运行real.exe出现问题，求大神们指点一下

xiuyuanyang

首次运行wrf,修改namelist.input 后，并将wps下生成的nc数据文件链接到了em_real目录下，执行./real.exe时，出现了错误，查看em_real目录下生成的real.out，错误提示如下：
starting wrf task            0  of            1
  2 --------------------------------------------------------------------------
  3 MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
  4 with errorcode 1.
  5
  6 NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
  7 You may or may not see output from other processes, depending on
  8 exactly when Open MPI kills them.
根据提示，感觉是并行出现了问题，但不知该如何处理，从哪里下手。
其次，该目录下的rsl.error.0000和rsl.out.0000文件中，提示一些变量找不到，具体如下：
  1  Namelist logging not found in namelist.input. Using registry defaults for varia
  2  bles in logging.
  3  Namelist dfi_control not found in namelist.input. Using registry defaults for v
  4  ariables in dfi_control
  5    ------ ERROR while reading namelist domains ------
  6  Namelist tc not found in namelist.input. Using registry defaults for variables
  7  in tc
  8  Namelist noah_mp not found in namelist.input. Using registry defaults for varia
  9  bles in noah_mp
10  Namelist scm not found in namelist.input. Using registry defaults for variables
11   in scm
12  Namelist fire not found in namelist.input. Using registry defaults for variable
13  s in fire
14  Namelist diags not found in namelist.input. Using registry defaults for variabl
15  es in diags
16  -------------- FATAL CALLED ---------------
17  FATAL CALLED FROM FILE:  <stdin>  LINE:    9622
18  ERRORS while reading one or more namelists from namelist.input.
19  -------------------------------------------
20 taskid: 0 hostname: node1
21 taskid: 0 hostname: node1
在论坛里看到有人问过以上问题，请遇到过这些问题或是知道这些问题的大神们给点提示或是意见，该如何解决，谢谢大家 啦！

innocent

@又是那隻貓

innocent

把  namelist.input 也贴出来吧，应该是里面设置有问题

xiuyuanyang

1  &time_control
  2  run_days                            = 1,
  3  run_hours                           = 12,
  4  run_minutes                         = 1440,
  5  run_seconds                         = 86400,
  6  start_year                          = 2007, 2007,
  7  start_month                         = 08,   08,
  8  start_day                           = 15,   15,
  9  start_hour                          = 00,   00,
10  start_minute                        = 00,   00,
11  start_second                        = 00,   00,
12  end_year                            = 2007, 2007,
13  end_month                           = 08,   08,
14  end_day                             = 16,   16,
15  end_hour                            = 00,   00,
16  end_minute                          = 00,   00,
17  end_second                          = 00,   00,
18  interval_seconds                    = 10800
19  input_from_file                     = .true.,.true.,
20  history_interval                    = 60,  60,
21  frames_per_outfile                  = 1000, 1000,
22  restart                             = .false.,
23  restart_interval                    = 5000,
24  io_form_history                     = 2
25  io_form_restart                     = 2
26  io_form_input                       = 2
27  io_form_boundary                    = 2
28  debug_level                         = 0
29  /
30
1  &time_control
  2  run_days                            = 1,
  3  run_hours                           = 12,
  4  run_minutes                         = 1440,
  5  run_seconds                         = 86400,
  6  start_year                          = 2007, 2007,
  7  start_month                         = 08,   08,
  8  start_day                           = 15,   15,
  9  start_hour                          = 00,   00,
10  start_minute                        = 00,   00,
11  start_second                        = 00,   00,
12  end_year                            = 2007, 2007,
13  end_month                           = 08,   08,
14  end_day                             = 16,   16,
15  end_hour                            = 00,   00,
16  end_minute                          = 00,   00,
17  end_second                          = 00,   00,
18  interval_seconds                    = 10800
19  input_from_file                     = .true.,.true.,
20  history_interval                    = 60,  60,
21  frames_per_outfile                  = 1000, 1000,
22  restart                             = .false.,
23  restart_interval                    = 5000,
24  io_form_history                     = 2
25  io_form_restart                     = 2
26  io_form_input                       = 2
27  io_form_boundary                    = 2
28  debug_level                         = 0
29  /
30
31  &domains
32  time_step                           = 180,60
33  time_step_fract_num                 = 0,
34  time_step_fract_den                 = 1,
35  max_dom                             = 1,
36  e_we                                = 74,    112,
37  e_sn                                = 61,    97,
38  e_vert                              = 30,    30,
39  p_top_requested                     = 5000,
40  num_metgrid_levels                  = 27,
41  num_metgrid_soil_levels             = 4,
42  dx                                  = 30000, 10000,
43  dy                                  = 30000, 10000,
44  grid_id                             = 1,     2,
45  parent_id                           = 0,     1,
46  i_parent_start                      = 1,     31,
47  j_parent_start                      = 1,     17,
48  parent_grid_ratio                   = 1,     3,
49  parent_time_step_ratio              = 1,     3,
50  feedback                            = 1,
51  smooth_option                       = 0
52  /
53
54  &physics
55  mp_physics                          = 3,     3,
56  ra_lw_physics                       = 1,     1,
57  ra_sw_physics                       = 1,     1,
58  radt                                = 30,    30,
59  sf_sfclay_physics                   = 1,     1,
60  sf_surface_physics                  = 2,     2,
61  bl_pbl_physics                      = 1,     1,
61  bl_pbl_physics                      = 1,     1,
62  bldt                                = 0,     0,
63  cu_physics                          = 1,     1,
64  cudt                                = 5,     5,
65  isfflx                              = 1,
66  ifsnow                              = 1,
67  icloud                              = 1,
68  surface_input_source                = 1,
69  num_soil_layers                     = 4,
70  sf_urban_physics                    = 0,     0,
71  /
72
73  &fdda
74  /
75
76  &dynamics
77  w_damping                           = 0,
78  diff_opt                            = 1,
79  km_opt                              = 4,
80  diff_6th_opt                        = 0,      0,
81  diff_6th_factor                     = 0.12,   0.12,
82  base_temp                           = 290.
83  damp_opt                            = 0,
84  zdamp                               = 5000.,  5000.,
85  dampcoef                            = 0.2,    0.2,
86  khdif                               = 0,      0,
87  kvdif                               = 0,      0,
88  non_hydrostatic                     = .true., .true.,
89  moist_adv_opt                       = 1,      1,
90  scalar_adv_opt                      = 1,      1,
91  /
92
93  &bdy_control
94  spec_bdy_width                      = 5,
95  spec_zone                           = 1,
96  relax_zone                          = 4,
97  specified                           = .true., .false.,
98  nested                              = .false., .true.,
99  /
100
101  &grib2
102  /
103
104  &namelist_quilt
105  nio_tasks_per_group = 0,
106  nio_groups = 1,
107  /

TTCK

用mpirun 命令运行试试

lhaikun@163.com

你这个run的时间是什么鬼，你先自查一下namelist看看细节吧http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=36483

又是那隻貓

运行时间先改掉看看

TTCK

namelist.input里面的时间设置有问题 改下试试看

xiuyuanyang

TTCK 发表于 2015-7-25 00:08
用mpirun 命令运行试试

我用了mpirun,可是还是会提示相同的错误，我不知道这是我并行有问题还是我的namelist.input设置有问题引起的，因为我看到论坛里有人出现过这种错误，说是namelis.input的问题。

xiuyuanyang

lhaikun@163.com 发表于 2015-7-25 00:12
你这个run的时间是什么鬼，你先自查一下namelist看看细节吧http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewth ...

额。。这个是我粗心错误，我把时间改成了24，但是还是会出现相同的错误，而且real.out中提示的关于并行错误的问题不知是什么原因引起的，请问你有遇到过吗？