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记录使用cost733class进行天气分型

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新浪微博达人勋

发表于 2022-11-20 22:06:19 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本帖最后由 新手村de小菜鸡 于 2022-11-20 22:07 编辑

首先要感谢两篇经验贴,帮助我很快地成功运行。放这:

https://www.jianshu.com/p/5bb6d8ec5444

http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=104131

开这个贴,是因为遇到了一些报错,先从下数据开始:


我下载的是ERA5位势高度、风速等每日nc数据,但是ncdump发现纬度是反过来的,于是我就用cdo-invertlat了一下。结果恰恰是这步操作,导致后面不断出现报错!分型时读取正反纬度都是一样的。


对于时间单位的处理:ERA5数据的time:units = "hours since 1900-01-01 00:00:00.0" 要改成00:00:00,而且我的数据时间并不是连续的,于是直接删除原来的时间,替换了个新的、连续的时间,后续记得换回来就行


cost733class的命令:
我用的是里面T-PCA的分型方法,看到软件里还有很多SOM、K-means等分型方法,但我没有试过
一个文件只有一个变量,nc文件要加上fmt:netcdf,ncl 9表示分型数量为9:
./cost733class -v 4 -dat pth:/home/ERA5_test_data/testz.nc var:z fmt:netcdf slo:105:125:0.25 sla:15:30:0.25 fdt:2016 ldt:2016 ddt:1d -met PCT -ncl 9 -cla /home/ERA5_test_data/output_9.txt -dcol 3



当然如果想对多个变量加权分型,也要一个文件一个变量的读入:
./cost733class -v 4 -dat pth:/homeERA5_test_data/testz.nc var:z fmt:netcdf wgt:1.D0 -dat pth:/home/ERA5_test_data/testt.nc var:t fmt:netcdf -dat pth:/home/ERA5_test_data/testw.nc var:w fmt:netcdf wgt:1.D0 slo:105:125:0.25 sla:15:30:0.25 fdt:2016 ldt:2016 ddt:1d -met PCT -ncl 9 -cla /home/ERA5_test_data/output9.txt -dcol 3
wgt表示加权,如果每个变量都设置为1,实际就是1/n,D代表双精度,1.0表示为1.D0,最后生成的文件是txt格式,我试过如果写成.nc,好像也是无效的nc文件格式


分型结束后,可以计算ECV进行评价
./cost733class -dat pth:/home/ERA5_test_data/testz.nc -dat pth:/home/ERA5_test_data/testt.nc -dat pth:/home/ERA5_test_data/testw.nc -clain pth:/home/ERA5_test_data/output_9.txt dtc:3 ddt:1d -met ECV
不会生成文件,只会在屏幕上显示出这个分型计算的ECV的值,我理解的是:分型数量不同,计算得出的ECV不同,哪个ECV最大说明哪种分型效果最好


另外,缺失值不影响分型软件运行,时间如果修改为连续的、正常的单位,就没问题,time_bnds我还没遇到


方差为0的报错我遇到过,方差为0不就是说数据都一样吗,检查发现输入命令里的变量var不应该是时间变量time,改成位势高度z就可以了


一个文件存了多个变量,是不能在var一起读入的


运行cost733之前要先进入到安装cost733class的src文件夹(我的路径是/home/cost733class/cost733class-1.4-main/src/),再开始执行命令./cost733class


剩下的就是熟读用户手册啦~









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新浪微博达人勋

发表于 2022-11-21 08:11:24 | 显示全部楼层
棒棒
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新浪微博达人勋

发表于 2022-11-21 11:59:16 | 显示全部楼层
单纯从ECV的值来判断分型的好坏是不合理的,因为ECV只考察类内的相似性,不考察类与类之间的差异性,如此一来,ECV是随着分类数目的增加而增加的。
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新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2022-11-22 10:36:26 | 显示全部楼层
付亚男 发表于 2022-11-21 11:59
单纯从ECV的值来判断分型的好坏是不合理的,因为ECV只考察类内的相似性,不考察类与类之间的差异性,如此一 ...

感谢大佬的回复!请教一下如何评价分型好坏呢?是通过计算ΔECV=ECVk-ECVk-1,比较ΔECV最大嘛?
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发表于 2022-12-13 09:29:37 | 显示全部楼层
请教楼主,解压cost733class安装包,显示没有文件,但已经下载了安装包
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 楼主| 发表于 2022-12-21 16:26:17 | 显示全部楼层
gingili 发表于 2022-12-13 09:29
请教楼主,解压cost733class安装包,显示没有文件,但已经下载了安装包

我是在第一个链接中下载的安装包,正常解压是没问题的,或者是否安装路径、以及显示为隐藏文件夹等等问题
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新浪微博达人勋

发表于 2023-2-20 20:23:41 | 显示全部楼层
付亚男 发表于 2022-11-21 11:59
单纯从ECV的值来判断分型的好坏是不合理的,因为ECV只考察类内的相似性,不考察类与类之间的差异性,如此一 ...

一般来言,是应该随着分类数的增加而增加,但也存在分类数变多后ECV减少
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新浪微博达人勋

发表于 2023-6-25 21:56:00 | 显示全部楼层
请教楼主,T-mode PCA和传统的EOF或者PCA有什么不同呢,为什么做天气分型只有空间模态,而没有时间系数(PC)的信息呢
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新浪微博达人勋

发表于 2023-6-30 10:41:02 | 显示全部楼层
请教一下楼主,这个cost733能用站点数据开展分型吗?还是说只能用era或fnl格点数据分型
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新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2023-7-4 16:17:48 | 显示全部楼层
jlbb002 发表于 2023-6-30 10:41
请教一下楼主,这个cost733能用站点数据开展分型吗?还是说只能用era或fnl格点数据分型

我只用过nc数据,其他类型不太清楚,可以试试看
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