PREP-CHEM-SRC-1.5成功编译经验总结

clover~

      最近开始接触WRF-Chem，目前停留在学习用工具处理排放源的阶段。今天上午成功编译PREP-CHEM-SRC-1.5，其中遇到很多棘手的error，想了很多办法终于解决，个人感觉这些经验比较有用，因此分享给大家。
      解压并安装后首先要看README!! 按照文件里面的步骤一步步安装基本上没问题。但是里面的内容写的相对简略，对于小白可能有些地方会看不太懂，所以我把文件中看不太懂的地方做些补充。
      在编译之前，首先要确保成功安装以下三个库（注意版本）
1. ZLIB 1.2.8(libz.a) or later  distribution.  You may download the software from
    http://www.zlib.net/
2. HDF5-1.8.13(libhdf5_fortran.a, libhdf5hl_fortran.a) or later  distribution. You may download the software from
    http://www.hdfgroup.org/HDF5/release/obtain5.html
3. NetCDF 4.1.3 (libnetcdf.a).  You may download the software from
    ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/
       安装WRF的时候要求安装NetCDF，所以要去环境变量中看一下NetCDF库安装的位置。安装ZLIB库可能会遇到文件夹无法创建的问题，这个问题百度或者谷歌都可以轻松解决。困扰我一天之久的问题是HDF5库的安装，这也是里面最容易出问题的地方!!!画重点!!!
       HDF5编译有问题，会出现prep chem Can't open module file 'hdf5.mod' for reading at (1): No such file or direct这个BUG，当HDF5配置成功之后，这个问题就解决了!!!!
      下面我具体说明HDF5的安装步骤：
   首先确保ZLIB已经成功安装，完成后安装HDF5，步骤如下：
           ./configure  \
        --prefix=/path_libs/hdf5-1.8.13 \
        --with-zlib=/path_libs/zlib-1.2.8  \
        --disable-shared \
        --enable-fortran
make
make check
make install
make check-install

      configure时，一定要按照标红的部分输入，不然编译PREP-CHEM-SRC-1.5时会出问题。make后要make check，保证没有error。完成以上步骤后，三个库就装好了。

      接下来要编译prep_chem_sources。
      首先需要进入bin/build目录下  cd bin/build
      我用的服务器装的是gfortran，所以vim include.mk.gfortran.wrf
      打开文件后要修改的内容如下
# NETCDF libraries
NETCDF=/users/public/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf
#NETCDF=/scratchin/grupos/catt-brams/shared/libs/gfortran/netcdf-4.1.3
NETCDF_INC=-I$(NETCDF)/include
NETCDF_LIBS=-L$(NETCDF)/lib -lnetcdff -lnetcdf
# HDF libraries
HDF5=/users/wanghw/wrf_chem/prep_chem_resources/hdf5
#HDF5=/scratchin/grupos/catt-brams/shared/libs/gfortran/hdf5-1.8.13-serial
HDF5_INC=-I$(HDF5)/include
HDF5_LIB=-L$(HDF5)/lib -lhdf5hl_fortran -lhdf5_fortran -lhdf5_hl -lhdf5 -ldl -L/users/wanghw/wrf_chem/prep_chem_resources/zliblib -lz -ldl
      标红的位置是需要修改的地方。
      完成后，输入
make OPT=gfortran.wrf CHEM=RADM_WRF_FIM
or
make OPT=intel.wrf CHEM=RADM_WRF_FIM
or
make OPT=pgi.wrf CHEM=RADM_WRF_FIM
     取决于编译器
     如果没有出现上面提到的error，可能会出现另一个error：

cp -f  ../../src/edgar_emissions.f90 edgar_emissions.f90

gfortran -c -Xpreprocessor -DRADM_WRF_FIM -O2 -fconvert=big-endian -frecord-marker=4 -I../../aux_src/utils/include -I/usr/include -I/usr/include  edgar_emissions.f90

edgar_emissions.f90:841.15:

'AGRICULTURE',&

               1

Error: Different CHARACTER lengths (11/6) in array constructor at (1)

edgar_emissions.f90:894.61:

      filename=trim(edgar_data_dir)//"/"//trim(PREFIX)//trim(setor(isetor))//tr

                                                             1

Error: Function 'setor' at (1) has no IMPLICIT type

edgar_emissions.f90:916.16:

        if(trim(setor(isetor)) .eq. 'AGRICULTURE' .and. trim(spc_name(ispc)) .n

                1

Error: Function 'setor' at (1) has no IMPLICIT type

edgar_emissions.f90:923.30:

                  print*,trim(setor(isetor)),"   ",trim(dsetname),i, " MAX ",ma

                              1

Error: Function 'setor' at (1) has no IMPLICIT type

edgar_emissions.f90:924.30:

                  print*,trim(setor(isetor)),"   ",trim(dsetname),i, " MIN ",mi

                              1

Error: Function 'setor' at (1) has no IMPLICIT type

make: *** [edgar_emissions.o] Error 1

WRF forum http://forum.wrfforum.com/viewtopic.php?f=5&t=8793的回答可完美解决此error，到此prep_chem_sources就编译成功啦！

grapee

您好，按照最后所给的网址提供的方法无法解决那个问题，您知道是为什么吗？

clover~

grapee 发表于 2019-8-27 16:11
您好，按照最后所给的网址提供的方法无法解决那个问题，您知道是为什么吗？

我也不太清楚，关于error的问题最好谷歌，然后多试一试谷歌提供的方法吧，说不定哪个就成功了。当时我就是这样搞的。

grapee

clover~ 发表于 2019-8-27 20:26
我也不太清楚，关于error的问题最好谷歌，然后多试一试谷歌提供的方法吧，说不定哪个就成功了。当时我就 ...

好的 感谢！

xlilium

grapee 发表于 2019-8-28 16:11
好的 感谢！

您好，请问您解决最后那一个问题了嘛？

xlilium

解决最后一个问题关于gfortran的问题啦，楼主可能粘贴错了网址~~~
http://forum.wrfforum.com/viewtopic.php?f=39&t=9199
根据调整"edgar_emissions.f90"的源代码可完美解决

圆滚滚123

成功解决，非常感谢

Nibawer

受教了，感谢楼主

小黑呀

感谢楼主，顺便补充一下，楼主主楼最后提供的链接已经失效了，但相同的error可以参考下面这位好心人的帖http://bbs.06climate.com/forum.p ... ;highlight=pre-chem

ULYSSES

你好，还有搂主提供的链接的有效地址吗。好像每一个都失效了。解决这个问题的人能不能解答一下