WRF 3.5.1 在单机Centos上的安装

destroyer

好吧那么，我在Centos上装WRF已经一个多月了，由于各种原因上网不方便可是吃尽了苦头，看网上好多在ubuntun上装wrf的成功例子，但为作为强迫症患者一直坚持到现在终于有了一定进展 ，贴在这里给大家以借鉴也帮助自己记忆。由于我是初学者，肯定有很多错误的地方，请大家批评。
ps：这个论坛为06climate难道是06年建的？服务器在某个大学么？
好啦，言归正转：
。                             

按装环境：

硬件：Compaq 325（AMD双核）
系统：Centos 6.4
模式版本：WRF 3.5.1
编译器及软件：
gcc： version 4.4.7
gfortran： version 4.4.7
grads： grads-2.0.a9-bin-i686-pc-linux-gnu.tar.gz
ncl： ncl_ncarg-5.1.1.Linux_i686_gcc432.tar.gz
netcdf：netcdf 4.1.3
参考：
自己的WRF安装总结.doc
http://blog.wrfchina.com/node/140
http://www.51testing.com/html/76/227476-99672.html
http://www.51testing.com/html/76/227476-99672.html
一、准备工作：
1、增加rpmforge支持（好像可以增加yum库，我增加了这个命令后yum变得好用多了。）
rpm -Uhv rpmforge-release-*
来源为：http://tree.repoforge.org/redhat/其中，el6表示centos6.
另外几个库：
http://apt.sw.be/redhat/
http://pkgs.repoforge.org/
http://ftp.tsukuba.wide.ad.jp/software/gcc/

2、检查gfortran/gcc安装情况：   
rpm -qa |grep gcc
如果列出：
gcc-c++-4.4.7-3.el6.i686
libgcc-4.4.7-3.el6.i686
compat-gcc-34-g77-3.4.6-19.el6.i686
compat-gcc-34-c++-3.4.6-19.el6.i686
gcc-gfortran-4.4.7-3.el6.i686
gcc-java-4.4.7-3.el6.i686
gcc-4.4.7-3.el6.i686
compat-libgcc-296-2.96-144.el6.i686
compat-gcc-34-3.4.6-19.el6.i686
则说明已安装成功，否则可采用yum安装/或从第一章光盘Packages中寻找（gcc下载地址：http://gcc.gnu.org/mirrors.html）
命令形式：
ls compat*
rpm -ivh compat*
3、最后，查看Xlib.h，Intrinsic.h 是否安装
[guoguo@localhost ~]$ cd /usr/include/X11
[guoguo@localhost X11]$ ls

二、安装：
1、grads安装
# cd /home/guoguo/Model
# tar -zvxf grads-2.0.a9-bin-i686-pc-linux-gnu.ta
r# mv grads-2.0.a9 /usr/local
/# mv lib.tar  /usr/local/ grads-2.0.a9 (lib文件到grads官方网站下载)
# mv /usr/local/ grads-2.0.a9 /usr/local/grads（更名）
# cd /usr/local/grads
# tar -vxf lib.tar#exit                      （返回自己常用用户）
$ vi .bashrcrca ~]
# vi .bashrc     
#Set for grads
GRADS=/usr/local/grads
export GRADS
export PATH=$GRADS/bin:$PATH
export GADDIR=$GRADS/dat
export GASCRP=$GRADS/lib
$source .bashrc
2、设置gcc、gfortran环境变量
$vi ~/.bashrc
#Set for gfortran and gcc
export CC=/usr/bin/gcc
export CXX=/usr/bin/g++
export FC=/usr/bin/
gfortranexport
F90=/usr/bin/gfortran
$source .bashrc

3、安装netcdf
netcdf ftp下载站：ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/（在该网址下载4.1.3-fix.tar解压到netcdf目录中。）
$tar -zvxf netcdf-4.1.3.tar.gz
$cd  netcdf-4.1.3
$./configure --disable-dap --disable-netcdf-4 –prefix=/usr/local/netcdf（其中--disable选项为必须，否则会出现错误）
$make
$make check >& netcdf.chec.log
$make install设置环境变量：（其它版本netcdf试了三个都提示程序中变量“未命名”，估计是编译器版本问题，不再尝试）
$vi ~/.bashrc
export NETCDF=/usr/local/netcdf
export PATH=$PATH:$NETCDF/bin
export NETCDF_LIB=$NETCDF/lib
export NETCDF_INC=$NETCDF/include
export MANPATH=$NETCDF/share/man
$source ~/.bashrc
$ncdump若显示netcdf使用说明，则说明安装成功。

4、安装ncl
$tar -zvxf ncl_ncarg-5.1.1.Linux_i686_gcc432.tar.gz
$su
#mv ncl /usr/local

设置环境变量
$vi ~/.bashrc
#Set for ncl
export NCARG_ROOT=/usr/local/ncl
export NCARG_LIB=/usr/local/ncl/lib
export NCARG_INC=/usr/local/ncl/include
export PATH=/usr/local/ncl/bin:$PATH
$source ~/.bashrc
$ncl进入程序说明安装成功
试验ncl：ng4ex gsun01n ， ncl gsun01n.nclncargex cpex08， ctrans -d X11 cpex08.ncgm分别有图形输出则说明安装成功。

5、安装WRFV3（此处开始尤为注意安装顺序）
准备工作：

设置WRF大数据支持export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1

查看zlib libpng jasper lapack blas等是否安装
如locate zlib

若未安装可yum install （使用rpmforge后可以装）或者下载安装，下载地址见WRF下载页面，或google搜索。

添加各库环境变量（若已预装则可locate libz形式来查看，Centos6.4基本皆预装，一般预装无需声明，这里因为下面编译WRFV3和WPS出现了问题，需要声明JASPER环境变量）

#set for jasper
##主要是为了在装wps时configure.defaults(arch中的)中引用JASPERLIB变量
export JASPER=/usre
xport JASPERLIB=/usr/lib
export JASPERINC=/usr/local/include/jasper

添加netcdf编译库（此步骤，为调试WRFV3必须否则会有wrf.exe运行出错wrf.exe: error while loading shared libraries: libnetcdff.so.5: cannot open shared object file: No such file or directory）：
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/netcdf/lib:$LD_LIBRARY_PATH

安装wrfv3

解压进入WRFV3目录
进入arch目录
修改Confi_new.pl(使其支持grib2输入输出)
vi Confi_new.pl
/grib2来查找如下位置：
$I_really_want_to_output_grib2_from_WRF = "FALSE" ;
改为： $I_really_want_to_output_grib2_from_WRF = "TRUE" ;
/jasper来查找一下sw_jasper位置并改为如下（共两处）  
$sw_jasperlib_path = "/usr/lib";   
$sw_jasperinc_path = "/usr/local/include/jasper";
cd .../configure选择：gfortran、gcc、serial这一组会出现

************************** W A R N I N G ************************************

There are some Fortran 20003 features in WRF that your compiler does not recognize
The IEEE signaling call has been removed. That may not be enough.

*****************************************************************************
如上提示：参照：http://forum.wrfforum.com/viewtopic.php?f=5&t=5703
修改;configure.wps对应FORMAT_FIXED/FORMAT_FREE改为如下两行：
FORMAT_FIXED    =       -ffixed-form -cpp
FORMAT_FREE     =       -ffree-form -ffree-line-length-none -cpp
./compile后
生成wrf.exe ndown.exe real.exe nup.exe tc.exe且./compile >& compile.check.log
利用vi compile.check.log后/erro查看输出结果发现并无erro输出。则说明WRFV3安装成功。
tip：可以将wrf_path/main加入到PATH变量中这样在任何一个位置皆可wrf.exe运行。

6、安装wps

安装wps后会生成不了plot*.exe两个文件，因此作如下修改：
解压后修改arch中的configure.defaults
在gfortran相应位置增加：
COMPRESSION_LIBS    = -L$(JASPERLIB) -ljasper -lpng -lz
COMPRESSION_INC     = -I$(JASPERINC)
NCARG_LIBS2         = -L/usr/local/ncl/lib -lncarg -lncarg_gks -lncarg_c \                    
                                       -L/usr/lib -lX11 -lpng \                     
                                       -L/usr/lib/gcc/i686-redhat-linux/3.4.6 -lgcc

修改preamble
将NCARG_LIBS改为：
NCARG_LIBS                =        -L$(NCARG_ROOT)/lib -lncarg -lncarg_gks -lncarg_c \                              
                                                   -L/usr/lib -lX11 \
                                                    -L/usr/lib/gcc/i686-redhat-linux/3.4.6 -lgcc

./configure会提示Fortran+NETCDF运行有问题，这里无视，

修改对应compile即可

vi compile
将其中对应行改为如下：
if      ( ${#argv} == 0 )
then        
set names        =        ( geogrid ungrib metgrid g1print g2print   rd_intermediate mod_levs avg_tsfc calc_ecmwf_p plotfmt plotgrids )

./compile >& compile.check.log
会发现各exe皆已生成。（这个地方，还是有个问题，就是做如此修改后未修改前的int2nc.exe和height_ukmo.exe会消失，请各位帮忙解决。预计分别执行./compile wps ./compile util  经验证，可以实现。）

5安装WRFDA
./configure wrfda
./compile all_wrfvar
如果/home/name/Program/WRFDA/var/da 里面有da_wrfvar.exe, da_update_bc.exe及它共26个.exe文件，那就说明WRFDA安装成功了

6安装AWRpost
将src中的Makefile文件中相应条目改为：ARWpost.exe: $(OBJS)
$(FC) $(FFLAGS) $(LDFLAGS) -o $@ $(OBJS) \
-L$(NETCDF)/lib -I$(NETCDF)/include -lnetcdf -lnetcdff
./configure
./compile生成AWRpost即可
运行测试
./ARWpost如果出现：
sh: .foo: Permission denied
sh: .foo1: Permission denied
cat: .foo: No such file or directory
chmod 777 .foochmod 777 .foo1

7解压geog完成。

destroyer

好吧，好像排版有很大问题，明早用电脑改吧。

ayzqs

不错，看来没少下工夫，谢谢分享！

又是那隻貓

谢谢分享啦，还是不很不错的一个新生指导

sywyx

谢谢分享！！

kongfeng0824

感谢分享  

destroyer

ayzqs 发表于 2013-12-4 08:29

                               
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不错，看来没少下工夫，谢谢分享！

确实没少花时间。。。

destroyer

又是那隻貓 发表于 2013-12-4 08:33

                               
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谢谢分享啦，还是不很不错的一个新生指导

对新生来说有点用，写的还不够详细，有机会在改。

若兰

谢谢楼主分析，力挺呐！！！么么！

若兰

我在这堆代码里发现我的名字了