LINUX下安装NETCDF库及NCL

deecoct

                               
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如果你是学气象的，那么NetCDF和NCL的安装应该是必备的，下次遇到安装不要动不动就叫个会使Linux的男生帮你啦，其实过程很简单，只是当你怕在先而自己又不动手，那么及时帮你装好了接下来怎么用又得把你急得半死。
说明：系统是Ubuntu Linux 12.10，不是天煞的WINDOWS… WINDOWS是聊QQ看电影做其他事情的天堂… 作为一个科学工作者编程序转模式神马的请在Linux系统下干好么…

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NETCDF的安装

我觉得安装这类库神马的东西就装在系统默认(/usr/local)路径下吧，这样做的好处是你还不用额外设置环境变量，实在不喜欢装在/home文件夹下，/home文件夹我是专门放各种自己的projects跟models的

1. 下载，点这里。注意版本是4.1.3，NetCDF在4.1.3之后的版本都是把C/Fortran分开的，我安装新版本一直没装成功…所以就将就着用4.1.3吧，至少比学校大型机上的版本已经超出不知道几代了。
2. 把安装包放在/home文件夹下解压，进入解压后的文件夹即 cd netcdf-4.1.3
3. sudo ./configure –disable-netcdf-4 注意disable netcdf-4 目前看来是必须的，你要这么想，反正现在的模式也都用不上这么高级的库，sudo的意思是获取管理员权限，因为默认路径是装在系统文件夹下的，必须获得权限才能往里面安装。输入这行命令后会让你输入密码。你也可以把sudo放在第6步之前，因为正式往系统文件夹下装东西是在第6步。
4. make check
5. make
6. make install

不出意外的话应该安装成功了。这个时候，可以使用ncdump命令来检测NETCDF是否安装成功。如果netcdf安装成功，会返回：
ncdump [-c|-h] [-v ...] [[-b|-f] [c|f]] [-l len] [-n name] [-p n[,n]] [-k] [-x] [-s] [-t] [-w] file 等等等等

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NCL的安装

先说两句，目前用NCL的人真是越来越多了啊… 但是普遍现象是很多人长期在WINDOWS下用了GrADS后潜意识设定NCL也应该是这样，NCL在WINDOWS下确实能装，但是过程非常麻烦，而且像我这种本身就反感在WINDOWS下装这种软件的人是绝对不允许在我的开始菜单里看到一大堆cygwin的图标，当年还不会LINUX的时候实在对GrADS那个巨丑的小乌龟图标心有余悸啊。好了，废话不多说鸟，切入正题。

1. 下载，点这里。注意版本是6.1.2最新版，网盘里集全了所有机器版本，至于你应该装哪个版本，在命令行里敲 uname -a 后，眼睛扫到最后，对于一般PC来说，如果你是x86_64的，那就选择Debian x86_64 gcc445那个下载，如果你是i686，那就选择Debian i686 gcc445那个下载。下面以x86_64的版本为例。
2. 首先把下载好的压缩包放在/home文件夹底下，然后 gunzip ~/ncl_ncarg-6.1.2.Linux_Debian6.0_x86_64_nodap_gcc445.tar.gz
3. cd /usr/local 即进入系统默认安装的文件夹下。
4. sudo tar -xvf ~/ncl_ncarg-6.1.2.Linux_Debian6.0_x86_64_nodap_gcc445.tar 以管理员权限解压，输入后会让你输入密码
5. 回到/home文件夹下，设置环境变量。 gedit .bashrc 打开后在最后加入
export NCARG_ROOT=/usr/local
export PATH=/usr/local/bin:$PATH
6. source .bashrc

至此安装结束，测试下 ncl –version 即可知道是否安装成功。秀一个我在季风动力学课程的一个作业吧，点我下载整个文件夹，用NCAR/NCEP再分析资料画的一个东亚季风区OLR图，四个子图分别是4-7月份长期平均分布。OLR的值越低表示该区域对流活动越强，其中3个低值中心：孟加拉湾中、北部，菲律宾附近和青藏高原高原大致表示了赤道幅合带（ITCZ）的位置，为亚洲季风环流提供了大尺度环流背景。把olr文件夹放在/home下面后 cd olr, 然后 ncl olr.ncl，看看在/plot文件夹下是否有pdf文档生成，如有，比较是否与本文主题图片一样。

原文地址：http://deecoct.com/14972.love欢迎来我博客访问。

張顧.煒Zane

make[3]: *** [install-libLTLIBRARIES] Error 1
make[3]: Leaving directory `/gpfs/fs1/home/student/zane0816/models/netcdf/fortran'
make[2]: *** [install-am] Error 2
make[2]: Leaving directory `/gpfs/fs1/home/student/zane0816/models/netcdf/fortran'
make[1]: *** [install] Error 2
make[1]: Leaving directory `/gpfs/fs1/home/student/zane0816/models/netcdf/fortran'
make: *** [install-recursive] Error 1

楼主你好。照你的方法安装，在make install 出现上面几行。。。求助。。。{:eb522:}
我是在大型机里装的。。

shannuist33

好东西，受用了

qq79242943

学习了     学习之路好长啊

bjj948

谢谢分享，

不过，
./configure –disable-netcdf-4

这个disable了，对有些比较挑剔（fancy）的气候模式（如RegCM4.3）可能就行不通了。

读读http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=12998下的第二个文件，可能能避免这个disable。

deecoct

張顧.煒Zane 发表于 2013-4-3 15:05

                               
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make[3]: ***  Error 1
make[3]: Leaving directory `/gpfs/fs1/home/student/zane0816/models/netcdf/for ...

你在大型机上安装就得修改安装路径啦  --prefix 什么的  不过话说南信大的大型机上本来就有netcdf啊 你折腾啥呢 只要修改个环境变量路径就ok了

taxueyueming

请问6.1.2版中图片周围多余的空白您是怎样去掉的，看图的样子貌似是没有什么空白的，我用6.1.2时就有这个问题，而6.0.0没有，期待您的回答

zsumore

如果用centos或者scientific linux，装这2个东西就是1个命令的事情.

花容天下重莲

楼主很强悍啊，谢谢楼主

bjj948

zsumore 发表于 2013-4-19 00:39

                               
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如果用centos或者scientific linux，装这2个东西就是1个命令的事情.

对，是个好方法。

提醒一下：以上是用gcc等装的，要是想与ifort配，还得再装。