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求助!./real.exe出现错误,请问namelist.input应该怎么修改呢?

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新浪微博达人勋

发表于 2018-1-29 10:45:19 | 显示全部楼层 |阅读模式

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x
运行./real.exe时,rsl.error.0000出现错误:
taskid: 0 hostname: localhost.localdomain
module_io_quilt_old.F        2931 T
Ntasks in X            1, ntasks in Y            1
--- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
Need MYNN PBL for icloud_bl = 1, resetting to 0
--- NOTE: RRTMG radiation is not used, setting:  o3input=0 to avoid data pre-processing
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
REAL_EM V3.8 PREPROCESSOR
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            1          65           1          68
ims,ime,jms,jme           -4          70          -4          73
ips,ipe,jps,jpe            1          65           1          68
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1,              141769508 bytes allocated
-------------- FATAL CALLED ---------------
FATAL CALLED FROM FILE:  <stdin>  LINE:     411
error opening met_em.d01.2005-09-27_00:00:00.nc for input; bad date in namelist or file not in directory
-------------------------------------------
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0

namelist.input的内容:
&time_control
run_days                            = 1,
run_hours                           = 0,
run_minutes                         = 0,
run_seconds                         = 0,
start_year                          = 2005, 2005, 2005,
start_month                         = 09,   09,   09,
start_day                           = 27,   27,   27,
start_hour                          = 00,   00,   00,
start_minute                        = 00,   00,   00,
start_second                        = 00,   00,   00,
end_year                            = 2005, 2005, 2005,
end_month                           = 09,   09,   09,
end_day                             = 28,   28,   28,
end_hour                            = 00,   00,   00,
end_minute                          = 00,   00,   00,
end_second                          = 00,   00,   00,
interval_seconds                    = 21600
input_from_file                     = .true.,.true.,.true.,
history_interval                    = 60,  60,   60,
frames_per_outfile                  = 1000, 1000, 1000,
restart                             = .false.,
restart_interval                    = 5000,
io_form_history                     = 2
io_form_restart                     = 2
io_form_input                       = 2
io_form_boundary                    = 2
debug_level                         = 0
/

&domains
time_step                           = 18,
time_step_fract_num                 = 0,
time_step_fract_den                 = 1,
max_dom                             = 1,
e_we                                = 65,    112,   94,
e_sn                                = 68,    151,    91,
e_vert                              = 30,    30,    30,
p_top_requested                     = 5000,
num_metgrid_levels                  = 27,
num_metgrid_soil_levels             = 4,
dx                                  = 81000, 81000,  3333.33,
dy                                  = 81000, 81000,  3333.33,
grid_id                             = 1,     2,     3,
parent_id                           = 0,     1,     2,
i_parent_start                      = 1,     31,    30,
j_parent_start                      = 1,     17,    30,
parent_grid_ratio                   = 1,     3,     3,
parent_time_step_ratio              = 1,     3,     3,
feedback                            = 1,
smooth_option                       = 0
/

&physics
mp_physics                          = 3,     3,     3,
ra_lw_physics                       = 1,     1,     1,
ra_sw_physics                       = 1,     1,     1,
radt                                = 30,    30,    30,
sf_sfclay_physics                   = 1,     1,     1,
sf_surface_physics                  = 2,     2,     2,
bl_pbl_physics                      = 1,     1,     1,
bldt                                = 0,     0,     0,
cu_physics                          = 1,     1,     0,
cudt                                = 5,     5,     5,
isfflx                              = 1,
ifsnow                              = 1,
icloud                              = 1,
surface_input_source                = 3,
num_soil_layers                     = 4,
num_land_cat                        = 21,
sf_urban_physics                    = 0,     0,     0,
/

&fdda
/

&dynamics
w_damping                           = 0,
diff_opt                            = 1,      1,      1,
km_opt                              = 4,      4,      4,
diff_6th_opt                        = 0,      0,      0,
diff_6th_factor                     = 0.12,   0.12,   0.12,
base_temp                           = 290.
damp_opt                            = 0,
zdamp                               = 5000.,  5000.,  5000.,
dampcoef                            = 0.2,    0.2,    0.2
khdif                               = 0,      0,      0,
kvdif                               = 0,      0,      0,
non_hydrostatic                     = .true., .true., .true.,
moist_adv_opt                       = 1,      1,      1,     
scalar_adv_opt                      = 1,      1,      1,     
/

&bdy_control
spec_bdy_width                      = 5,
spec_zone                           = 1,
relax_zone                          = 4,
specified                           = .true., .false.,.false.,
nested                              = .false., .true., .true.,
/

&grib2
/

&namelist_quilt
nio_tasks_per_group = 0,
nio_groups = 1,
/

namlist.wps的内容:
&share
wrf_core = 'ARW',
max_dom = 2,
start_date = '2005-09-27_00:00:00','2005-09-27_00:00:00','2005-09-27_00:00:00',
end_date   = '2005-09-28_00:00:00','2005-09-28_00:00:00','2005-09-28_00:00:00',
interval_seconds = 21600
io_form_geogrid = 2,
/

&geogrid
parent_id         =   1,   1,   2,
parent_grid_ratio =   1,   3,   3,
i_parent_start    =   1,  11, 35, ,6,
j_parent_start    =   1,  11, 38, ,6,
e_we              = 65,  112,  232,,52,
e_sn              = 68 , 151,  148,,52,
geog_data_res     = '2m','30s', '30s',
dx = 81000,
dy = 81000,
map_proj = 'lambert',
ref_lat   = 35,
ref_lon   = 113,
truelat1  =  25,
truelat2  =  55,
stand_lon = 110,
geog_data_path = '/home/hakj/hakj/wrf/WPS/geog'
/

&ungrib
out_format = 'WPS',
prefix = 'FILE',
/

&metgrid
fg_name = 'FILE'
io_form_metgrid = 2,
/

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新浪微博达人勋

发表于 2018-1-29 11:01:19 | 显示全部楼层
所以你wrf的文件夹下有met_em.d01.2005-09-27_00:00:00.nc 文件吗?
跑完WPS后,需要把那个met_em文件从WPS里面链接过来
ln -sf ../../WPS/met_em*nc ./
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 楼主| 发表于 2018-1-29 12:09:56 | 显示全部楼层
本帖最后由 physzw 于 2018-1-29 12:15 编辑
packard 发表于 2018-1-29 11:01
所以你wrf的文件夹下有met_em.d01.2005-09-27_00:00:00.nc 文件吗?
跑完WPS后,需要把那个met_em文件从WP ...

谢谢指点!已经链接过去了,但还是提示错误
taskid: 0 hostname: localhost.localdomain
module_io_quilt_old.F        2931 T
Ntasks in X            1, ntasks in Y            1
--- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
Need MYNN PBL for icloud_bl = 1, resetting to 0
--- NOTE: RRTMG radiation is not used, setting:  o3input=0 to avoid data pre-processing
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
REAL_EM V3.8 PREPROCESSOR
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            1          65           1          68
ims,ime,jms,jme           -4          70          -4          73
ips,ipe,jps,jpe            1          65           1          68
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1,              141769508 bytes allocated
metgrid input_wrf.F first_date_input = 2005-09-27_00:00:00
metgrid input_wrf.F first_date_nml = 2005-09-27_00:00:00
----------------- ERROR -------------------
namelist    : num_metgrid_soil_levels =          4
input files : NUM_METGRID_SOIL_LEVELS =          0 (from met_em files).
-------------- FATAL CALLED ---------------
FATAL CALLED FROM FILE:  <stdin>  LINE:     737
Mismatch between namelist and global attribute NUM_METGRID_SOIL_LEVELS
-------------------------------------------
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2018-1-29 12:17:50 | 显示全部楼层
taskid: 0 hostname: localhost.localdomain
module_io_quilt_old.F        2931 T
Ntasks in X            1, ntasks in Y            1
--- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
Need MYNN PBL for icloud_bl = 1, resetting to 0
--- NOTE: RRTMG radiation is not used, setting:  o3input=0 to avoid data pre-processing
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
REAL_EM V3.8 PREPROCESSOR
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            1          65           1          68
ims,ime,jms,jme           -4          70          -4          73
ips,ipe,jps,jpe            1          65           1          68
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1,              141114308 bytes allocated
metgrid input_wrf.F first_date_input = 2005-09-27_00:00:00
metgrid input_wrf.F first_date_nml = 2005-09-27_00:00:00
d01 2005-09-27_00:00:00 Timing for input          0 s.
Max map factor in domain 1 =  1.12. Scale the dt in the model accordingly.
ERROR in psfc: flag_psfc =  1, flag_soilhgt =  1, flag_slp =  0, sfcp_to_sfcp = F
-------------- FATAL CALLED ---------------
FATAL CALLED FROM FILE:  <stdin>  LINE:    1351
not enough info for a p sfc computation
-------------------------------------------
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

发表于 2018-1-29 14:20:33 | 显示全部楼层
physzw 发表于 2018-1-29 12:17
taskid: 0 hostname: localhost.localdomain
module_io_quilt_old.F        2931 T
Ntasks in X        ...

你是说NUM_METGRID_SOIL_LEVELS 解决了?现在的问题是 p sfc computation?

下面三行定义bash函数 ncdwrf
  1. ncdwrf(){
  2.     ncdump -h $1 |grep -Ev 'FieldType|MemoryOrder|stagger|coordinates|sr_x|sr_y'
  3. }
复制代码

然后运行 ncdwrf met_em.d01.2005-09-27_00:00:00.nc  看看met文件都有几层,有什么变量

麻烦也说说你用什么资料,NCEP-FNL, ECMWF, 还是什么?
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2018-1-29 15:50:45 | 显示全部楼层
packard 发表于 2018-1-29 14:20
你是说NUM_METGRID_SOIL_LEVELS 解决了?现在的问题是 p sfc computation?

下面三行定义bash函数 ncdw ...

非常感谢!修改了层数后,问题解决了
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新浪微博达人勋

发表于 2023-11-19 16:28:48 | 显示全部楼层
packard 发表于 2018-1-29 11:01
所以你wrf的文件夹下有met_em.d01.2005-09-27_00:00:00.nc 文件吗?
跑完WPS后,需要把那个met_em文件从WP ...

请教各位前辈,我也一直报这个错,error opening met_em.d01.2016-10-06_00:00:00.nc for input; bad date in namelist or file not in directory。我当前目录下也有这些文件。而且我在自己电脑上跑就能跑出来结果。但在超算上就是报这个错,而且我电脑上和超算上都用的同一个namelist
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新浪微博达人勋

发表于 2023-12-8 22:16:57 | 显示全部楼层
qqqqsy 发表于 2023-11-19 16:28
请教各位前辈,我也一直报这个错,error opening met_em.d01.2016-10-06_00:00:00.nc for input; bad dat ...

请问您解决这个问题了嘛,我也遇到同样的问题了
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新浪微博达人勋

发表于 2023-12-11 09:20:42 | 显示全部楼层
METcui 发表于 2023-12-8 22:16
请问您解决这个问题了嘛,我也遇到同样的问题了

你看一下计算节点有没有挂载met_em所在的存储
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新浪微博达人勋

发表于 2024-8-21 09:04:37 | 显示全部楼层
METcui 发表于 2023-12-8 22:16
请问您解决这个问题了嘛,我也遇到同样的问题了

我也遇到相同的问题,请问您解决了吗?
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