在服务器中安装cdo的建议和步骤

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1.首先，在安装cdo的过程中会遇到环境的编译。大家都会认为学校服务器中已经安装好了netcdf、zlib、hdf5等一些环境，所以说直接用安装好的环境。
但是在大部分情况下，学校安装好的环境是没有自己链接的权力的，在编译cdo的时候你会发现，报错连接不到这些环境或者库，所以需要自己进行安
装库和环境。
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2.安装cdo需要的库和环境
一定要注意先安装好环境和库以后再安装cdo。
（1）在你想要安装的地方新建一个文件，比如我就在/home/liuyh2023路径下新建了一个anaconda3文件，目的是为了所需要的库和环境安装到这个文件
里面。
（2）先安装zlib，从官网将zlib的压缩包下载下来，我下载的是zlib-1.2.8的版本。
tar -xzvf zlib-1.2.8.tar.gz
cd zlib-1.2.8
./configure --prefix=/home/liuyh2023/anaconda3
make
make check
make install
（3）安装hdf5，一样的从官网下载压缩文件
tar -xzvf hdf5-1.8.21.tar.gzcd hdf5-1.8.21./configure -with-zlib=/home/liuyh2023/anaconda3 --prefix=/home/liuyh2023/anaconda3 CFLAGS=-fPICmakemake checkmake install
（4）安装net-cdf
netcdf在4.2版本以上就必须要用netcdf-c和netcdf-fortran两个一起安装，因为他们分开了，并且，要先安装netcdf-c，再安装
netcdf-fortran。
   <4.1>先安装netcdf-c，从官网找到对应的版本，这里要注意一下netcdf-c和netcdf-fortran两个之间版本匹配的问题。我先开始两个都是
安装的4.6.0版本的，但是再安装的过程中才发现，如果netcdf-fortran版本是4.6.0的话，那么netcdf-c需要4.7.2以上的版本，所以我又去下载了
netcdf-c-4.9.2的版本。下载好压缩包后，进行编译和安装
tar -xzvf netcdf-c-4.9.2.tar.gz
cd netcdf-c-4.9.2
CPPFLAGS=-I/home/liuyh2023/anaconda3/include LDFLAGS=-L/home/liuyh2023/anaconda3/lib ./configure --prefix=/home/liuyh2023/anaconda3 --disable-dap(这是一行)make
make check
make install
<4.2>安装netcdf-fortrn
下载好netcdf-fortran-4.6.0的压缩包
tar -xzvf netcdf-fortran-4.6.0.tar.gz
cd netcdf-fortran-4.9.2
CPPFLAGS=-I/home/liuyh2023/anaconda3/include LD_LIBRARY_PATH=/home/liuyh2023/anaconda3/lib:${LD_LIBRARY_PATH} LDFLAGS=-L/home/liuyh2023/anaconda3/lib ./configure --prefix=/home/liuyh2023/anaconda3
make
make check（这里在检查的过程中好像有点儿问题和报错，但是我没管，目前没发现有什么影响）
make install
（5）安装jasper
从官网下载压缩包
unzip jasper-1.900.1.zip
cd jasper-1.900.1
./configure --prefix=/home/liuyh2023/anaconda3 CFLAGS=-fPIC
make
make check
make install
以上所需要的环境和库都装好了

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3.安装cdo
下载cdo的压缩包，要注意版本匹配，这个东西就是多试几次就知道了
我的服务器下（兰州大学）只支持cdo1.9.10左右的
我下载了cdo-1.9.8的版本
tar -xvzf cdo-1.9.8.tar.gzcd cdo-1.9.8./configure --prefix=/home/liuyh2023/anaconda3 CFLAGS=-fPIC -with-netcdf=/home/liuyh2023/anaconda3 -with-jasper=/home/liuyh2023/anaconda3 -with-hdf5=/home/liuyh2023/anaconda3
makemake checkmake install
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最后，进入你的环境变量配置系统，vim~/.bashrc。
然后在里面添加环境变量即可。export PATH=/home/liuyh2023/anaconda3/bin:$PATH
这样就安装好了，也可以用了。

ljchen1989

conda install -c conda-forge cdo

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ljchen1989 发表于 2024-6-20 23:59
conda install -c conda-forge cdo

我也一开始用的这个，可能是学校服务器的原因？conda一直进不去