WRFV3.3.1 + WPSV3.3.1+WRFDAV3.3.1安装（ubuntu11.10)

lzs04

WRFV3.3.1 + WPSV3.3.1+WRFDAV3.3.1i686机器  Ubuntu11.10下用 gcc 4.4.6 + gfortran 编译安装

感谢ztftom 和 随缘  两位大神，下文大部分材料都是参考了他们两位的攻略，略有补充。折腾了两天之后，终于完成了WRF的安装，为了方便后来者参考，写下此文。——lzs04

主要心得：

1、编译器要固定，一开始先配置好，之后不变。版本很重要，选择4.4最好，不要选择最新的。

2、各种包的兼容性很重要（不是越新越好，合理选择好版本，多看readme）

3、各种包的安装位置很重要（各种export，各种修改~/.bashrc，各种配置configure）

4、这是一个考验耐心的工作，要有信心，多看compile后的log，有问题google，一点点解决，摸索。

5、及时记录下自己的发现，总结分享。

6、bbs.06climate.com是个好地方。

1、    装Ubuntu11.10

到网站 www.ubuntu.com 下载，刻光盘，安装。

刚安装完经常会出现屏幕的假死状态，需要对软件进行更新后就好了。

如果出现屏幕假死，可用Ctrl+alt+f2切换到命令行模式，输入用户名密码后，用

命令 killall gnome-session 重新启动桌面。Ctrl+alt+f7切换回桌面系统。

2、    配置系统

掌握基本的linux命令。

配置更新源。

sudo gedit /etc/apt/sources.list

把源放在了原来源的前面，这样会优先使用。

3、    gcc  + gfortran +  g++ 安装

重点： 一定要装4.4版本。

如果之前装过其他版本，建议参考“随缘”兄的文章：

http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3355&extra=&page=1

之所以要先确定编译器的版本，是因为后面装的各种包，和WRF,WPS编译器最好一样，不一样会带来很多问题。我的机器就是因为更新过，所以又重新装了一遍gcc 4.4.6

先输入命令：

#gcc –version   

#gfortran --version

来检查gcc和gfortran的版本或是否安装。

对于为什么用4.4版本，是因为我用最新版编译的时候gcc4.5.2出现了bug，wrf没有编译成功，而换4.4编译完成，gcc4.5.2的bug好像是通过#upgrade gcc可以来补的，我没再深究。

正常情况下，ubuntu11的bin执行文件是放在/usr/bin文件里面的，系统默认安装是gcc4.5.2版本和不安装gfortran。ubuntu11自带的新立得软件是个很不错的软件安装系统，打开新立得，点搜索，在里面输入gfortran-4.4，它会自动在源里搜到关于gfortran-4.4的安装包，选择好安装包，双击就会标记，然后点应用，新立得就会自动处理依赖关系下载安装了，（装g++也一样的程序）。安装gcc4.4也是一样的，有趣的是，Java程序的安装依赖于gcc4.4，Java也是我们后面要用到的，所以直接搜Java，找到Java-common什么的安装包，标记，应用后，系统会提示需要安装哪些依赖系统，在里面就可以看到有gcc4.4的安装包在里面。

当然，如果你想把编译器更新到最新版，可以使用命令：

#apt-get install gcc gfortan g++ m4 csh （这里csh也要更新，否则后面编译wrf时./configure ./compile会有提示不可用）

或者是#apt-get install build-essential

以上做完后，我们打开/usr/bin文件，会看到有4.5和4.4两个版本的编译器，现在/usr/bin/gcc和/usr/bin/gfortran、g++的链接是指向系统默认4.5最新版本的。我们需要做个新的链接指向4.4版本，先把原各链接后改名加back，然后执行建立链接命令：

#ln -s/usr/bin/gcc-4.4 /usr/bin/gcc

Gfortran和g++都一样做这样的链接，完成后再查看版本：

#gcc --version（gfortran、g++一样）

就可以看到编译器都是4.4版本的了

4、    一些必要的包的安装：zlib  libpng  jasper

三个库的安装顺序是zlib---libpng----jasper

一般都是安装在/usr/local下面，如安装zlib是这样：

解压缩的这些就不多说了，直接右键解压缩，可以不用命令，与windows下面是一样的

#./configure --prefix=/usr/local/zlib

#make

#make  install

只要前面编译器设置正确，这里应该不会有什么问题的，很顺利的通过了。Libpng和jasper与zlib安装是一样的，不重复了。

都安装完后，要在/root/bashrc里设置jasper的lib和include路径，以备wrf调用

打开bashrc，加入以下几行：

#for JASPER

export=JASPER=/usr/local/jasper

export=JASPERLIB=/usr/local/jasper/lib

export=JASPERINC=/usr/local/jasper/include

然后

#cd

#source .bashrc就可以了。

建议安装版本：（这个是WPS安装文件下 ungrib下 README_LIBS  建议安装的版本，具体的话google或者到各自的官方网站上去找就能找到）

不建议通过如下命令安装：

apt-get install zlib1g-dev

apt-get install libjasper-dev

apt-get install libpng12-dev

因为在安装WPS的时候，需要把include和lib文件放到一起（其实也可以不用，但是这样方便）。同时，通过以上命令安装，版本不好控制，可能出现兼容性问题。

5、    安装 netcdf 4.0.1

重点：建议安装netcdf4.0.1，更高的版本可能会导致安装有问题。

netcdf4.1.3新版的会出现no entry nc.o in archive的错误了。

具体见文章：

http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3355&extra=&page=1

下载netcdf的地址是  http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/index.jsp

下载：netcdf-4.0.1.tar.gz

“ztftom”大侠在其[原创搞定Ubuntu:单机WRF安装 的帖子中

http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3202

说： “进入解压缩后得到的文件夹，

./configure  --disable-dap --disable-netcdf-4 --prefix=/home/ztftom/util/netcdf

注意：上面红色高亮的两个选项是很多次实验后证明必须的。--disable-dap的原因是缺少一个‘curl’的lib， --disable-netcdf-4是因为WRF暂时不支持netcdf 4”

也可以选在通过如下命令安装libcurl3包：

Sudo apt-get install libcurl3-openssl-dev

这样就只需设置一个不支持hdf5的参数就可以了：

Cd到netcdf路径下，使用命令：

#./configure --disable-netcdf-4 --prefix=/usr/local/netcdf

还是安装在/usr/local下面，方便不同用户都可以调用

#make

#make install

这里应该也是很顺的，不会有什么错误。

同样也是要在bashrc文件里设置环境变量

#gedit ~./bashrc

打开bashrc，加入下面几行：

#for netcdf

export   NETCDF=/usr/local/netcdf

export   PATH=.:$NETCDF/bin:$PATH

export   LD_LIBRARY_PATH=${NETCDF}/lib:${LD_LIBRARY_PATH}

export   LD_RUN_PATH=${NETCDF}/lib:${LD_RUN_PATH

应WRF需要，再加入一行开启支持WRF输出大文件的选项设置：

export   WRFIO_NCD_LARGE_FILE_SUPPORT=1

然后#cd

#source   .bashrc

我们可以验证下netcdf安装成功与否，在终端中输入：

#ncdump

6、    安装NCL6.0

下载NCL6.0的地址是：

http://www.ncl.ucar.edu/Download/

http://www.earthsystemgrid.org/dataset/ncl.html

http://www.earthsystemgrid.org/dataset/ncl.6.0.0.0.bin.nodap.html

要在www.earthsystemgrid.org注册下，然后登入后才可下载

我们这里下载已经在Linux_Debian下编译好的包，如图中选择：

具体可以用 命令：

#uname -m

#gcc –version

来查看自己的该下哪一个版本。

我选择的是编译好了的包。

将其解压缩后，将原文件名改为ncl_ncarg-6，然后复制到/usr/local/下，

打开bashrc文件加入ncarg的环境变量设置，加入如下几行：

#for ncarg

export NCARG_ROOT=/usr/local/ncl_ncarg-6

export PATH=$NCARG_ROOT/bin:$PATH

export MANPATH=$NCARG_ROOT/man:$MANPATH

export DISPLAY=:0.0

然后#cd

#source  .bashrc

验证NCL安装成功与否：

#ncargversion

7、    WRF3.3.1的安装

Wrf3.3.1模式的下载地址是：

http://www.mmm.ucar.edu/wrf/users/download/get_sources.html

也是要注册下才可下载

WRF要用WRFV3.3.1.TAR.gz版本，WRFV3.3.TAR.gz有一些错误，据说有补丁，但我没用过。

在/home自己的用户下面建立一个model的文件夹来存放wrf

如我的是：/home/jie/model 将wrf3.3解压缩在这个文件夹下，然后就可以进行编译了。

在ubuntu里，现在就可以敲入命令开始编译了

#./configure

选择合适的平台。

根据自己的系统选择1-4中的一个。我的理解是：1为单核，2为多核，3为内存共享，多cpu?  4为多cpu多核

如果出现找不到libcloog-ppl0的提示，可以用如下命令安装：

Sudo apt-get install libcloog-ppl0

注：如果用gcc\g++\gfortran 4.6 编译的时候出现错误，

"Error: Size of 'put' argument of 'random_seed' intrinsic at (1) too small (8/12)"的错误

改成gcc\g++\gfortran 4.4 编译后，错误消失。

这也就是为什么建议装gcc\g++\gfortran 4.4.6的原因。

开始执行编译命令：

#./compile  em_real  >& log

这里，一般做天气预报选test里面的em_real，做研究的话可选对应的其他的，好了，现在就静静的等待计算机完成。

我们在WRFV3的文件夹里会看到有个log的记录文件生成，而且计算机在不断向里面写记录，这里一般不会出现什么错误，会顺利完成的。等到全部编译完成，这个log文件的大小正常情况下应该是506KB左右。编译完成，光标返回后，打开log文件，点搜索，输入：错误，查看是否有错。如果在状态栏看到“错误未找到”提示，那么，恭喜你，WRF主程序编译OK了！

8、    WPS3.3.1的安装

WPS3.3.1解压后的文件夹要和WRFV3放在一个文件下面。

配置编译。

#./configure

想配置WRF一样，选择带grib2的合适的平台。

在WPS文件夹下会生成configure.wps文件。在这里，我们需修改下此文件内的相关库的本机化路径。

首先，我们在/usr/local下建立wpslib和wpsinclude两个文件夹来存放相关文件将/usr/local下安装的zlib、libpng、jasper文件夹下的各lib文件夹内的东西复制到wpslib内，这里绕了点，说白了，就是把zlib、libpng、jasper生成的lib库文件统一放入wpslib内便于管理调用和修改设置。关于include头文件和刚才做相同的处理，统一放入wpsinclude文件夹内。

还有一个libX11的库文件路径需要修改，configure.wps的默认搜寻路径在ubuntu11.10是没有的。见下图：

其实libw3.a和libg2_4.a两个库文件在/WPS/ungrib/src/ngl里的g2和w3文件夹里是生成了的，但是好像生成的链接不可用似的，对于这个问题的解决我主要是参考了“Ice & Cream”大侠在网上的一篇博文：

http://hi.baidu.com/longlivehejian/blog/item/702dfaeb2f52fccad439c92b.html

文中讲到“3. wps的编译过程会有几个被忽略的错误，提示找不到libw3.a和libg2_4.a，这是WPS/ungrib/src/ngl中Makefile中的相对路径问题，用gedit打开该Makefile，将两个"$(RANLIB)"后面的路径中的"w3/"和"g2/"去掉。”下图已去掉。

对于http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3355&extra=&page=1

文章中说到的另外一个错误，我没有碰到，可能是因为我用的是更新的版本V3.3.1，所以没有碰到。

成功编译后，应该在主目录里出现如下exe文件。

在util文件夹下出现如下exe文件

9、WRFDA3.3.1的安装

到网站下载WRFDA3.3.1

http://www.mmm.ucar.edu/wrf/users/download/get_source.html

解压后，和WRFV3及WPS放在同一个目录下。

#cd WRFDA

#export BUFR=1

#export CRTM=1

#export gfortran:export GFORTRAN_CONVERT_UNIT="little_endian:94-99"

./configure wrfda

选择和前面WRF一样的类型即可。

./compile all_wrfvar  >& log

运行的时间比较长，耐心等待吧，log大概411KB，如果log中没有错误，恭喜你。

ls -ls var/build/*.exe 会看到很多exe,如da_wrfvar.exe等。

10、参考材料：

1、http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3355&extra=&page=1

2、http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3202

3、http://hi.baidu.com/longlivehejian/blog/item/59963ff2c250a3d20b46e029.html

4、http://hi.baidu.com/longlivehejian/blog/item/702dfaeb2f52fccad439c92b.html

5、http://hejianjun520520.blog.163.com/blog/static/41789395201072011110662/

6、http://apps.hi.baidu.com/share/detail/31941939

7、http://www.mnmuc.org/thread-13-1-1.html

随缘

好啊！兄弟，把我一直没完成的做全了，惭愧啊！一直在忙其他的事情，一些收尾工作没继续做

天目神眉

多谢楼主分享

lzs04

哈哈 很感谢你的文章，要不我不可能两天半搞定。v3.3.1还是比v3.3好很多，你文章里写的好多bug在我这都没有了。

陌小默的

正好一个好友晚上还在问，谢谢拉

mofangbao

每当看到有朋友来这里总结经验分享给大家我就很感动，觉得为论坛付出的所有一切都值了，感谢楼主写下这么精彩的帖子

夏天爱裤衩

膜拜高人啊，自身机器配置不行，一直装的都是WRFV3.1，先学习学习

lzs04

mofangbao 发表于 2012-3-26 23:25

                               
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每当看到有朋友来这里总结经验分享给大家我就很感动，觉得为论坛付出的所有一切都值了，感谢楼主写下这么精 ...

哈哈 感谢管理员给我们提供的平台！ 刚到这个论坛，多多指教~

godenflame135

好东西，学习了，顶起来!

fuyangly

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