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WRF-Chem运行中断,输出文件没有错误提示

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新浪微博达人勋

发表于 2017-9-3 19:14:25 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 liusinuo 于 2017-9-3 19:26 编辑

各位大神,我在运行wrf-chem时意外中断,rsl.out文件并没有报错,但是在stderr.log文件末尾出现了下面的内容,请问这是怎么回事啊?

starting wrf task           163  of           168
Exit code -5 signaled from nblade27
MPI process terminated unexpectedly
Killing remote processes...MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
MPI process terminated unexpectedly
DONE

之前也意外中断过一次,输出文件也没有报错,在stderr.log文件末尾也出现相似的内容:
Killing remote processes...DONE

这种情况是模式没设置好,还是服务器的问题啊?
我的namelist内容如下,谢谢大家了!!
&time_control
run_days                            = 11,
run_hours                           = 0,
run_minutes                         = 0,
run_seconds                         = 0,
start_year                          = 2015,
start_month                         = 02,
start_day                           = 27,
start_hour                          = 00,
start_minute                        = 00,
start_second                        = 00,
end_year                            = 2015,
end_month                           = 03,
end_day                             = 10,
end_hour                            = 00,
end_minute                          = 00,
end_second                          = 00,
interval_seconds                    = 21600,
input_from_file                     = .true.,
history_interval                    = 60,
frames_per_outfile                  = 1,
restart                             = .false.,
restart_interval                    = 43200,
auxinput5_interval_m                = 60,
auxinput6_interval_m                = 43200,
auxinput6_inname                   = 'wrfbiochemi_d<domain>',
io_form_history                     = 2
io_form_restart                     = 2
io_form_input                       = 2
io_form_boundary                    = 2
io_form_auxinput5                   = 2
io_form_auxinput6                   = 2
debug_level                         = 0
auxinput11_interval_s               = 120, 120, 120, 120,
auxinput11_end_h                    = 72, 30, 30, 30,
/
&domains
time_step                           = 30,
time_step_fract_num                 = 0,
time_step_fract_den                 = 1,
max_dom                             = 1,
e_we                                = 301,
e_sn                                = 301,
e_vert                              = 35,
dx                                  = 6000,
dy                                  = 6000,
p_top_requested                     = 5000,
num_metgrid_levels                  = 32,
num_metgrid_soil_levels             = 4,
grid_id                             = 1,
parent_id                           = 0,
i_parent_start                      = 1,
j_parent_start                      = 1,
parent_grid_ratio                   = 1,
parent_time_step_ratio              = 1,
feedback                            = 1,
smooth_option                       = 0
/

&physics
mp_physics                          = 6,
progn                               = 0,
naer                                = 1e9
ra_lw_physics                       = 5,
ra_sw_physics                       = 5,
radt                                = 6,
sf_sfclay_physics                   = 2,
sf_surface_physics                  = 2,
bl_pbl_physics                      = 2,
bldt                                = 1,
cu_physics                          = 0,
cudt                                = 5,
isfflx                              = 1,
ifsnow                              = 1,
icloud                              = 1,
surface_input_source                = 1,
num_soil_layers                     = 4,
num_land_cat                        = 20,
sf_urban_physics                    = 0,
num_urban_layers                    = 1200,
maxiens                             = 1,
maxens                              = 3,
maxens2                             = 3,
maxens3                             = 16,
ensdim                              = 144,
cu_rad_feedback                     = .false.,
/

&fdda
obs_nudge_opt                       = 1,1,0,0,0
max_obs                             = 150000,
fdda_start                          =   0.,     0.,     0.,     0.,     0.
fdda_end                            = 14400., 99999., 99999., 99999., 99999.
obs_nudge_wind                      = 1,1,1,0,0
obs_coef_wind                       = 6.E-4,6.E-4,6.E-4,6.E-4,6.E-4
obs_nudge_temp                      = 1,0,0,0,0
obs_coef_temp                       = 6.E-4,6.E-4,6.E-4,6.E-4,6.E-4
obs_nudge_mois                      = 1,1,1,1,1
obs_coef_mois                       = 6.E-4,6.E-4,6.E-4,6.E-4,6.E-4
obs_rinxy                           = 200.,360.,90.,30.,180
obs_rinsig                          = 0.1,
obs_twindo                          = 0.6666667,0.6666667,0.6666667,0.6666667,0.6666667,
obs_npfi                            = 10,
obs_ionf                            = 2, 2, 2, 2, 2,
obs_idynin                          = 0,
obs_dtramp                          = 40.,
obs_prt_freq                        = 10, 10, 10, 10, 10,
obs_prt_max                         = 10
obs_ipf_errob                       = .true.
obs_ipf_nudob                       = .true.
obs_ipf_in4dob                      = .true.
obs_ipf_init                        = .true.
/

&dynamics
w_damping                           = 1,
diff_opt                            = 1,
km_opt                              = 4,
diff_6th_opt                        = 0,
diff_6th_factor                     = 0.12,
base_temp                           = 290.
damp_opt                            = 0,
zdamp                               = 5000.,
dampcoef                            = 0.2,
khdif                               = 0,
kvdif                               = 0,
non_hydrostatic                     = .true.,
moist_adv_opt                       = 1,
scalar_adv_opt                      = 1,
chem_adv_opt                        = 1,
tracer_adv_opt                      = 1,
tke_adv_opt                         = 1,
/

&bdy_control
spec_bdy_width                      = 5,
spec_zone                           = 1,
relax_zone                          = 4,
specified                           = .true.,
nested                              = .false.,
/

&grib2
/

&chem
kemit                               = 2,
chem_opt                            = 1,
bioemdt                             = 30,
photdt                              = 10,
chemdt                              = 1.0,
frames_per_emissfile                = 840,
emiss_inpt_opt                      = 2,
emiss_opt                           = 1
bb_emiss_opt                        = 1,
io_style_emissions                  = 2
chem_in_opt                         = 0,
phot_opt                            = 1,
drydep_opt                          = 1,
bio_emiss_opt                       = 3,
aer_ra_feedback                     = 1,
so2_haze_react                      = 10,
fe3_ion_factor                      = 1.0,
mn2_ion_factor                      = 1.0,
/

&namelist_quilt
nio_tasks_per_group = 0,
nio_groups = 1,
/


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新浪微博达人勋

发表于 2017-12-11 10:00:15 | 显示全部楼层

回帖奖励 +3 金钱

估计是参数设置不对
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新浪微博达人勋

发表于 2017-12-11 15:29:33 | 显示全部楼层

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你试试Domain里面设置呢?看看警告是提醒那一个地方?
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新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2017-12-11 15:32:22 | 显示全部楼层
sunzy025 发表于 2017-12-11 15:29
你试试Domain里面设置呢?看看警告是提醒那一个地方?

问题已解决,是关于mpi的问题,我在做fdda的时候obs_rinxy设置的范围太大,模式不收敛,所以出错了。谢谢交流哈
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新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2017-12-11 15:33:01 | 显示全部楼层
931404656 发表于 2017-12-11 10:00
估计是参数设置不对

嗯,是的,obs_rinxy设置太大了。。。
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新浪微博达人勋

发表于 2017-12-11 16:31:17 | 显示全部楼层

回帖奖励 +3 金钱

liusinuo 发表于 2017-12-11 15:32
问题已解决,是关于mpi的问题,我在做fdda的时候obs_rinxy设置的范围太大,模式不收敛,所以出错了。谢谢 ...

解决了就好啊~
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新浪微博达人勋

发表于 2018-11-15 11:52:41 | 显示全部楼层

回帖奖励 +3 金钱

liusinuo 发表于 2017-12-11 15:32
问题已解决,是关于mpi的问题,我在做fdda的时候obs_rinxy设置的范围太大,模式不收敛,所以出错了。谢谢 ...

在哪里找关于mpi的问题,或者说除了找rsl.error和rsl.out还有其他的log文件吗?
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新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2018-11-15 15:53:28 | 显示全部楼层
里斯斯里 发表于 2018-11-15 11:52
在哪里找关于mpi的问题,或者说除了找rsl.error和rsl.out还有其他的log文件吗?

stderr.log和stdout.log
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新浪微博达人勋

发表于 2018-11-15 18:13:05 | 显示全部楼层

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liusinuo 发表于 2018-11-15 15:53
stderr.log和stdout.log

请问用的什么命令可以出现这两个文件啊,我的WRFV3/test/em_real目录下没有
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新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2018-11-16 13:09:53 | 显示全部楼层
里斯斯里 发表于 2018-11-15 18:13
请问用的什么命令可以出现这两个文件啊,我的WRFV3/test/em_real目录下没有

我们用pbs提交作业会输出这两个文件,具体你可以问下你们服务器的管理员
#PBS -o /rundir/stdout.log
#PBS -e /rundir/stderr.log
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