[原创]搞定Ubuntu: 单机WRF安装

ztftom

artmunich 发表于 2011-10-31 23:53

                               
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这次装还是没有成功，看起来是在configure的时候出现warning了，不知是不是因此导致的？

./configure --prefix=/usr/local/mpc-0.9 --with-gmp=/usr/local/gmp-5.0.1 --with-mpfr=/usr/local/mpfr-3.1.0
你在./configure里设置的路径有些奇怪。我记得你的gmp和mpfr是安装在/usr/local里的对吧？而且你新建了一个/usr/local/mpc-0.9的文件夹，你进去看过有libmpc么？

artmunich

没找到，mpc确实没有安装成功。
至于那个路径，我没有按照默认的安装，都是在/usr/local下新建的，为了保险起见，所以我加上了gmp和mpfr的路径。

artmunich

刚刚找了个pgi，装成功了
然后再装netcdf的时候出现这个提示代表什么呀
checking whether netCDF-4 logging is enabled... no
checking whether cdmremote client is to be built... no
checking whether DAP client is to be built... yes
checking whether a path for curl-config was specified... no
checking whether a location for curl installation was specified... no
checking checking whether a location for curl-config found... no
configure: error: Cannot locate neither curl-config or a curl directory

ztftom

artmunich 发表于 2011-10-31 23:53

                               
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这次装还是没有成功，看起来是在configure的时候出现warning了，不知是不是因此导致的？

哪个编译器的好坏主要是针对在server上的，特别是并行处理的情况。pgi和intel的编译器专门对这种情况进行过优化，所以会比较高效稳定。如果是单核pc的话，差别不大。
icc + ifort下的wrf的安装会比较麻烦。

ztftom

artmunich 发表于 2011-11-1 01:15

                               
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刚刚找了个pgi，装成功了
然后再装netcdf的时候出现这个提示代表什么呀
checking whether netCDF-4 loggi ...

你的电脑里没有curl的lib，不能安装dap，不用就可以了。在帖子里面写的有。

baiduwenku

ztftom ，实在太伟大了，我看得脖子疼。

ztftom

baiduwenku 发表于 2011-11-1 21:44

                               
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ztftom ，实在太伟大了，我看得脖子疼。

你可以叫我Tom. 你是看帖子呢，还是看各种回复？帖子不长，回复有点长。。。

artmunich

大侠，make check的时候，提醒的是：
tst_f90.o  tst_f90.f90
/bin/sh ../libtool --tag=FC   --mode=link pgf90  -I../fortran -I../f90 -I../f90 -I../include -I../liblib  -g   -o tst_f90 tst_f90.o ../fortran/libnetcdff.la -lm ../liblib/libnetcdf.la  
libtool: link: pgf90 -I../fortran -I../f90 -I../f90 -I../include -I../liblib -g -o .libs/tst_f90 tst_f90.o  ../fortran/.libs/libnetcdff.so -lm ../liblib/.libs/libnetcdf.so -Wl,-rpath -Wl,/usr/local/netcdf/lib
tst_f90.o:(.debug_info+0x138c): undefined reference to `..Dm_typesizes'
tst_f90.o:(.debug_info+0x1399): undefined reference to `..Dm_netcdf'
make[2]: *** [tst_f90] 错误 2
make[2]: Leaving directory `/home/waynehuai/netcdf/netcdf-4.1.2/nf_test'
make[1]: *** [check-am] 错误 2
make[1]: Leaving directory `/home/waynehuai/netcdf/netcdf-4.1.2/nf_test'
make: *** [check-recursive] 错误 1

如果忽略这里的错误强制make install，结果会是：
Making install in cxx
make[1]: Entering directory `/home/waynehuai/netcdf/netcdf-4.1.2/cxx'
make[2]: Entering directory `/home/waynehuai/netcdf/netcdf-4.1.2/cxx'
test -z "/usr/local/netcdf/lib" || /bin/mkdir -p "/usr/local/netcdf/lib"
/bin/sh ../libtool   --mode=install /usr/bin/install -c   libnetcdf_c++.la '/usr/local/netcdf/lib'
libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libnetcdf_c++.so.4.1.0 /usr/local/netcdf/lib/libnetcdf_c++.so.4.1.0
/usr/bin/install: cannot stat `.libs/libnetcdf_c++.so.4.1.0': No such file or directory
make[2]: *** [install-libLTLIBRARIES] 错误 1
make[2]: Leaving directory `/home/waynehuai/netcdf/netcdf-4.1.2/cxx'
make[1]: *** [install-am] 错误 2
make[1]: Leaving directory `/home/waynehuai/netcdf/netcdf-4.1.2/cxx'
make: *** [install-recursive] 错误 1

好像是少了一个库的问题，libnetcdfc++是什么，大侠指教一二，多谢了

ztftom

libnetcdf_c++ 是在你编译过程中应该会产生的一个文件(shared lib)。这个文件没有生成。我刚查到这个，也没有给出解决方案。

Portland Group compilers can't build shared fortran 90 library or shared C++ library

The portland group compilers can't build netCDF shared fortran 90 library. They fail with this error:

pgf90  -I../fortran -I../f90      -I../libsrc -I../fortran   -I../f90
-g -c -o tst_f90.o tst_f90.f90
/bin/sh ../libtool   --mode=link pgf90  -I../fortran -I../f90 --
                     ---I../libsrc -I../fortran   -I../f90 -g -L/lib --
                     ---o tst_f90 tst_f90.o ../fortran/libnetcdff.la --
                     ---lm     ../libsrc/libnetcdf.la  
libtool: link: pgf90 -I../fortran -I../f90 -I../libsrc -I../fortran
-I../f90 -g -o .libs/tst_f90 tst_f90.o  -L/lib
../fortran/.libs/libnetcdff.so -lm ../libsrc/.libs/libnetcdf.so
-Wl,-rpath
-Wl,/machine/netcdf/n362_test_9456/netcdf-3.6.3-snapshot2008081305/install/lib
tst_f90.o:(.debug_info+0x135d): undefined reference to
`..Dm_typesizes'
tst_f90.o:(.debug_info+0x136e): undefined reference to `..Dm_netcdf'

If anyone could shed some light on this, it would be most appreciated. Send comments to support-netcdf@unidata.ucar.edu.

The C++ compiler chokes on the netCDF C++ tests on a shared build:

       pgCC -DHAVE_CONFIG_H -I. -I.. -I../fortran -I../libdap
       -I../libsrc   -g -c -o tst_failure.o tst_failure.cpp
/bin/sh ../libtool --tag=CXX   --mode=link pgCC  -g     -o tst_failure
       tst_failure.o ../cxx/libnetcdf_c++.la  ../libsrc/libnetcdf.la
libtool: link: pgCC -g -o .libs/tst_failure tst_failure.o
       ../cxx/.libs/libnetcdf_c++.so ../libsrc/.libs/libnetcdf.so
       -Wl,--rpath -Wl,/usr/local/lib
make[2]: Leaving directory `/machine/shecky/n4_new2/cxx'
make  check-TESTS
make[2]: Entering directory `/machine/shecky/n4_new2/cxx'
C++ runtime abort: internal error: static object marked for
       destruction more than once
/bin/sh: line 4:  8445 Aborted                 ${dir}$tst
FAIL: nctst
C++ runtime abort: internal error: static object marked for
       destruction more than once
/bin/sh: line 4:  8468 Aborted                 ${dir}$tst
XFAIL: tst_failure

y6310985

凑热闹，现在还不大懂，不过早晚用的到，支持~！！