wrf-chem中prep_chem_sources编译需要的HDF5安装(已解决）

Kimmy2014 · 发表于 2019-5-17 09:26:08

Kimmy2014 发表于 2019-5-16 21:13
非常感谢，我有同样的问题按照你的方法解决了，但是又出现新的问题：

undefined reference to `curl_v ...

应该是netcdf没装好的问题，换了netcdf就好了

蹦蹦不是笨笨 · 发表于 2019-10-21 21:44:33

我也是有同样的问题按照你的方法解决了，但是又出现新的问题：

undefined reference to `curl_version_info'

好像一阵风 · 发表于 2020-6-19 12:09:50

chickai1109 发表于 2018-9-8 19:13
楼主，按照你的方法安装了HDF5，prep_chem_sources也编译成功了，但是运行的时候报错：HDF5 file not found ...

你好，请问HDF5 file not found这个问题后来是怎么解决的？我也遇到了同样的问题一直没有解决

弹道导弹 · 发表于 2020-9-8 11:11:16

好像一阵风发表于 2020-6-19 12:09
你好，请问HDF5 file not found这个问题后来是怎么解决的？我也遇到了同样的问题一直没有解决

请问HDF5 file not found这个问题您已经解决了吗？我也遇到了同样的问题一直没有解决

好像一阵风 · 发表于 2020-9-17 15:40:14

弹道导弹发表于 2020-9-8 11:11
请问HDF5 file not found这个问题您已经解决了吗？我也遇到了同样的问题一直没有解决

我好像是因为.inp文件里use_bbem=1，后面的olson文件没填所以报错了。

Emily莹 · 发表于 2021-1-31 08:57:31

好像一阵风发表于 2020-9-17 15:40
我好像是因为.inp文件里use_bbem=1，后面的olson文件没填所以报错了。

HDF5 file not found这个问题有谁最后解决了吗？

我是填了OLSON文件的路径，路径里也有一个OLSON.h5文件，但是还是显示file not found

之前编译prep_chem_sources的时候没有问题，但是想用use_bbem=1的时候就出错了，参照的是WRF-chem官网的Exercise 2。

是HFD5的库没安装好的问题吗，还是需要再bashrc里面设置什么环境变量呢？求问各位大神

Emily莹 · 发表于 2021-2-1 00:02:50

Emily莹发表于 2021-1-31 08:57
HDF5 file not found这个问题有谁最后解决了吗？

我是填了OLSON文件的路径，路径里也有一个OLSON.h5文 ...

这个问题终于解决了，将Global_emissions_v3/Emission_data/OLSON2文件夹下的OLSON.h5复制到一个新建的文件夹，然后路径填新的文件夹就可以了。不知道为什么原来的路径读取不出来，但是这个方法最后跑出的结果和官网的例子吻合，https://ruc.noaa.gov/wrf/wrf-chem/tutorialexercises/tutorialexercises002.html。

最后成功出现：
WRF-T-2010-07-14-000000-g1-volc.bin _____________ 33768 bytes

WRF-T-2010-07-14-000000-g1-gocartBG.bin ________ 1136624 bytes

WRF-T-2010-07-14-000000-g1-bb.bin _______________ 235672 bytes

WRF-T-2010-07-14-000000-g1-ab.bin _______________ 181816 bytes

打破砂锅纹到底 · 发表于 2021-7-13 10:40:27

Emily莹发表于 2021-2-1 00:02
这个问题终于解决了，将Global_emissions_v3/Emission_data/OLSON2文件夹下的OLSON.h5复制到一个新建的文 ...

可能是因为原目录太长了？

诶诶诶诶诶诶呀 · 发表于 2021-8-30 22:08:07

qrjn111 发表于 2017-8-6 08:36
我的按照楼主的方法编译hdf5之后，重新编译 prep_chem_sources时出现了下列问题，想问一下你的是不是这个问 ...

我也出现了这个问题，我是这么解决的：
编译PREP-CHEM-SRC-1.5时这一步是在bin/build/文件夹下，要返回到PREP-CHEM-SRC-1.5/src文件夹下，把src文件夹下的convert_edgar_to_RELACS_REAC.f90和bin/build/文件夹下的convert_edgar_to_RELACS_REAC.f90这两个f90文件中的两个use chem1_list前面都加上英文感叹号，也即改成：
!use chem1_list
!use chem1_list,only : alke,bio,ora2,aro,ket,alka,ald

洛书let · 发表于 2022-2-21 10:35:31

诶诶诶诶诶诶呀发表于 2021-8-30 22:08
我也出现了这个问题，我是这么解决的：
编译PREP-CHEM-SRC-1.5时这一步是在bin/build/文件夹下，要返回 ...

我也是这个问题，修改注释之后就可以了！感谢楼主，感谢层主！

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