 1,       0,  0,
ne_area                             = 200,
dust_opt                            = 0,

dmsemis_opt                         = 0,
seas_opt                            = 0,
gas_bc_opt                          = 1,        1,  1,
gas_ic_opt                          = 1,        1,  1,
aer_bc_opt                          = 1,        1,  1,
aer_ic_opt                          = 1,        1,  1,
gaschem_onoff                       = 1,        1,  1,
aerchem_onoff                       = 1,        1,  1,
wetscav_onoff                       = 0,        0,  0,
cldchem_onoff                       = 0,        0,  0,
vertmix_onoff                       = 1,        1,  1,
chem_conv_tr                        = 0,        0,  0,
conv_tr_wetscav                     = 1,        1,  1,
conv_tr_aqchem                      = 1,        1,  1,
biomass_burn_opt                    = 0,        0,  0,
plumerisefire_frq                   = 30,       30, 30,
aer_ra_feedback                     = 0,        0,  0,
aer_op_opt                          = 1,
opt_pars_out                        = 0,
have_bcs_chem                       = .false., .false., .false.
/


&namelist_quilt
nio_tasks_per_group = 0,
nio_groups = 1,
/


4、namelist.wps文件

&share
wrf_core = 'ARW',
max_dom = 1,
start_date = '2013-04-13_00:00:00','2006-08-16_12:00:00',
end_date   = '2013-04-16_18:00:00','2006-08-16_12:00:00',
interval_seconds = 21600
io_form_geogrid = 2,
/

&geogrid
parent_id         =   1,   1,
parent_grid_ratio =   1,   3,
i_parent_start    =   1,  31,
j_parent_start    =   1,  17,
e_we              =  330, 112,
e_sn              =  330,  97,
!
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! IMPORTANT NOTE !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
! The default datasets used to produce the HGT_M, GREENFRAC,
! and LU_INDEX/LANDUSEF fields have changed in WPS v3.8. The HGT_M field
! is now interpolated from 30-arc-second USGS GMTED2010, the GREENFRAC
! field is interpolated from MODIS FPAR, and the LU_INDEX/LANDUSEF fields
! are interpolated from 21-class MODIS.
!
! To match the output given by the default namelist.wps in WPS v3.7.1,
! the following setting for geog_data_res may be used:
!
! geog_data_res = 'gtopo_10m+usgs_10m+nesdis_greenfrac+10m','gtopo_2m+usgs_2m+nesdis_greenfrac+2m',
!
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! IMPORTANT NOTE !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
!
geog_data_res = 'modis_30s+30s','default',
dx = 3000,
dy = 3000,
map_proj = 'lambert',
ref_lat   =  30.83,
ref_lon   =  120.3,
truelat1  =  30.0,
truelat2  =  60.0,
stand_lon =  120.3,
geog_data_path = '/share/home/changly/GEOG/geog/'
/

&ungrib
out_format = 'WPS',
prefix = 'FILE',
/

&metgrid
fg_name = 'FILE'
io_form_metgrid = 2,
/


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新浪微博达人勋

发表于 2020-12-22 10:04:24 | 显示全部楼层
相同问题,等一手答案
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新浪微博达人勋

发表于 2020-12-23 18:13:40 来自手机 | 显示全部楼层

                               
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新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2020-12-25 14:39:29 | 显示全部楼层
已解决,是安装问题
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新浪微博达人勋

发表于 2020-12-28 09:25:20 | 显示全部楼层
快乐的鱼 发表于 2020-12-25 14:39
已解决,是安装问题

好奇楼主怎么解决的?
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新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2021-1-3 11:12:09 | 显示全部楼层

我之前很多软件都是用的服务器现成的,没有与wrf用统一的编译方式,后来是对所需软件全部重新安装,统一编译,问题就没了
密码修改失败请联系微信:mofangbao
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