求助：cam3.0编译过程中出错

wangchense

参考官网的用户手册和论坛中别人的帖子安装CAM3.0模式，但是在configure的时候出了错误，尝试了几种办法都没有解决
以下是我的安装记录以及错误：

1.    下载源代码www.cesm.ucar.edu/models/atm-cam/download/

2.    解压gunzip -c cam3.0 sourcecode.tar.gz | tar xvf -

gunzip -c cam3.0 forall datasets.tar.gz | tar xvf –

gunzip -c cam3.0 64x128 T42 datasets.tar.gz | tar xvf –

3.    setenv CSMDATA ‘pwd‘

ps：bash中用export语句：

配置环境变量：

exportCAMROOT=/share/home/student4/cam1/models/atm/cam

exportCSMDATA=/share/home/student4/cam1/models/atm/inputdata(自己创建的文件夹)

exportINC_NETCDF=/share/apps/netcdf-4.4/include

exportLIB_NETCDF=/share/apps/netcdf-4.4/lib

exportMOD_NETCDF=/share/apps/netcdf-4.4/include

exportUSER_FC=/share/apps/openmpi-1.4.3/bin/mpif90

exportUSER_CC=/opt/intel/bin/icc

exportINC_MPI=/share/apps/openmpi-1.4.3/include

exportLIB_MPI=/share/apps/openmpi-1.4.3/lib

4.    ./cam1/models/atm/cam/bld/configure -test

这一步出现问题：
creating /share/home/student4/Filepath
creating /share/home/student4/params.h
creating /share/home/student4/misc.h
creating /share/home/student4/preproc.h
creating /share/home/student4/Makefile
creating /share/home/student4/config_cache.xml
Looking for a valid GNU make... using gmake
Testing for Fortran 90 compatible compiler... using mpif90
Testing NetCDF library... **** FAILED ****
Issued the command:
gmake test_nc 2>&1
The output was:
cat: Srcfiles: No such file or directory
Makefile:1008: /share/home/student4/Depends: No such file or directory
/share/home/student4/cam1/models/atm/cam/bld/mkSrcfiles > /share/home/student4/Srcfiles
/share/home/student4/cam1/models/atm/cam/bld/mkDepends Filepath Srcfiles > /share/home/student4/Depends
/share/apps/openmpi-1.4.3/bin/mpif90 -c  -DHIDE_MPI  test_nc.F90
test_nc.F90(3): #error: can't find include file: netcdf.inc
gmake: *** [test_nc.o] Error 1
我自己的理解是netcdf的问题，但是经检查路径里都是有netcdf.inc这个文件的，因为是在学校的大型机上安装的，经查找发现学校大型机上有不同版本的netcdf和mpi，如下：

whereis netcdf：

/share/apps/netcdf-4.4/include/netcdf.h

/share/apps/netcdf-4.4/include/netcdf.mod

/share/apps/netcdf-4.4/include/netcdf.inc

/share/apps/netcdf-4.0.1/include/netcdf.mod

/share/apps/netcdf-4.0.1/include/netcdf.inc

/share/apps/netcdf-4.0.1/include/netcdf.h

/share/apps/netcdf-4.0.1/include/netcdf.hh

mpif90:

/share/apps/openmpi-intel-2011/bin/mpif90

/share/apps/intel/compilers_and_libraries_2018.1.163/linux/mpi/intel64/bin/mpif90

/share/apps/openmpi-1.4.3/bin/mpif90

/share/apps/intel2015/impi/5.0.3.048/intel64/bin/mpif90

几个版本的netcdf和mpi都做了尝试，但是不管怎样都是这个错误，在别人的帖子中也没有找到解决方法，求助各位看一下是哪里的问题，谢谢大家

wangchense

看了别人的帖子中的同样问题，有人给出了建议尝试了但是还是不行……

wangchense

自己顶一下……

kermit

路径里面有，但你要保证搜索路径里面也有。
你可以指定下默认搜索路径。

这问题我也遇到过。
总之就是把inc复制到系统找得到的地方

wangchense

kermit 发表于 2020-5-21 20:04
路径里面有，但你要保证搜索路径里面也有。
你可以指定下默认搜索路径。

那请问默认搜索路径在哪里指定呢？
我尝试过复制文件过去，但是在大型机上我没有权限

kermit

wangchense 发表于 2020-5-22 08:20
那请问默认搜索路径在哪里指定呢？
我尝试过复制文件过去，但是在大型机上我没有权限

你可以在环境变量里面设置一个 或者用-I选项指定
具体做法请自行百度

wangchense

kermit 发表于 2020-5-22 10:25
你可以在环境变量里面设置一个 或者用-I选项指定
具体做法请自行百度

好的！谢谢你

风策策度庭竹

因为后面netcdf-c和netcdf-fortran后面分开了，所以有两个库文件，c的是netcdf，fortran的是netcdff，但是它应用的netcdf，所以要自己添上netcdff的连接。LDFLAGS=“-L./lib -lnetcdff”