wrf-chem的安装问题

lavenderSC361

本人初学WRF-CHEM，现在安装的时候出现了问题，环境变量设置的是：
export WRF_EM_CORE=1
export WRF_NMM_CORE=0
export WRF_CHEM=1
export WRF_KPP=0
（因为不知道FLEX_LIB_DIR和YACC所在的路径所以没有设置KPP=1）
之后再装WRFV3的时候compile之后的main文件夹中并没有出现ndown.exe real.exe wrf.exe这三个
compile.log里面的内容如下：
copying Registry/Registry.EM_CHEM to Registry/Registry

Compiling: WRF_EM_CORE .

setting parallel make -j 2
make -i -r MODULE_DIRS="-I../dyn_em -I../dyn_nmm   -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/external/esmf_time_f90  -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/main -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/external/io_netcdf -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/external/io_int -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/frame -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/share -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/phys -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/chem -I/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/inc -I/nuist/p/public/app/netcdf/3.6.3/intel/11.1.046/include " ext
make[1]: Entering directory `/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3'
--------------------------------------
( cd frame ; make -i -r externals )
make[2]: Entering directory `/nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/frame'
( cd /nuist/p/work/vikicam/shenchen/WRFV3/external/esmf_time_f90 ; \
          make -j 2 FC="ifort -i4  -ip -fp-model precise -w -ftz -align all -fno-alias -FR -convert big_endian  " RANLIB="ranlib" \
          。。。。。
ln -sf ../../run/RRTM_DATA_DBL RRTM_DATA ;          \
                ln -sf ../../run/RRTMG_LW_DATA_DBL RRTMG_LW_DATA ;  \
                ln -sf ../../run/RRTMG_SW_DATA_DBL RRTMG_SW_DATA ;  \
             fi )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f GENPARM.TBL ; ln -s ../../run/GENPARM.TBL . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f LANDUSE.TBL ; ln -s ../../run/LANDUSE.TBL . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f SOILPARM.TBL ; ln -s ../../run/SOILPARM.TBL . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f URBPARM.TBL ; ln -s ../../run/URBPARM.TBL . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f VEGPARM.TBL ; ln -s ../../run/VEGPARM.TBL . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f MPTABLE.TBL ; ln -s ../../run/MPTABLE.TBL . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f tr49t67 ; ln -s ../../run/tr49t67 . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f tr49t85 ; ln -s ../../run/tr49t85 . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f tr67t85 ; ln -s ../../run/tr67t85 . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f gribmap.txt ; ln -s ../../run/gribmap.txt . )
( cd test/em_real ; /bin/rm -f grib2map.tbl ; ln -s ../../run/grib2map.tbl . )
( cd run ; /bin/rm -f real.exe ; ln -s ../main/real.exe . )
( cd run ; /bin/rm -f tc.exe ; ln -s ../main/tc.exe . )
( cd run ; /bin/rm -f ndown.exe ; ln -s ../main/ndown.exe . )
( cd run ; /bin/rm -f nup.exe ; ln -s ../main/nup.exe . )
( cd run ; if test -f namelist.input ; then \
  /bin/cp -f namelist.input namelist.input.backup ; fi ; \
  /bin/rm -f namelist.input ; ln -s ../test/em_real/namelist.input . )
build started:   Wed Jan  6 22:07:30 CST 2016
build completed: Wed Jan 6 22:25:17 CST 2016
中间的部分省略。求大侠指点问题所在！

xyan88

安装WRFV3-Chem
tar zxvf WRFV3-Chem-3.5.TAR.gz
cp -ri chem/ WRFV3

gedit ~/.bashrc
应WRF需要，再加入一行开启支持WRF输出大文件的选项设置：
export        WRF_EM_CORE=1
export        WRF_NMM_CORE=0
export        WRF_CHEM=1
export        WRF_KPP=0

//set the KPP environmental variable to zero (setenv WRF_KPP 0) if the KPP libraries are not needed.
//export        WRF_KPP=1
//export        FLEX_LIB_DIR=/usr/lib
//export        YACC=‘/usr/bin/yacc –d’

source .bashrc

cd WRFV3
./clean –a //清理所有的built files，including configure.wrf
$./configure
-Please select from among the following supported platforms.
选择  3.  Linux x86_64 i486 i586 i686, PGI compiler with gcc  (dmpar)
-Compile for nesting? (1=basic, 2=preset moves, 3=vortex following) [default 1]:
选择 1

./compile
./compile em_real >& compile.log
main文件夹下：ndown.exe, real.exe, and wrf.exe

compile emi_conv >& emcompile.log
成功后 test/em_real/目录下会生成 convert_emiss.exe

xyan88

FLEX_LIB_DIR 这个是什么啊

lavenderSC361

xyan88 发表于 2016-1-11 16:01
FLEX_LIB_DIR 这个是什么啊

是服务器中用于打开KPP的一个插件，需要安装的

xyan88

lavenderSC361 发表于 2016-1-12 15:45
是服务器中用于打开KPP的一个插件，需要安装的

学习了 我用自己的笔记本跑的 现在在调研服务器配置情况 请问如果用WRF-Chem做未来三天的预报情况，服务器需要什么样子的配置比较合理

气象草鸟

xyan88 发表于 2016-1-7 17:25
安装WRFV3-Chem
tar zxvf WRFV3-Chem-3.5.TAR.gz
cp -ri chem/ WRFV3

请问你有试过kpp=1的情况吗，

青帘影

请问安装chem的过程中有下面的报错，但是可以正常生成4个可执行文件，这样子正常吗？
FOUND match between WRF-Chem/KPP for mechanism:  cbm4
Found file chem/KPP/mechanisms/cbm4/cbm4_wrfkpp.equiv
ERROR: variable name for third body in KPP species file is expected to be  M, but was not found in cbm4 species file

木槿昔年617

楼主，请问你的问题解决的了吗

Stella@88

青帘影 发表于 2018-4-25 20:12
请问安装chem的过程中有下面的报错，但是可以正常生成4个可执行文件，这样子正常吗？
FOUND match between ...

你好，不知道你这个问题解决了吗？我也遇到同样的问题不知道怎么处理，谢谢

风暴之灵

青帘影 发表于 2018-4-25 20:12
请问安装chem的过程中有下面的报错，但是可以正常生成4个可执行文件，这样子正常吗？
FOUND match between ...

你好我也遇到这个问题，编译过程还有一大堆warning，但是可以生成.exe文件。
请问您知道这个是什么问题吗？