real.exe两层嵌套，只出来wrfbdy_d01和wrfinput_d01，没有wrfinput_d02

wfc1102

i_parent_start    =   1,  170,
j_parent_start    =   1,  150,
e_we              =  398, 349,
e_sn              =  258, 229,

d01的y方向有258个点，你的d02从其第150个点开始，一般d02位于d01的中间位置，d02的结束位置就不够了，因此d02是无效设置。应有j_parent_start(d02) <e_sn(d01)/2
可以看看官网解释，以加深理解。
https://www2.mmm.ucar.edu/wrf/users/namelist_best_prac_wps.html

wfc1102

另外，在WPS下运行ncl util/plotgrids_new.ncl，正确的话会出现嵌套的网格框d01+d02，题主之前的设置应该只有d01一个底图。以后设置完namelist.wps后就ncl util/plotgrids_new.ncl绘图看看。低版本<3.8的WRF就用ncl util/plotgrids.ncl