【问题迭出】用坛友分享Fortran程序读nc文件编译完报错（已更新部分解决方法）

longlivehj

我没有足够的金钱下载netcdf.f90，就只有从unidata上下载了simple_xy_rd.f90；我的centos上也没有装ifort，所以就用了gfortran。然后用以下的命令编译成功。
gfortran -o simple_xy_rd simple_xy_rd.f90 -I/usr/lib64/gfortran/modules -lnetcdff
这个过程中，遇到了找不到“netcdf.mod”的错误，后来找到了它具体位置，加入-I/usr/lib64/gfortran/modules指明“netcdf.mod”的位置即可。
你能否把netcdf.f90发我一下，我来编译看看？

Jillou娄

longlivehj 发表于 2013-12-3 21:01

                               
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呵呵，segmentation fault最讨厌了。
我注释掉netcdf.f90中的第84行后编译，通过命令行给可执行文件传递参 ...

恩，服务器上是ifort，所以就用个ifort编译的

Jillou娄

longlivehj 发表于 2013-12-3 21:01

                               
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呵呵，segmentation fault最讨厌了。
我注释掉netcdf.f90中的第84行后编译，通过命令行给可执行文件传递参 ...

我也用gfortran编译器按你的思路编译了这个程序，即：gfortran -o read netcdf.f90 -lnetcdff，可是报错显示/usr/bin/ld: cannot find -lnetcdff
collect2: ld returned 1 exit status，那就是说不能找到lnetcdff，我已经把netcdf.inc解压到同一目录下，使用了include ‘netcdf.inc’,为什么报错这么频繁。

longlivehj

Jillou娄 发表于 2013-12-3 21:53

                               
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我也用gfortran编译器按你的思路编译了这个程序，即：gfortran -o read netcdf.f90 -lnetcdff，可是报错显 ...

哦，这个好解决。
出错的原因是找不到libnetcdff.so，因为它不在linux的一些标准位置。有两种方法：
1. 在命令行中加入-L/opt/netCDF4/lib，即gfortran -o read netcdf.f90 -L/opt/netCDF4/lib -lnetcdff，当然，首先要确保libnetcdff.so文件位于/opt/netCDF4/lib下。
2. 设置环境变量LD_LIBRARY_PATH，bash下的命令是export LD_LIBRARY_PATH=/opt/netCDF4/lib:$LD_LIBRARY_PATH
然后，在用gfortran编译试试。祝成功！

ntwd87

学习了~{:eb502:}

Jillou娄

longlivehj 发表于 2013-12-4 08:44

                               
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哦，这个好解决。
出错的原因是找不到libnetcdff.so，因为它不在linux的一些标准位置。有两种方法：
1. ...

不好意思，又打扰了。为什么按照步骤，编译几次通过后就又开始报错，这次按以上说明用ifort编译：语句是ifort -o readnc netcdf.f90 -I/opt/netCDF4/include -L/opt/netCDF4/lib -lnetcdff
，师兄确定路径是没有问题的，可是它又报错，这次报错原因不太一样，显示是ld: warning: libnetcdf.so.4, needed by /opt/netCDF4/lib/libnetcdff.so, not found (try using -rpath or -rpath-link)，我这个新手还没碰过这种问题，它的意思是说libnetcdff.so这个动态库没调用成功吗？可是我去、opt/netCDF4/lib/中看了一下libnetcdf.so是存在的。这个怎么才能解决这个问题。报错截图如下：（还有题外话：为什么程序是按F90书写的，函数库却还是调用的F77的版本）

求借时间解答，谢谢你。

longlivehj

按错误提示，是libnetcdf.so.4没有找到，但是既然libnetcdf.so存在，可以考虑做个软链接试试。
ln -sf /opt/netCDF4/lib/libnetcdf.so /opt/netCDF4/lib/libnetcdf.so.4

longlivehj

呵呵，真的很奇怪，不是fortran库找不到就是c库找不到，如果还有问题，可能需要你提供一些环境变量，比如LD_LIBRARY_PATH等。

Jillou娄

longlivehj 发表于 2013-12-4 19:28

                               
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呵呵，真的很奇怪，不是fortran库找不到就是c库找不到，如果还有问题，可能需要你提供一些环境变量，比如LD ...

这是.bashrc中的netCDF路径设置，我也觉得没问题

然后服务器上/opt/里的netCDF,mpich,hdef5都是read-only文件，我没有权限做软链。

看来我还是对着官网上的一堆调用函数自己编了，这个程序在我用的服务器上出错太频繁了。

谢谢你~~~~

longlivehj

Jillou娄 发表于 2013-12-4 19:35

                               
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这是.bashrc中的netCDF路径设置，我也觉得没问题

然后服务器上/opt/里的netCDF,mpich,hdef5都是re ...

哈哈，原来是这样！
linux环境千差万别，没有帮你解决，不好意思。
你怎么不用其它更加方便的软件呢？比如ncl，我看见你有提关于ncl做图的问题。