请选择 进入手机版 | 继续访问电脑版
爱气象,爱气象家园! 

气象家园

 找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

新浪微博登陆

只需一步, 快速开始

搜索
查看: 5116|回复: 8

clm4.5 地表最后一个文件

[复制链接]

新浪微博达人勋

发表于 2016-2-10 16:41:34 | 显示全部楼层 |阅读模式

登录后查看更多精彩内容~

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册 新浪微博登陆

x
我在做clm4.5 地表最后一个文件的时候,总是生不成,遇到了下面的问题。
我的内存是够用的,就是mpi 的问题。

我也在.bashrc文件里面设置了mpi 的路径
终端下输入which mpirun 或者which mpiexec是正确的
/usr/local/mpi3-dynamic/bin/mpirun

在终端下输入mpirun 或者mpiexec 就是这样的
[mpiexec@ln1] set_default_values (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/ui/mpich/utils.c:1528): no e
xecutable provided[mpiexec@ln1] HYD_uii_mpx_get_parameters (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/ui/mpich/utils.c:173
9): setting default values failed[mpiexec@ln1] main (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/ui/mpich/mpiexec.c:153): error parsing par
ameters

这怎么改呢?
下面是地表的问题
我在mkmapdata.sh 里面设置mpirun  生成最后一个文件。slum文化出来下面的错误。
map_1km-merge-10min_HYDRO1K-merge-nomask_to_yang_nomask_aave_da_c160125.nc
   Source File is in UGRID format, dummy variable: landmesh
   Source Grid is a global grid
   Source Grid is an unstructured grid
   Destination File is in SCRIP format
   Destination Grid is a regional grid
   Destination Grid is a logically rectangular grid
   Regrid Method: conserve
   Pole option: NONE
   Ignore unmapped destination points
   Output weight file in NetCDF4 file format
   Norm Type: dstarea

===================================================================================
=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
=   PID 7423 RUNNING AT cn12078
=   EXIT CODE: 9
=   CLEANING UP REMAINING PROCESSES
=   YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES
===================================================================================
[proxy:0:0@cn12076] HYD_pmcd_pmip_control_cmd_cb (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/pm/pmiserv/p
mip_cb.c:885): assert (!closed) failed[proxy:0:0@cn12076] HYDT_dmxu_poll_wait_for_event (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/tools/demux
/demux_poll.c:76): callback returned error status[proxy:0:0@cn12076] main (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/pm/pmiserv/pmip.c:206): demux engine
error waiting for eventsrun: error: cn12076: task 0: Exited with exit code 7
srun: First task exited 60s ago
srun: task 1: running
srun: task 0: exited abnormally
srun: task 2: exited
srun: Terminating job step 1811582.0
srun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish.
srun: error: Timed out waiting for job step to complete
[mpiexec@cn12076] HYDT_bscu_wait_for_completion (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/tools/bootstr
ap/utils/bscu_wait.c:76): one of the processes terminated badly; aborting[mpiexec@cn12076] HYDT_bsci_wait_for_completion (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/tools/bootstr
ap/src/bsci_wait.c:23): launcher returned error waiting for completion[mpiexec@cn12076] HYD_pmci_wait_for_completion (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/pm/pmiserv/pmi
serv_pmci.c:218): launcher returned error waiting for completion[mpiexec@cn12076] main (../../../../mpich-3.1.3/src/pm/hydra/ui/mpich/mpiexec.c:344): process manag
er error waiting for completionError status returned from mkmapdata script



这到底是什么原因呢?实在是解决不了了,各位给个意见吧!


密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

发表于 2016-2-11 10:09:21 | 显示全部楼层

回帖奖励 +10 金钱

没做过陆面模式,也没弄懂你的问题啊  你是串行能跑 并行跑不起来么
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2016-2-11 11:38:14 | 显示全部楼层
并行的,现在知道了,是因为计算节点的mpirun位置跟登陆节点不一样
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

发表于 2016-12-7 20:26:05 | 显示全部楼层
zhangqh 发表于 2016-2-11 11:38
并行的,现在知道了,是因为计算节点的mpirun位置跟登陆节点不一样

你好,我也遇到了相似的问题,想请教一下你怎么解决的?
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

发表于 2016-12-7 20:31:39 | 显示全部楼层
而且我登录的节点和运行的节点是不一样的,运行的哪个节点是不可以登录的只能用来运行,我就想请问一下怎么编写任务
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2016-12-8 08:52:45 | 显示全部楼层
这个应该还是要根据自己的服务器来设置
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

发表于 2017-3-23 21:44:36 | 显示全部楼层
楼主这个问题解决了么
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

 楼主| 发表于 2017-3-24 08:36:45 | 显示全部楼层
解决了 是因为我的提交方式不对,最后一个文件很大 需要用并行提交。
密码修改失败请联系微信:mofangbao

新浪微博达人勋

发表于 2018-4-10 21:48:14 | 显示全部楼层
您好,能不能请您贴一下您的mkmapdata.sh,  还有递交这个脚本任务的命令呢,我卡在这好多天了,期待前辈指导
密码修改失败请联系微信:mofangbao
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册 新浪微博登陆

本版积分规则

Copyright ©2011-2014 bbs.06climate.com All Rights Reserved.  Powered by Discuz! (京ICP-10201084)

本站信息均由会员发表,不代表气象家园立场,禁止在本站发表与国家法律相抵触言论

快速回复 返回顶部 返回列表