wrf并行openmpi

小温馨岁月

使用的mpi是openmpi，wrf编译时选择的是dampar，wps也是dampar
在mpirun -np 108 ./wrf.exe后，并未在节点下找到计算的苗头啊，好像并没有进行计算，这是怎么回事呢？

小温馨岁月

run了之后就只出现这样的信息
starting wrf task           15  of          108
starting wrf task           73  of          108
starting wrf task           94  of          108
starting wrf task           35  of          108
starting wrf task           57  of          108
starting wrf task          101  of          108
starting wrf task           99  of          108
starting wrf task           60  of          108
starting wrf task           30  of          108
starting wrf task           21  of          108
starting wrf task           93  of          108
starting wrf task           85  of          108
starting wrf task           12  of          108
starting wrf task            1  of          108
starting wrf task           92  of          108
starting wrf task           54  of          108
starting wrf task           44  of          108
starting wrf task           88  of          108
starting wrf task           55  of          108
starting wrf task           40  of          108
starting wrf task           97  of          108
starting wrf task           31  of          108
starting wrf task           37  of          108
starting wrf task           20  of          108
starting wrf task           43  of          108
starting wrf task           41  of          108
starting wrf task           50  of          108
starting wrf task           14  of          108
starting wrf task           58  of          108
starting wrf task           45  of          108
starting wrf task           72  of          108
starting wrf task           27  of          108
starting wrf task            6  of          108
starting wrf task           53  of          108
starting wrf task           48  of          108
starting wrf task           96  of          108
starting wrf task           38  of          108
starting wrf task          102  of          108
starting wrf task           71  of          108
starting wrf task           16  of          108
starting wrf task           33  of          108
starting wrf task            0  of          108
starting wrf task           51  of          108
starting wrf task           36  of          108
starting wrf task           95  of          108
starting wrf task           49  of          108
starting wrf task           80  of          108
starting wrf task          107  of          108
starting wrf task           74  of          108
starting wrf task            5  of          108
starting wrf task           61  of          108
starting wrf task           82  of          108
starting wrf task          104  of          108
starting wrf task           29  of          108
starting wrf task           13  of          108
starting wrf task           86  of          108
starting wrf task           70  of          108
starting wrf task          103  of          108
starting wrf task           81  of          108
starting wrf task           28  of          108
starting wrf task           89  of          108
starting wrf task           64  of          108
starting wrf task           77  of          108
starting wrf task           83  of          108
starting wrf task           11  of          108
starting wrf task           22  of          108
starting wrf task           98  of          108
starting wrf task            4  of          108
starting wrf task           39  of          108
starting wrf task           65  of          108
starting wrf task           68  of          108
starting wrf task           59  of          108
starting wrf task           42  of          108
starting wrf task           19  of          108
starting wrf task           56  of          108
starting wrf task          105  of          108
starting wrf task            8  of          108
starting wrf task           62  of          108
starting wrf task           52  of          108
starting wrf task           47  of          108
starting wrf task           67  of          108
starting wrf task           66  of          108
starting wrf task           24  of          108
starting wrf task            9  of          108
starting wrf task           10  of          108
starting wrf task           32  of          108
starting wrf task           23  of          108
starting wrf task           87  of          108
starting wrf task           91  of          108
starting wrf task           26  of          108
starting wrf task           46  of          108
starting wrf task            3  of          108
starting wrf task           75  of          108
starting wrf task           78  of          108
starting wrf task           34  of          108
starting wrf task           25  of          108
starting wrf task           17  of          108
starting wrf task           76  of          108
starting wrf task            7  of          108
starting wrf task           79  of          108
starting wrf task            2  of          108
starting wrf task           18  of          108
starting wrf task          100  of          108
starting wrf task           84  of          108
starting wrf task          106  of          108
starting wrf task           69  of          108
starting wrf task           63  of          108
starting wrf task           90  of          108
rsl.error里面是这样的
taskid: 60 hostname: c04n01
module_io_quilt_old.F        2931 F

小温馨岁月

换成mpirun -np 12 ./wrf.exe后（一个节点下是12个核）
starting wrf task            5  of           12
starting wrf task            8  of           12
starting wrf task            0  of           12
starting wrf task            7  of           12
starting wrf task            2  of           12
starting wrf task            3  of           12
starting wrf task            6  of           12
starting wrf task           10  of           12
starting wrf task           11  of           12
starting wrf task            9  of           12
starting wrf task            1  of           12
starting wrf task            4  of           12
--------------------------------------------------------------------------
MPI_ABORT was invoked on rank 11 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 1.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 3 with PID 483 on
node c04n01 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
[c04n01:00466] 9 more processes have sent help message help-mpi-api.txt / mpi-abort
[c04n01:00466] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages
这是什么错误呢？rsl.out
Quilting with   1 groups of   0 I/O tasks.
Ntasks in X            3, ntasks in Y            4
Linear vertical interpolation is recommended with input vertical resolution this coarse, changing lagrange_order to 1
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      2, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      2, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      2, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: RRTMG radiation is not used, setting:  o3input=0 to avoid data pre-processing
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      5
WRF V3.8.1 MODEL
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            0           0           0           0
ims,ime,jms,jme            0           0           0           0
ips,ipe,jps,jpe            0          -1           0          -1
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1,                 121888 bytes allocated
-------------- FATAL CALLED ---------------
FATAL CALLED FROM FILE:  set_timekeeping.F  LINE:     102
WRFU_TimeSet(startTime) FAILED   Routine returned error code =           -1
-------------------------------------------
taskid: 1 hostname: c04n01

rsl.error
taskid: 1 hostname: c04n01
module_io_quilt_old.F        2931 F
Quilting with   1 groups of   0 I/O tasks.
Ntasks in X            3, ntasks in Y            4
Linear vertical interpolation is recommended with input vertical resolution this coarse, changing lagrange_order to 1
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      2, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      2, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      2, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: RRTMG radiation is not used, setting:  o3input=0 to avoid data pre-processing
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      5
WRF V3.8.1 MODEL
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            0           0           0           0
ims,ime,jms,jme            0           0           0           0
ips,ipe,jps,jpe            0          -1           0          -1
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1,                 121888 bytes allocated
-------------- FATAL CALLED ---------------
FATAL CALLED FROM FILE:  set_timekeeping.F  LINE:     102
WRFU_TimeSet(startTime) FAILED   Routine returned error code =           -1
-------------------------------------------

又是那隻貓

你需要提交到节点上去

小温馨岁月

又是那隻貓 发表于 2017-5-2 20:49
你需要提交到节点上去

那就是说是因为我没有提交到节点上，而不是我的openmpi有问题？

小温馨岁月

又是那隻貓 发表于 2017-5-2 20:49
你需要提交到节点上去

No executable was specified on the mpirun command line.

Aborting
这样的错误是因为什么呢？

lgz

提交到节点上

小温馨岁月

又是那隻貓 发表于 2017-5-2 20:49
你需要提交到节点上去

已解决，谢谢您的指教

小温馨岁月

lgz 发表于 2017-5-3 14:16
提交到节点上

已解决，谢谢

liu541226

小温馨岁月 发表于 2017-5-3 21:52
已解决，谢谢

你好 你这问题怎么解决的？我也遇到了同样的问题 搞不懂怎么回事？