关于在ubuntu12.04下安装WRF的问题

nanerhebu

如题，我先安装了NCL6.1.0
然后在软件中心安装了netcdf-bin 1:4.1.1-6
然后我又去官网下载，把netcdf 4.1.3安装在 /主文件夹/软件/netcdf/ 下

然后，我按照ztftom的帖子搞定ubuntu:单机安装WRF，选择Linux i486 i586 i686, gfortran compiler with gcc  (serial) 安装WRF 3.4

此时，终端此时提示 /主文件夹/软件/netcdf/include/ 下没有netcdf.inc 文件
于是我在终端输入
$ whereis netcdf.inc
发现在/usr/include/目录下有同样名为netcdf.inc的文件。
此时输入
$ncdump

终端返回
……
netcdf library version 4.1.1 of Nov  7 2011 11:30:05 $
不是4.1.3，但是我这里没有管

然后我就把那个文件复制到 /主文件夹/软件/netcdf/include/ 目录下，再次尝试./configure安装WRF 3.4

问题出在这里，终端返回：
Configuration successful. To build the model type compile .
------------------------------------------------------------------------
testing for fseeko and fseeko64
fseeko64 is supported
------------------------------------------------------------------------

# Settings for Linux i486 i586 i686, gfortran compiler with gcc  (serial)
#
DMPARALLEL      =       # 1
OMPCPP          =       # -D_OPENMP
OMP             =       # -fopenmp
OMPCC           =       # -fopenmp
SFC             =       gfortran
SCC             =       gcc
CCOMP           =       gcc
DM_FC           =       mpif90 -f90=$(SFC)
DM_CC           =       mpicc -cc=$(SCC)
FC              =        $(SFC)
CC              =       $(SCC) -DFSEEKO64_OK
LD              =       $(FC)
RWORDSIZE       =       $(NATIVE_RWORDSIZE)
PROMOTION       =       # -fdefault-real-8  # uncomment manually
ARCH_LOCAL      =       -DNONSTANDARD_SYSTEM_SUBR
CFLAGS_LOCAL    =       -w -O3 -c -DLANDREAD_STUB
LDFLAGS_LOCAL   =
CPLUSPLUSLIB    =      
ESMF_LDFLAG     =       $(CPLUSPLUSLIB)
FCOPTIM         =       -O3 -ftree-vectorize -ftree-loop-linear -funroll-loops
FCREDUCEDOPT        =       $(FCOPTIM)
FCNOOPT         =       -O0
FCDEBUG         =       # -g $(FCNOOPT)
FORMAT_FIXED    =       -ffixed-form
FORMAT_FREE     =       -ffree-form -ffree-line-length-none
FCSUFFIX        =      
BYTESWAPIO      =       -fconvert=big-endian -frecord-marker=4
FCBASEOPTS_NO_G =       -w $(FORMAT_FREE) $(BYTESWAPIO)
FCBASEOPTS      =       $(FCBASEOPTS_NO_G) $(FCDEBUG)
MODULE_SRCH_FLAG =
TRADFLAG        =      -traditional
CPP             =      /lib/cpp -C -P
AR              =      ar
ARFLAGS         =      ru
M4              =      m4 -B 14000
RANLIB          =      ranlib
CC_TOOLS        =      $(SCC)

###########################################################
######################
# POSTAMBLE

FGREP = fgrep -iq

ARCHFLAGS       =    $(COREDEFS) -DIWORDSIZE=$(IWORDSIZE) -DDWORDSIZE=$(DWORDSIZE) -DRWORDSIZE=$(RWORDSIZE) -DLWORDSIZE=$(LWORDSIZE) \
                     $(ARCH_LOCAL) \
                     $(DA_ARCHFLAGS) \
                       \
                       \
                      -DNETCDF \
                       \
                       \
                       \
                       \
                       \
                       \
                       \
                       \
                      -DUSE_ALLOCATABLES \
                      -DGRIB1 \
                      -DINTIO \
                      -DLIMIT_ARGS \
                      -DCONFIG_BUF_LEN=$(CONFIG_BUF_LEN) \
                      -DMAX_DOMAINS_F=$(MAX_DOMAINS) \
                      -DMAX_HISTORY=$(MAX_HISTORY) \
                      -DNMM_NEST=$(WRF_NMM_NEST)
CFLAGS          =    $(CFLAGS_LOCAL)   \
                      -DMAX_HISTORY=$(MAX_HISTORY)
FCFLAGS         =    $(FCOPTIM) $(FCBASEOPTS)
ESMF_LIB_FLAGS  =   
# ESMF 5 -- these are defined in esmf.mk, included above
ESMF_IO_LIB     =    -L$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/esmf_time_f90 -lesmf_time
ESMF_IO_LIB_EXT =    -L$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/esmf_time_f90 -lesmf_time
INCLUDE_MODULES =    $(MODULE_SRCH_FLAG) \
                     $(ESMF_MOD_INC) $(ESMF_LIB_FLAGS) \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/main \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_netcdf \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_int \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/frame \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/share \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/phys \
                      -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/chem -I$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/inc \
                      -I$(NETCDFPATH)/include \
                     
REGISTRY        =    Registry

LIB_BUNDLED     = \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/fftpack/fftpack5/libfftpack.a \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_grib1/libio_grib1.a \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_grib_share/libio_grib_share.a \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_int/libwrfio_int.a \
                      $(ESMF_IO_LIB) \
                       \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/frame/module_internal_header_util.o \
                      $(WRF_SRC_ROOT_DIR)/frame/pack_utils.o

LIB_EXTERNAL    = \
                      -L$(WRF_SRC_ROOT_DIR)/external/io_netcdf -lwrfio_nf -L/home/nanerhebu/软件/netcdf/lib  -lnetcdf   

LIB             =    $(LIB_BUNDLED) $(LIB_EXTERNAL) $(LIB_LOCAL)
LDFLAGS         =    $(OMP) $(FCFLAGS) $(LDFLAGS_LOCAL)
ENVCOMPDEFS     =   
WRF_CHEM        =        0
CPPFLAGS        =    $(ARCHFLAGS) $(ENVCOMPDEFS) -I$(LIBINCLUDE) $(TRADFLAG)
NETCDFPATH      =    /home/nanerhebu/软件/netcdf
PNETCDFPATH     =   

bundled:  wrf_ioapi_includes wrfio_grib_share wrfio_grib1 wrfio_int esmf_time fftpack
external:  wrfio_nf   gen_comms_serial module_dm_serial $(ESMF_TARGET)

######################
------------------------------------------------------------------------
Settings listed above are written to configure.wrf.
If you wish to change settings, please edit that file.
If you wish to change the default options, edit the file:
     arch/configure_new.defaults

然后就没有反应了，WRF并没有安装好。请问接下来应该如何操作呢？是不是因为netcdf.inc不能这样简单地复制过去呢？

nanerhebu

望各位前辈指点迷津

nanerhebu

问题解决了，卸载软件中心的netcdf-bin，手动安装netcdf4.1.1就没有错误了
4.1.3始终有两个错误，不知道该怎么解决，暂时忽略

stonesong

我就比你更悲催，出现你的问题之后，我又自己装netcdf，结果configure出现：error: Can't find or link to the hdf5 library. Use --disable-netcdf-4, or see config.log for errors.

stonesong

error: Can't find or link to the hdf5 library. Use --disable-netcdf-4, or see config.log for errors.解决办法是
#./configure --disable-netcdf-4 --prefix=/home/stonesong/wrf/netcdf

liy72427

stonesong 发表于 2014-12-11 15:38
error: Can't find or link to the hdf5 library. Use --disable-netcdf-4, or see config.log for errors. ...

太感谢了，安装netcdf遇到了同样得问题，用你得办法解决了