PGI安装与问题汇总

天目神眉

下文转自WRF-China以及中国气象数值模式联盟,希望能帮助到大家！

PGI安装
首先本人安装的软件和系统环境：
操作系统：CentOS 5.2 (redhat 公司的社区服务器版）32位系统性
Fortran编译器：PGI 7.07版本 32位 ； NETCDF 3.6.2版本  ; NCAR GRAPHIC 4.0

• 首先安装PGI
  

下载pgilinux-702.tar.gz 解压后址接运行./install 然后按相关提示操作即可

• 安装NCARG  直接解压即可，并把其内容移到在/usr/local/ncarg（当然要先建ncarg这个目录）
• 安装NETCDF
  

先下载NETCDF软件包，然后tar解压，进入到解压后的该文件夹后
先配置若罔闻：（注意要指定pgi编译器编译NETCDF）
env CC=pgcc CFLAGS="-O2 -Msignextend -V" FC=pgf90 F90=pgf90 FFLAGS="-O2 -w -V"  \
CXX=pgCC CPPFLAGS="-DNDEBUG -DpgiFortran" ./configure --prefix=你的安装目录
完成后
make
make install
即可安装完成
注意：安装完以上的软件后，把它们的可执行文件路径加进你的系统环境变量中，可以在你的根目录下或用户目录下的.bashrc文件中增加。

问题汇总
给所有挣扎在安装WRF泥淖中的朋友们

By:SJ

网 上有很多指导安装WRF及其组件的文章，也有很多帮助解决安装过程中各种困难的帖子，但大多分散且不系统，下面我就以过来人的身份把我在PC上安装WRF 的步骤及遇到的各种问题和答案放在模式联盟论坛上，希望能帮助那些正在挣扎于安装WRF泥淖中的各位，同时也纪念下我之前所经历的这种痛苦，安装平台 fedora 8
5 n% U v% @$ P) a& a
2，所需的各种组件：气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛) `. m, Y7 E9 [
(1) PGI 7.15 netcdf4.0 NCL(== ncarg) # 其实ifort的性能比PGI更好，但是其他的都过了，只在安装WRFDA
的过程中一直编译不过去，因此暂不介绍用ifort编译WRF的过程气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛- s! h8 E& \4 a/ K
(2) WRFV3.1 WPSV3.0.1 WRFDAV3.0.1(if needed)
(3) RIP4% m8 E. S/ b6 o9 a

在安装前需要说明的是，我在linux下自己建了两个目录，一个是Model，这是放源程序的（上述所有组件），另一个是Program，这个是放安装好的程序的Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟! b# ~2 V3 ?. T! Z/ Y3 S; j
3, 安装PGI

（1）解压缩PGI压缩包
      $cd /home/name/Model, \ x5 o- Z; P, b$ z* K; \
     $mkdir PGI
     $tar -xvf pgilinux-715.tar.gz -C PGI
     $cd PGI6 A3 I% T; @" _7 Q! n s1 F2 B8 }
     $./install   出现提示信息气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛  F8 q' f- M5 X% L; a3 e- j
        Do you accept these terms?[accept,decline]( M5 G8 t* c, n# V2 Y" J' P: v
        accept           www.mnmuc.org) {6 }; Z, F* U) m' V* ]
       1,single system install
       2,Network install
        1
       Install the ACML?[y/n]
        n3 Q) Z9 E8 L# [# x9 m
       Installation directory?[/opt/pgi]
        /home/name/Program/pgi
       Do you wish to install MPICH1?[y/n]www.mnmuc.org8 |. t5 k) ?/ F  q
        n5 c( x$ s8 b! ]3 g
       Do you want the files in the install directory to be read-only?[y/n]
        n
    install complete气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛$ h4 H: M1 h* k

把与安装版本相适应的license.dat拷贝到你安装的目录下Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟1 S- q$ a  u  t) Q  t) [( T% W
& e! T7 F! h% `
配置.bashrc里的环境变量气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛6 v h( G3 @2 z8 e
export PGI=/home/name/Program/pgi/linux86/7.1-5/
export MANPATH=$MANPATH: $PGI/man, {1 a2 |; e, N
export LM_LICENSE_FILE=/home/name/Program/pgi/license.dat
export PATH=$PATH: $PGI/bin

$source .bashrc
为了试验pgi是否安装成功，可以打如下命令0 h" ?1 R" d  }% ~  a
     $pgf90
如果有如下提示信息，说明已安装成功气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛7 K' B! K6 P2 Y, I8 ~5 f
     $pgf90-Warning-No files to process   
如果大家是在更高版本的fedora下装pgi，估计pgi的版本也会相应的升高，
4，安装netcdf
（1）解压netcdf-4.0压缩包
www.mnmuc.org  c/ s! J* {2 R& w T9 Z. q
$mkdir /home/name/Program/netcdf* O7 _, C  z2 k  B8 r( R, r% P
$cd /home/name/Model
$tar -xvf netcdf-4.0气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛9 {% T% k% l' z* X8 N5 S" j
$cd netcdf-4.09 p. C) s0 P" U% l1 t: {
$./configure --prefix=/home/name/Program/netcdf FC=pgf90
$make气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛 E% t- r# p* n  n7 p: b
$make install

配置.bashrc里的环境变量
$ E# a' l( q4 P# {
export NETCDF=/home/name/Program/netcdf
export NETCDF_LIB=$NETCDF/lib
export NETCDF_INC=$NETCDF/include
export PATH=$PATH: $NETCDF/bin
气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛 a# u/ ^8 N" M- ~, B
$source .bashrc
试验netcdf安装是否成功. ~" A- O3 g6 r  l  b5 N
$ncdump气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛 |# X( \- @5 Q! Z$ A
如果出现使用说明则说明安装成功Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟! m6 d$ E* w- }  m9 z  R* @2 y
www.mnmuc.org$ V, t$ W3 t* V: H6 S
5，安装ncl（目前的ncl已经集合了ncarg，所以大家没必要装ncarg）
在安装ncl之前，需要装三个外部库气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛" ~; y' Y; U, q- j7 K: m

$su
password:                     如果以root身份登陆可跳过此步
#rpm -i *.rpm                 *代表库名
安装好之后，开始安装ncl，如果从论坛ftp下载的ncl,解压出来的bin，include，lib可以直接放到/home/name/Program/ncl下即可
Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟5 u$ E6 R1 V* H7 n2 M3 c
配置.bashrc中关于ncl和ncarg的环境变量
export NCARG_ROOT=/home/name/Program/nclMeteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟6 z4 X5 o; q7 Y0 p0 Y
export NCARG_LIB=/home/name/Program/ncl/lib气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛: }* O4 k9 h% G i* S1 V
export NCARG_INC=/home/name/Program/ncl/include
export PATH=$PATH:/home/name/Program/ncl/bin q8 Q! b/ F* Y6 b# D
Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟& {. G/ S2 p# p5 l
$source .bashrc  m$ h0 Q6 ]* G
www.mnmuc.org8 g5 V8 ]: q% Z6 O; a) Q
如想试验安装是否成功
如进入程序就说明已经成功
6，安装WRFMeteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟) J5 Z" \3 l1 U  Y( O V
气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛  U$ P; G: Q7 U# x* G  }
在安装之前，请在.bashrc中配置环境变量
  export WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1
0 M# M# t) Y% j2 e6 m6 {/ j
然后按照http://mnmuc.org/thread-13-1-1.html里关于libg2c.so的解决办法（2）修改（务必）  r0 B1 K v: i
解压WRFV3.1压缩包
3 c. J/ {% ]- N  ?. D6 n) U* _0 l: n) C9 F
$cd /home/name/Program/WRFV3www.mnmuc.org. V! t# s: \6 N6 ~/ i  \0 A  {
$./configure
   7Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟7 H# }0 D# O  p* A7 T# }
$./compile em_real (这时要用到csh)气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛0 o. |, t* s0 o
  如果/WRFV3/test/em_real里有real.exe和wrf.exe说明WRF安装成功了
7，安装WPS
安装WPS前要先安装三个外部库，在以后识别GRIB2格式的数据时会用得到气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛& z3 q  n* k$ u

分别解压缩这三个压缩包www.mnmuc.org7 \# I* K1 w" Q0 ] S% M' E
$tar -xvf jasper-1.701.0.tar.gz
$tar -xvf libpng-1.2.12.tar.gzwww.mnmuc.org8 e3 s$ l! G9 e x
$tar -xvf zlib-1.2.3.tar.gz
然后开始安装
  password:           输入密码，如一开始就以root进入可跳过这步
#cd jasper-1.701.0
#makewww.mnmuc.org0 {9 L4 H( y! K  u5 k9 f- @0 I
#make install
#cd ..
#cd libpng-1.2.12
#./configureMeteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟* D/ |) D4 Q: U* G5 h
#make: q% U ^1 h9 R% v9 e1 B1 a
#make install
#cd ..
#cd zlib-1.2.3
#./configure气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛5 Z7 E6 Z4 D  H- ?: e# n
#makeMeteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟4 m$ ]& q4 e O4 n, u
#make install气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛3 x8 f) b8 K7 }" ^
#exit
现在可以安装WPS了
$cd /home/name/Model
$cd /home/name/Program/WPS
$vi configure.defaultswww.mnmuc.org6 f' |$ \0 y, i4 O) w  R
找到跟PGI compiler有关的那几项，分别是serial NO GRIB2, serial, DM parallel NO GRIB2, DM parallel气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛$ b1 Y: p; \) i6 j" A9 n
  修改其中的NCARG_LIBS2项，修改后的结果是：
    NCARG_LIBS2 = -L$(PGI)/lib -lpgftnrtl -lpgc \' Z8 n# L4 p8 a. U& a( P
                 -L/usr/lib/gcc/i386-redhat-linux/4.1.2 -lg2c         
  需要说明的是，并不是所有的系统都要这么改，修改的原则是与用户系统的路径一致即可，具体可通过进入/usr/lib后找关于gcc及子目录气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛2 L' b w3 s" ]* n( Q! `; @
  如果安装前已经打算以后只编译上述四项中的一项或几项，可相应修改，或者一次性全部改过来，一劳永逸8 j  r  ?9 Q0 J0 w3 g
  $vi preamble
修改NCARG_LIBS选项，修改后结果如下：; H1 D3 D- k3 {$ `" t4 ]% T  B8 y
    NCARG_LIBS = -L$(NCARG_ROOT)/lib -lncarg -lncarg_gks -lncarg_c \气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛- U3 _$ p8 v3 q  K2 t% \& h
                -L/usr/lib -lX11
如/usr目录下有X11R6则无须做任何改动气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛- ?' ?' I4 o7 f( q( ~& Y4 A
  这样安装WPS前的准备工作就做完了，下面开始正式安装
$cd ..
$./configure
8 {3 N0 o/ Z0 Q: h
$./compile
当目录下出现geogrid.exe, ungrib.exe, and metgrid.exe时，说明安装成功了气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛7 t8 x4 F7 F3 A& n5 z T0 s' d
气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛5 F. o& k D2 \' r6 f
8，安装WRFDA气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛$ Z" R, t6 O( R  d y1 N

安装WRFDAV3前要先装三个外部库bufr（如不用bufr格式的数据，可以不用装，这是3.1版本之前的WRFDA所不允许的），lapack，和blasMeteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟6 ^! p& l& C& V
Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟% N! Z  Q& l; Y) O9 }
$cd /home/name/ModelMeteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟! R0 i3 \$ W' r! |$ O
$tar -xvf WRFDAV3.TAR.gz -C /home/name/Program
$cd /home/name/Program气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛  i6 w" Y" P7 V3 W4 f
$mkdir BUFR1 E$ A, q: r* U/ |- P
$tar -xvf /home/name/Model/bufrlib.tar -C BUFRwww.mnmuc.org* u) R2 ?6 R  t! x$ a
$cd BUFR气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛# A; m' n0 n  h1 I3 r
$cpp -traditional -I. -C -DRECL1 wrdlen.F>wrdlen.f/ x6 R L' U% Z
$cpp -traditional -I. -C -DRECL1 irev.F>irev.f气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛! B: ^! e" W8 L$ }
$ksh /home/name/Program/WRFDA/var/scripts/compile_external/pgi_i386/setup_bufr7 y/ h! j6 N$ t
a- K
$cd ..
此时 bufr安装成功$ P  U' V( _" ^( Q3 W" }) D
$tar -xvf /home/name/Model/blas.tar ./气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛; K5 o. g$ f8 a- _4 A/ p* ]; |
$cd BLAS气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛9 t/ j( n% X4 D1 o% u- }# S j1 D% v. D
$ksh /home/name/Program/WRFDA/var/scripts/compile_external/pgi_i386/setup_blas气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛) k7 x: w% t, c; W/ q Q) u
$cd ..
blas安装成功
$cd lapack-3.1.1
$cp INSTALL/make.inc.LINUX ./make.inc
修改make.inc，把其中g77或关于fortran的文字全部改成pgf90，把OPT改成-O2 -r88 l R  M1 h1 g5 r4 k3 J
$ksh /home/name/Program/WRFDA/var/scripts/compile_external/pgi_i386/setup_lapack4 q& I- |, f. [/ G1 K
lapack安装成功气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛5 F! r- k1 T0 g
配置.bashrc环境变量Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟$ A0 Q0 I7 }) o. N
export BLAS=/home/name/Program/BLAS气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛- k; W$ {2 f L) [* g( F
export LAPACK=/home/name/Program/lapack-3.1.1气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛9 o  p, u1 |# Z3 `7 X
export BUFR=/home/name/Program/BUFR
export WRF_DA_CORE=1
$source .bashrc
& L4 G  D$ u: r/ k# b' ^, o1 C$ I* o
现在开始安装WRFDA
$cd /home/name/Program/WRFDA* J8 {8 Y3 z7 p6 F, h" Z- m
$./configure wrfda
$./compile all_wrfvar
如果/home/name/Program/WRFDA/var/da 里面有da_wrfvar.exe, da_update_bc.exe及它共26个.exe文件，那就说明WRFDA安装成功了
9， 安装RIP4Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟3 l$ R6 V. s7 ]# J

解压缩RIP4压缩包www.mnmuc.org6 s9 s# ~9 ?2 `& H# ^$ h: h
$tar -xvf /home/name/Model/RIP4 -C /home/name/Program/
$cd /home/name/Program/RIP4
$vi Makefile3 o3 g5 G" r% f4 F
把linux（第94行）项中的NETCDFLIB和NETCDFINC和LIBS改成相应目录0 N j, V: L' g$ G  S% t' N
$make linux气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛2 b  K; R( S2 J( a  V) E
如果生成rip, ripdp_mm5, ripdp_wrfarw等11个.exe文件则说明安装成功了。Meteorological Numerical Model Union of China (MNMUC) 中国气象数值模式联盟/ ^% [6 T; k' b9 q2 e: N
www.mnmuc.org7 |8 x$ q% p" ]7 W  I9 _
配置.bashrc环境变量
export PATH=$PATH: $RIP_ROOT

$source .bashrc

到此为止，WRF组件全部安装完成，剩下的就是设置各个组件的namelist并运行可执行程序了气象,数值,模式,气象数值模式,数值模式,气象模式,海洋模式,气候模式,WRF,MM5,Grapes,HYCOM,LICOM,同化,集合预报,模式联盟,模式论坛6 u; r. _3 ^& n" l  I! x
需要说明的是，不同的Linux版本可能略有不同，所以步骤上也可能有差别，如果有如此问题可以发帖，共同讨论www.mnmuc.org. @  s- e$ [. P2 X8 L9 J
# E, g/ H( q$ J v
水平有限，如有错误请指正……

mofangbao

可是你的链接地址是数值联盟的地址啊，奇怪啊  

传说中的谁

装过的说，不过早忘了。谢谢天目

天目神眉

传说中的谁 发表于 2011-9-29 10:11

                               
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装过的说，不过早忘了。谢谢天目

我想借你的喜气，得张卡玩玩

天目神眉

mofangbao 发表于 2011-9-29 10:09

                               
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可是你的链接地址是数值联盟的地址啊，奇怪啊

那是因为WRFCHIANA也是转自气象联盟的，呵呵，我已经加了，但是也有部分WRFCHINA的东西，感觉真的有用，就转了

兰溪之水

WRFCHINA~~

artmunich

这星期先学好教程，等下次去机房就在上面装上WRF，正好系统也是CentOS的

黎大页子

我安装了一次PGI，环境变量照着修改，但是继续安装NETCDF的时候，显示找不到pdf90。想问各位大神，问题究竟出在哪里？
还有，我的电脑是32位的，网上的资源和PGI官方网站上面都是64位的，32位PGI的很少见。有没有必要一定要安装32位的？对之后的安装有什么影响？求指教！

天目神眉

黎大页子 发表于 2011-10-10 10:03

                               
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我安装了一次PGI，环境变量照着修改，但是继续安装NETCDF的时候，显示找不到pdf90。想问各位大神，问题究竟 ...

额，我是在学校大型机上转的，PGI都已经装好了，所以很多细节不是很明白，期待高手出现，你自己也多尝试下吧！

黎大页子

天目神眉 发表于 2011-10-10 10:19

                               
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额，我是在学校大型机上转的，PGI都已经装好了，所以很多细节不是很明白，期待高手出现，你自己 ...

好吧，多谢鼓励，我继续苦逼的去尝试