CESM1_2_2移植

youngman

CESM1_2_2移植记录

Intel编译器 mpich并行库

下载和更新软件包：

svnco --username guestuser --password friendly https://svn-ccsm-models.cgd.ucar.edu/cesm1/release_tags/cesm1_2_2cesm1_2_2

系统提示store password unencrypted (yes/no) 输入yes

下载过程非常顺畅，只有pio无法下载（自动回复：请不要使用迅雷等下载工具，点我查看下载帮助）（自动回复：请不要使用迅雷等下载工具，点我查看下载帮助）（自动回复：请不要使用迅雷等下载工具，点我查看下载帮助）

解决办法：

https://bb.cgd.ucar.edu/googlecode-repositories-are-offline-pio-source-not-found

tools/cprnc/SVN_EXTERNAL_DIRECTORIES:

       -genf90     http://parallelio.googlecode.com/svn/genf90/trunk_tags/genf90_140121

       +genf90       https://github.com/PARALLELIO/genf90/tags/genf90_140121

cesm1_2_2/SVN_EXTERNAL_DIRECTORIES:

       -models/utils/pio    http://parallelio.googlecode.com/svn/trunk_tags/pio1_8_12/pio

       +models/utils/pio           https://github.com/NCAR/ParallelIO.git/tags/pio1_8_12/pio

更新以上两个文件并运行：

svnpropset svn:externals -F SVN_EXTERNAL_DIRECTORIES .

svnupdate

开始移植：

配置cesm1_2_2/scripts/ccsm_utils/Machines目录下四个文件：

①     vi config_machines.xml

②     vi config_compilers.xml

netcdf3.6.2及以后版本的c及fortran的库是分开的，写库路径时加上-lnetcdff 和-lnetcdf

③    cp env_mach_specific.userdefined env_mach_specific.nuist

注：netcdf版本选择；cmake在环境里有，但不在module列表里

④    cpmkbatch.userdefined mkbatch.nuist

链接inputdata：

ln-s /nuist/p/public/data/CESM_inputdata/* inputdata/

测试：

cdcesm1_2_2/scripts

./create_newcase-case test -res f19_g16 -compset X -mach nuist

cd test

./cesm_setup

./test.build   依次编译mct, gptl, pio,csm_share

成功显示：

./test.run

catCaseStatus 查看运行结果，成功显示：runSUCCESSFUL

在config_machines.xml文件中定义的$RUNDIR目录下生成nc文件

出错记录：

C compiler not work：没有链接正确的编译器或netcdf库

       cp:cannot stat `Makefile.conf.old': No such file or directory

       cp:cannot stat `Makefile.conf': No such file or directory

       Makefile:4:Makefile.conf: No such file or directory

       make:*** No rule to make target `Makefile.conf'. Stop.

找不到pio文件：CESMcode下载错误，需要更新

参考：http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=35950

http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=52573&highlight=cesm

http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=40433

乱世一杯茶

想问一下超算或者服务器的module 到底是什么，每次使用module name，

youngman

乱世一杯茶 发表于 2019-7-2 13:01
想问一下超算或者服务器的module 到底是什么，每次使用module name，

是一个管理不同软件环境变量的工具，具体可以百度一下

janicewang

楼主你好，我刚开始接触模式，想请教一下“移植”是什么意思？和安装有什么不同呢？

youngman

janicewang 发表于 2019-7-6 23:59
楼主你好，我刚开始接触模式，想请教一下“移植”是什么意思？和安装有什么不同呢？

就差不多一个意思吧，如果编译器和库一样，在一个机器上安装的CESM可以复制到另一个机器上运行，所以习惯上叫移植，我是这样理解的~

janicewang

youngman 发表于 2019-7-7 08:26
就差不多一个意思吧，如果编译器和库一样，在一个机器上安装的CESM可以复制到另一个机器上运行，所以习惯 ...

明白~谢谢楼主嘻嘻~~

猫猫monty

楼主，您好！我是小白一枚，想请教一下，如果我申请的大型机上已经安装好了CESM，我想在自己账号下使用，需要进行什么操作呢？

youngman

猫猫monty 发表于 2019-12-5 14:09
楼主，您好！我是小白一枚，想请教一下，如果我申请的大型机上已经安装好了CESM，我想在自己账号下使用，需 ...

我安装好后还没有用过，所以具体不清楚。一般来说应该只需要将可执行文件链接到你自己的目录下，然后保证编译器与原安装CESM时一致就可以了吧

猫猫monty

youngman 发表于 2019-12-6 10:20
我安装好后还没有用过，所以具体不清楚。一般来说应该只需要将可执行文件链接到你自己的目录下，然后保证 ...

感谢楼主回复啊，因为身边用模式的人比较少，想请问一下楼主这方便设置和操作有没有什么教程？

youngman

猫猫monty 发表于 2019-12-6 14:52
感谢楼主回复啊，因为身边用模式的人比较少，想请问一下楼主这方便设置和操作有没有什么教程？

家园里搜搜看~关于CESM我了解的也不多