求助！运行wrf.exe后出现错误，请问怎么修改？谢谢！

physzw

运行./wrf.exea时错误提示：段错误(吐核)
ulimit -s unlimited后再运行./wrf.exe，没有错误提示，生成了wrfout_d01_2017-01-01_00:00:00。

但是运行mpiexec -n 4 ./wrf.exe后提示错误：
[etprc@localhost em_real]$ mpiexec -n 4 ./wrf.exe
starting wrf task            0  of            4
starting wrf task            1  of            4
starting wrf task            2  of            4
starting wrf task            3  of            4
rank 3 in job 3  localhost.localdomain_35893   caused collective abort of all ranks
  exit status of rank 3: killed by signal 11

下面是rsl.error的内容：
taskid: 0 hostname: localhost.localdomain
module_io_quilt_old.F        2931 F
Quilting with   1 groups of   0 I/O tasks.
Ntasks in X            2, ntasks in Y            2
--- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
Need MYNN PBL for icloud_bl = 1, resetting to 0
--- NOTE: RRTMG radiation is not used, setting:  o3input=0 to avoid data pre-processing
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
WRF V3.8 MODEL
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            1          71           1          61
ims,ime,jms,jme           -4          42          -4          37
ips,ipe,jps,jpe            1          35           1          30
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1,               35845372 bytes allocated
  med_initialdata_input: calling input_input
Timing for processing wrfinput file (stream 0) for domain        1:    0.05394 elapsed seconds
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33 CATEGORIES           2 SEASONS WATER CATEGORY =           17 SNOW CATEGORY =           15
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES
Skipping over LUTYPE = USGS
LANDUSE TYPE = MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH FOUND          20 CATEGORIES
INPUT SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS
SOIL TEXTURE CLASSIFICATION = STAS FOUND          19 CATEGORIES
Timing for Writing wrfout_d01_2017-01-01_00:00:00 for domain        1:    0.25651 elapsed seconds
Timing for processing lateral boundary for domain        1:    0.02361 elapsed seconds

namelist.input的内容：
&time_control
run_days                            = 1,
run_hours                           = 0,
run_minutes                         = 0,
run_seconds                         = 0,
start_year                          = 2017, 2017, 2017,
start_month                         = 01,   01,   01,
start_day                           = 01,   01,   01,
start_hour                          = 00,   00,   00,
start_minute                        = 00,   00,   00,
start_second                        = 00,   00,   00,
end_year                            = 2017, 2017, 2017,
end_month                           = 01,   01,   01,
end_day                             = 02,   01,   02,
end_hour                            = 00,   00,   00,
end_minute                          = 00,   00,   00,
end_second                          = 00,   00,   00,
interval_seconds                    = 21600
input_from_file                     = .true.,.true.,.true.,
history_interval                    = 180,  60,   60,
frames_per_outfile                  = 1000, 1000, 1000,
restart                             = .false.,
restart_interval                    = 5000,
io_form_history                     = 2
io_form_restart                     = 2
io_form_input                       = 2
io_form_boundary                    = 2
debug_level                         = 0
/

&domains
time_step                           = 180,
time_step_fract_num                 = 0,
time_step_fract_den                 = 1,
max_dom                             = 1,
e_we                                = 71,    79,   79,
e_sn                                = 61,    79,   79,
e_vert                              = 30,    30,    30,
p_top_requested                     = 5000,
num_metgrid_levels                  = 32,
num_metgrid_soil_levels             = 4,
dx                                  = 81000, 27000,  9000,
dy                                  = 81000, 27000,  9000,
grid_id                             = 1,     2,     3,
parent_id                           = 0,     1,     2,
i_parent_start                      = 1,     21,    32,
j_parent_start                      = 1,     18,    26,
parent_grid_ratio                   = 1,     3,     3,
parent_time_step_ratio              = 1,     3,     3,
feedback                            = 1,
smooth_option                       = 0
/

&physics
mp_physics                          = 3,     3,     3,
ra_lw_physics                       = 1,     1,     1,
ra_sw_physics                       = 1,     1,     1,
radt                                = 30,    30,    30,
sf_sfclay_physics                   = 1,     1,     1,
sf_surface_physics                  = 2,     2,     2,
bl_pbl_physics                      = 1,     1,     1,
bldt                                = 0,     0,     0,
cu_physics                          = 1,     1,     0,
cudt                                = 5,     5,     5,
isfflx                              = 1,
ifsnow                              = 1,
icloud                              = 1,
surface_input_source                = 3,
num_soil_layers                     = 4,
num_land_cat                        = 21,
sf_urban_physics                    = 0,     0,     0,
/

&fdda
/

&dynamics
w_damping                           = 0,
diff_opt                            = 1,      1,      1,
km_opt                              = 4,      4,      4,
diff_6th_opt                        = 0,      0,      0,
diff_6th_factor                     = 0.12,   0.12,   0.12,
base_temp                           = 290.
damp_opt                            = 0,
zdamp                               = 5000.,  5000.,  5000.,
dampcoef                            = 0.2,    0.2,    0.2
khdif                               = 0,      0,      0,
kvdif                               = 0,      0,      0,
non_hydrostatic                     = .true., .true., .true.,
moist_adv_opt                       = 1,      1,      1,     
scalar_adv_opt                      = 1,      1,      1,     
/

&bdy_control
spec_bdy_width                      = 5,
spec_zone                           = 1,
relax_zone                          = 4,
specified                           = .true., .false.,.false.,
nested                              = .false., .true., .true.,
/

&grib2
/

&namelist_quilt
nio_tasks_per_group = 0,
nio_groups = 1,
/

packard

4核并行的话，rsl.error应该有四个。 rsl.error.0000和rsl.error.0003都看了吗？
发生任何问题，我一般都习惯在那个目录 ls -ltr，看看最新生成的文件，然后挨个文件看看，看看有没有报错信息。
实在找不到的话，可以在namelist 把 debug_level 提高到 300 之类的，然后报错文件会写得比较详细。

physzw

packard 发表于 2018-2-22 11:36
4核并行的话，rsl.error应该有四个。 rsl.error.0000和rsl.error.0003都看了吗？
发生任何问题，我一般都 ...

谢谢！rsl.error.0001/rsl.error.0002/rsl.error.0003的内容一样，都是：
taskid: 2 hostname: localhost.localdomain
module_io_quilt_old.F        2931 F
Quilting with   1 groups of   0 I/O tasks.
Ntasks in X            2, ntasks in Y            2
--- WARNING: traj_opt is zero, but num_traj is not zero; setting num_traj to zero.
--- NOTE: sst_update is 0, setting io_form_auxinput4 = 0 and auxinput4_interval = 0 for all domains
--- NOTE: grid_fdda is 0 for domain      1, setting gfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: both grid_sfdda and pxlsm_soil_nudge are 0 for domain      1, setting sgfdda interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: obs_nudge_opt is 0 for domain      1, setting obs nudging interval and ending time to 0 for that domain.
--- NOTE: bl_pbl_physics /= 4, implies mfshconv must be 0, resetting
Need MYNN PBL for icloud_bl = 1, resetting to 0
--- NOTE: RRTMG radiation is not used, setting:  o3input=0 to avoid data pre-processing
--- NOTE: num_soil_layers has been set to      4
WRF V3.8 MODEL
*************************************
Parent domain
ids,ide,jds,jde            1          71           1          61
ims,ime,jms,jme           -4          42          24          66
ips,ipe,jps,jpe            1          35          31          61
*************************************
DYNAMICS OPTION: Eulerian Mass Coordinate
   alloc_space_field: domain            1,               36653836 bytes allocated
  med_initialdata_input: calling input_input
INPUT LandUse = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH"
LANDUSE TYPE = "MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH" FOUND          33 CATEGORIES           2 SEASONS WATER CATEGORY =           17 SNOW CATEGORY =           15
INITIALIZE THREE Noah LSM RELATED TABLES

packard

physzw 发表于 2018-2-22 13:47
谢谢！rsl.error.0001/rsl.error.0002/rsl.error.0003的内容一样，都是：
taskid: 2 hostname: localhos ...

这样。。。
因为我看报错说Rank 3错了，以为0003的会不一样。

那有没有 ls -ltr 看看最新的文件？有没有什么发现？
又有没有把namelist里面的debug_level 提高？

physzw

packard 发表于 2018-2-22 11:36
4核并行的话，rsl.error应该有四个。 rsl.error.0000和rsl.error.0003都看了吗？
发生任何问题，我一般都 ...

改成300后，报错文件确实非常详细：
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QCLOUD memorder XEZ Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QCLOUD memorder YSZ
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           70          29           5
ps           29           1           1
pe           70          29           5
ms           29           1           1
me           76          30           5
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QCLOUD memorder YSZ Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QCLOUD memorder YEZ
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           70          29           5
ps           29           1           1
pe           70          29           5
ms           29           1           1
me           76          30           5
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QCLOUD memorder YEZ Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QRAIN memorder XSZ
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           60          29           5
ps           24           1           1
pe           60          29           5
ms           24           1           1
me           66          30           5
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QRAIN memorder XSZ Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QRAIN memorder XEZ
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           60          29           5
ps           24           1           1
pe           60          29           5
ms           24           1           1
me           66          30           5
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QRAIN memorder XEZ Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QRAIN memorder YSZ
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           70          29           5
ps           29           1           1
pe           70          29           5
ms           29           1           1
me           76          30           5
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QRAIN memorder YSZ Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QRAIN memorder YEZ
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           70          29           5
ps           29           1           1
pe           70          29           5
ms           29           1           1
me           76          30           5
inc/wrf_bdyin.inc ext_write_field QRAIN memorder YEZ Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BXS memorder XS
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           60           5           1
ps           24           1           1
pe           60           5           1
ms           24           1           1
me           66           5           1
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BXS memorder XS Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BXE memorder XE
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           60           5           1
ps           24           1           1
pe           60           5           1
ms           24           1           1
me           66           5           1
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BXE memorder XE Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BYS memorder YS
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           70           5           1
ps           29           1           1
pe           70           5           1
ms           29           1           1
me           76           5           1
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BYS memorder YS Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BYE memorder YE
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           70           5           1
ps           29           1           1
pe           70           5           1
ms           29           1           1
me           76           5           1
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BYE memorder YE Status =            0
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BTXS memorder XS
date 2017-01-01_00:00:00
ds            1           1           1
de           60           5           1
ps           24           1           1
pe           60           5           1
ms           24           1           1
me           66           5           1
inc/wrf_bdyin.inc ext_read_field HT_SHAD_BTXS memorder XS Status =            0
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d01 2017-01-01_00:00:00 module_integrate: calling solve interface

physzw

packard 发表于 2018-2-22 14:02
这样。。。
因为我看报错说Rank 3错了，以为0003的会不一样。

非常感谢！请问为什么$ulimit -s unlimited后，运行./wrf.exe可以通过，但是mpiexec -n 4 ./wrf.exe确提示错误呢？