WRF-chem real.exe 没有报错被killed

zoey

WRF小白一枚，请大神指教~万分感激！！！


两层domain, 运行real.exe没有报错，输出了wrfinput_d01和wrfbdy_d01，但是没有wrfinput_d02，屏幕直接显示Killed了。查看了free命令，是不是因为虚拟内存不足呢：
                    total        used              free      shared  buff/cache   available
Mem:      263120824    64437932     6974076    10370720   191708816   186547140
Swap:       4194300     4194300           0


这是我的rsl.error：

taskid: 0 hostname: argon-login-1.hpc
module_io_quilt_old.F        2931 T
Ntasks in X            1 , ntasks in Y            1
--- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      2, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      2, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      2, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
Need MYNN PBL for icloud_bl = 1, resetting to 0
--- NOTE: RRTMG radiation is not used, setting:  o3input=0 to avoid data pre-processing
*************************************
Configuring physics suite 'conus'

         mp_physics:      8      8
         cu_physics:      6      6
      ra_lw_physics:      4      4
      ra_sw_physics:      4      4
     bl_pbl_physics:      2      2
  sf_sfclay_physics:      2      2
sf_surface_physics:      2      2
*************************************
--- NOTE: RRTMG radiation is in use, setting:  levsiz=59, alevsiz=12, no_src_types=6
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
REAL_EM V3.9.1.1 PREPROCESSOR
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            1         334           1         250
ims,ime,jms,jme           -4         339          -4         255
ips,ipe,jps,jpe            1         334           1         250
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1 ,             7494233412  bytes allocated
metgrid input_wrf.F first_date_input = 2020-03-01_00:00:00
metgrid input_wrf.F first_date_nml = 2020-03-01_00:00:00
d01 2020-03-01_00:00:00 Timing for input          0 s.
d01 2020-03-01_00:00:00          flag_soil_layers read from met_em file is  1
Max map factor in domain 1 =  1.00. Scale the dt in the model accordingly.
Using sfcprs  to compute psfc
d01 2020-03-01_00:00:00   flag value of flag_qnwfa is            0
d01 2020-03-01_00:00:00 No average surface temperature for use with inland lakes
Assume Noah LSM input
d01 2020-03-01_00:00:00 Timing for processing          4 s.
d01 2020-03-01_00:00:00 Timing for output          1 s.
d01 2020-03-01_00:00:00 Timing for loop #    1 =          5 s.
metgrid input_wrf.F first_date_input = 2020-03-01_06:00:00
metgrid input_wrf.F first_date_nml = 2020-03-01_00:00:00
d01 2020-03-01_06:00:00 Timing for input          0 s.
d01 2020-03-01_06:00:00          flag_soil_layers read from met_em file is  1
Using sfcprs  to compute psfc
d01 2020-03-01_06:00:00   flag value of flag_qnwfa is            0
d01 2020-03-01_06:00:00 No average surface temperature for use with inland lakes
Assume Noah LSM input
d01 2020-03-01_06:00:00 Timing for processing          1 s.
d01 2020-03-01_06:00:00 Timing for output          0 s.
d01 2020-03-01_06:00:00 Timing for loop #    2 =          1 s.
metgrid input_wrf.F first_date_input = 2020-03-01_12:00:00
metgrid input_wrf.F first_date_nml = 2020-03-01_00:00:00
d01 2020-03-01_12:00:00 Timing for input          0 s.
d01 2020-03-01_12:00:00          flag_soil_layers read from met_em file is  1
Using sfcprs  to compute psfc
d01 2020-03-01_12:00:00   flag value of flag_qnwfa is            0
d01 2020-03-01_12:00:00 No average surface temperature for use with inland lakes
Assume Noah LSM input
d01 2020-03-01_12:00:00 Timing for processing          1 s.
d01 2020-03-01_12:00:00 Timing for output          0 s.
d01 2020-03-01_12:00:00 Timing for loop #    3 =          1 s.
metgrid input_wrf.F first_date_input = 2020-03-01_18:00:00
metgrid input_wrf.F first_date_nml = 2020-03-01_00:00:00
d01 2020-03-01_18:00:00 Timing for input          0 s.
d01 2020-03-01_18:00:00          flag_soil_layers read from met_em file is  1
Using sfcprs  to compute psfc
d01 2020-03-01_18:00:00   flag value of flag_qnwfa is            0
d01 2020-03-01_18:00:00 No average surface temperature for use with inland lakes
Assume Noah LSM input
d01 2020-03-01_18:00:00 Timing for processing          1 s.
d01 2020-03-01_18:00:00 Timing for output          0 s.
d01 2020-03-01_18:00:00 Timing for loop #    4 =          1 s.
*************************************
Nesting domain
ids,ide,jds,jde            1         292           1         427
ims,ime,jms,jme           -4         297          -4         432
ips,ipe,jps,jpe            1         292           1         427
INTERMEDIATE domain
ids,ide,jds,jde          123         225          56         203
ims,ime,jms,jme          118         230          51         208
ips,ipe,jps,jpe          121         227          54         205
*************************************
d01 2020-03-01_18:00:00  alloc_space_field: domain            2 ,              212819680  bytes allocated



附上namelist：
&time_control
run_days                            = 0,
run_hours                           = 18,
run_minutes                         = 0,
run_seconds                         = 0,
start_year                          = 2020, 2020,
start_month                         = 03,   03,   
start_day                           = 01,   01,  
start_hour                          = 00,   00,   
start_minute                        = 00,   00,   
start_second                        = 00,   00,   
end_year                            = 2020, 2020,
end_month                           = 03,   03,   
end_day                             = 01,   01,   
end_hour                            = 18,   18,   
end_minute                          = 00,   00,   
end_second                          = 00,   00,   
interval_seconds                    = 21600
input_from_file                     = .true.,.true.,
history_interval                    = 180,  60,  
frames_per_outfile                  = 1000, 1000,
restart                             = .false.,
restart_interval                    = 5000,
io_form_history                     = 2
io_form_restart                     = 2
io_form_input                       = 2
io_form_boundary                    = 2
debug_level                         = 0
/
&domains
time_step                           = 30,
time_step_fract_num                 = 0,
time_step_fract_den                 = 1,
max_dom                             = 2,
e_we                                = 334,   292,
e_sn                                = 250,   427,
e_vert                              = 27,     27,
p_top_requested                     = 10000,
num_metgrid_levels                  = 30,
num_metgrid_soil_levels             = 4,
dx                                  = 12000, 4000,
dy                                  = 12000, 4000,
grid_id                             = 1,     2,
parent_id                           = 0,     1,
i_parent_start                      = 1,     125,
j_parent_start                      = 1,     58,
parent_grid_ratio                   = 1,     3,
parent_time_step_ratio              = 1,     3,
feedback                            = 1,
smooth_option                       = 0
/
&bdy_control
spec_bdy_width                      = 5,
spec_zone                           = 1,
relax_zone                          = 4,
specified                           = .true., .false.,
nested                              = .false., .true.,
/
&grib2
/
&namelist_quilt
nio_tasks_per_group = 0,
nio_groups = 1,
/
&dynamics
diff_opt                        = 1,         1,
km_opt                          = 4,        4,
/
&physics
physics_suite                         = CONUS,
/
&chem
chem_opt                            = 0,
/

有鱼吃不吃

zoey 发表于 2020-6-22 06:26
顶起来

楼主，你好，我也遇到了相同的问题，./real.exe之后过了几秒就被killed了，是由于内存不足的原因吗？

zoey

顶起来

crazyhighwx

很厉害，希望可以和您学习一下

ouyang

楼主WRF-Chem跑通了吗，能否交流学习一下呢

棉花糖grace

楼主的问题解决了吗

magicloudy

尝试先 ulimit -s unlimited  来释放内存限制

LFH

太感谢了，我找了好久，终于解决了

ZYZZZZZ

LFH 发表于 2021-9-19 15:57
太感谢了，我找了好久，终于解决了

请问是怎么解决的呢？

枯井钓鬼

同问怎么解决的！！