请教GSI3.5官网例子运行错误

cinderellaty

JHONG 发表于 2018-3-1 17:04
请问成功安装后生成的gsi.exe是多大？我发现mpich环境不一样编译得到的gsi.exe的大小不一样，有23M的，有29 ...

我用intel编译的，gsi.exe大小28M，如果安装过程中没有问题，看运行不同日志记录的是什么错误。不太明白你说的mpich环境不一样是什么意思。

JHONG

cinderellaty 发表于 2018-3-1 21:43
我用intel编译的，gsi.exe大小28M，如果安装过程中没有问题，看运行不同日志记录的是什么错误。不太明白 ...

maich管并行计算的。我贴一部分stdout中显示的主要错误，您能不能看出来大概是什么错误呢？……
……

  landmask(1,1),landmask(nlon,1)=   1.00000000       2.00000000   
  landmask(1,nlat),landmask(nlon,nlat)=   1.00000000       1.00000000   
  NetCDF error: NetCDF: Variable not found
  NetCDF error: NetCDF: Variable not found
  NetCDF error in wrf_io.F90, line        3345
  NetCDF error in wrf_io.F90, line        3345
  rmse_var = SEAICE ndim1=           2
  WrfType =          104  WRF_REAL=         104 ierr  =        -1021
  ordering = XY staggering =  N/A
  start_index =            1           1           1           0  end_index =          112         122          40           0
  NetCDF error: NetCDF: Variable not found
  NetCDF error: NetCDF: Variable not found
  NetCDF error in wrf_io.F90, line        2883  Varname SEAICE
  NetCDF error in wrf_io.F90, line        2883  Varname SEAICE

……
……
================================================================================
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_PM2_5:  AIRNOW data type, subset=NC008032
READ_ANOWBUFR         : file=pm25bufr        type=pm2_5      sis=TEOM                 nread=      3981 ithin= 0 rmesh= 120.000000 isfcalc= 0 nkeep=       769 ntask=  1
  dval_use =  T
At line 915 of file balmod.f90 (unit = 22, file = 'berror_stats')
Fortran runtime error: End of file
OBS_PARA: pm2_5                      128       212       366        84
At line 915 of file balmod.f90 (unit = 22, file = 'berror_stats')
Fortran runtime error: End of file
At line 915 of file balmod.f90 (unit = 22, file = 'berror_stats')
Fortran runtime error: End of file
At line 915 of file balmod.f90 (unit = 22, file = 'berror_stats')
Fortran runtime error: End of file

cinderellaty

JHONG 发表于 2018-3-2 09:04
maich管并行计算的。我贴一部分stdout中显示的主要错误，您能不能看出来大概是什么错误呢？……
……

...

从你贴的部分来看，NetCDF的错误是可以忽略的，另外就是gfortran，你的编译器版本是对的，但GSI要求GNU5.4.0需要NetCDF是4.4.0的，你看下自己的版本对不对。另外gfortran的LAPACK有没有装对。没有用过gfortran编译，仅是一点建议，需要你再仔细检查一下。

cinderellaty

JHONG 发表于 2018-3-2 09:04
maich管并行计算的。我贴一部分stdout中显示的主要错误，您能不能看出来大概是什么错误呢？……
……

...

从你贴的部分来看，NetCDF的错误是可以忽略的，另外就是gfortran，你的编译器版本是对的，但GSI要求GNU5.4.0需要NetCDF是4.4.0的，你看下自己的版本对不对。另外gfortran的LAPACK有没有装对。没有用过gfortran编译，仅是一点建议，需要你再仔细检查一下。

JHONG

cinderellaty 发表于 2018-3-2 16:55
从你贴的部分来看，NetCDF的错误是可以忽略的，另外就是gfortran，你的编译器版本是对的，但GSI要求GNU5. ...

用的5.4.0版本的GNU和4.4.0版本的NetCDF，能安装成功产生gsi.exe，但是运行起来还是会出错。我再看下吧。谢谢了。

elegantor

hi，请问GSI v3.6跑成功了嘛，我遇到了内存段错误，可否指导下

zhangkf_7

洛书let 发表于 2017-10-10 18:38
请问，Inter编译器是怎么查看的呀
，我在运行第一个脚本的时候遇到错误，如下，不知道是什么原因导致的， ...

你好，这个问题解决了吗

CONVERT_NETCDF_MASS:  problem with flnm1 = wrf_inou2, Status =        -1021

阳春白雪雨纷纷

JHONG 发表于 2018-3-2 21:39
用的5.4.0版本的GNU和4.4.0版本的NetCDF，能安装成功产生gsi.exe，但是运行起来还是会出错。我再看下吧。 ...

您好，我现在正在安装3.6版本的GSI，和您一样我也是用5.4.0版本的GNU和4.4.0版本的NetCDF进行安装，但是一直没有生成gsi.exe。查看compile.log，我想应该是gcc编译器出现了问题，可是我卸载安装了几次不同版本的gcc还是会有这样的问题。

compile.log的部分Error

......
Error: Non-numeric character in statement label at (1)
bufrlib.prm:1:2:

/* Copyright (C) 1991-2012 Free Software Foundation, Inc.
  1
Error: Invalid character in name at (1)
bufrlib.prm:2:4:

    This file is part of the GNU C Library.
    1
Error: Non-numeric character in statement label at (1)
bufrlib.prm:2:4:

    This file is part of the GNU C Library.
    1
Error: Unclassifiable statement at (1)
bufrlib.prm:4:4:

    The GNU C Library is free software; you can redistribute it and/or
    1

......（还有许多errors，但基本上都是和上面一样的，篇幅有限就不全部贴上了）

请问您遇到过这个问题吗？麻烦您了。

zyx0611

洛书let 发表于 2017-10-16 17:01
再次求助，我在运行第3个例子的时候，想设置串行并行数， GSIPROC=8，官网也说这个数字是自己随便设置的， ...

我也出现了这个问题，请问您有没有解决呢？

qqqstt

您好！前辈，想请教一下这个问题，我是在运行自己的数据时遇到的这个问题：end-of-file during read, unit 15, file /home/ttsun/GSI/comGSIv3.5_EnKFv1.1/run/my_cmaq_pm25/sigf03
我在GSI3.5手册中看到BK_file的要求   i) CMAQ binary file   对于CMAQ需要bin文件   用的ncl的fbinrecwrite（）把cmaq的结果的PM2.5转为bin，不知道对不对，这里有点疑惑，感觉可能是这里出了错，麻烦您指导一下  谢谢您