关于WRF-Chem安装KPP出现问题的一个解决办法

jazzyl

首先感谢家园里面各位大神的无私分享，包括
1）科研菜鸟, http://blog.sciencenet.cn/u/sanshiphy
2）WRF 3.9.1.1 在Ubuntu16.04 LTS 下的安装包括Chem kpp，http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=57144

秉承着大神的分享精神，我分享一个解决KPP安装问题的办法。需要预先说明的是，这个问题不一定适用所有出现KPP安装问题的情况，但问题解决的思路应该适用于大部分情况。
我的软件环境：Ubuntu 16.04， WRF-Chem 3.8.1，GNU compiler (gcc\g++\gfortran) 5.4.0
KPP安装问题表现：WRF_KPP=0时WRF-Chem能够编译成功，但WRF_KPP=1时则出现问题，编译后没有在main目录下生成ndwon.exe，real.exe，wrf.exe和tc.exe。

解决思路：检查编译日志（也就是命令"./compile em_real >&checkwrf.log"生成的checkwrf.log文件），探索编译程序的出错提示。

解决过程：通过检查编译日志，会发现./compile程序会调用之前安装的yacc和flex编译一系列源码，包括scan.y，y.tab.c，y.tab.o，lex.yy.o等。这个过程日志会显示：
"/usr/local/yacc/yacc -d scan.y
...
gcc -O -c y.tab.c
..."
继续检查日志，会发现问题出错在这一行：
"gcc -O -lm y.tab.o lex.yy.o scanner.o scanutil.o kpp.o gen.o code.o code_c.o code_f77.o code_f90.o code_matlab.o debug.o -L/usr/local/flex/lib -lfl -ll -o kpp"
日志文件会提示说：
"/usr/bin/ld: cannot find -ll
collect2: error: ld returned 1 exit status
Makefile:66: recipe for target 'kpp' failed
make[1]: *** [kpp] Error 1
make[1]: Leaving directory '/home/models/WRFV3/chem/KPP/kpp/kpp-2.1/src'"

这个提示的意思是说编译程序找不到“ll”这个库，换言之，也就是flex中的libl.a文件。接下来的解决思路就简单了，也就是提供一个包括libl.a文件的flex版本。在Ubuntu 16.04上，解决方法是输入"apt-get install flex"安装flex, 然后设置两个环境变量FLEX和FLEX_LIB_DIR:
export FLEX=/usr/bin/flex
export FLEX_LIB_DIR=/usr/lib/x86_64-linux-gnu

最后，重新编译WRF-Chem即可：
./clean -a
./configure
./compile em_real >&checkwrf.log


希望提供的信息有所帮助！有什么反馈和其他办法请大家分享上来。

jazzyl

天下第贰 发表于 2018-11-5 09:41
官方教程说的很清楚，安装kpp需要libl.a

请问你说的官方教程是哪个文件呢？我当初搜了很多也没找到。

天下第贰

官方教程说的很清楚，安装kpp需要libl.a

天下第贰

jazzyl 发表于 2018-11-6 09:08
请问你说的官方教程是哪个文件呢？我当初搜了很多也没找到。

wrf chem的user's guide，里面安装的时候强调了这个libl.a

天下第贰

求教一下，怎么样算kpp安装好了，我突然发现我的compile.log里kpp部分有很多错误，但是写着ignored

jazzyl

天下第贰 发表于 2018-11-6 10:13
wrf chem的user's guide，里面安装的时候强调了这个libl.a

抱歉，你说的是否是libfl.a，而不是libl.a? 我在自己电脑上的实验结果是只有libfl.a装不了KPP。

青帘影

厉害啊，当初装这个卡了好久，最后莫名其妙又装好了。
请问楼主，排放源处理这块你熟悉吗？

天下第贰

jazzyl 发表于 2018-11-6 21:16
抱歉，你说的是否是libfl.a，而不是libl.a? 我在自己电脑上的实验结果是只有libfl.a装不了KPP。

对，是你说的那个，我说错了

jazzyl

天下第贰 发表于 2018-11-6 10:19
求教一下，怎么样算kpp安装好了，我突然发现我的compile.log里kpp部分有很多错误，但是写着ignored

抱歉，后来很久没上06climate网站。如果kpp安装好了，在根目录下会生成ndwon.exe、real.exe、wrf.exe、tc.exe四个文件。
你说的这个问题我没有遇到过。后来装成功了吗？

jazzyl

青帘影 发表于 2018-11-11 08:51
厉害啊，当初装这个卡了好久，最后莫名其妙又装好了。
请问楼主，排放源处理这块你熟悉吗？

我也正在学习这个，查遍了整个论坛也没完全搞明白如何在WRF-Chem使用清华编的MEIC/MIX清单。你后来弄明白了吗？