【求助】WRF如何安装smpar并行并运行？

bxhwc

我按照帖子http://bbs.06climate.com/forum.php?mod=viewthread&tid=32817正常安装了WRF的serial版本，而且能正常运行。
现在我想安装WRF的smpar版本，用我的单个计算机（多核）进行运算，希望能提高速度。
但是按照同样的步骤可以安装serial版本和dmpar版本，但是在安装smpar版本时出现问题，我的具体安装步骤在附件有十分详细的总结。这边我简单说一下我的步骤：
1，安装库函数及其它函数；
2，安装WRFV3；
3，安装WPS；
我在安装WRFV3时选择33 x86_64 Linux gfortran compiler with gcc (smpar)，能正常生成ndown.exe nup.exe real.exe tc.exe wrf.exe;
但是在安装WPS时，只能生成ungrib.exe，而geogrid.exe和metgrid.exe 却无法正常生成，查看.log文件发现报错是：对'GOMP_parallel'未定义的引用等等。这里我其实已经安装了mpich，不知道这个问题怎么解决。想请教一下怎么用gfortran+gcc安装smpar版本的WRF，然后安装后怎么用多核运行呢？

ljchen1989

bxhwc 发表于 2017-6-17 18:49
我的问题是，WRFV3我能安装成功，但是WPS安装只有ungrib.exe，缺少geogrid.exe和metgrid.exe，也就是说WP ...

首先，你ungrib.exe编译的也不一定成功，grib2格式的数据你能解压么？
其次，缺少那两个exe一般是configure造成的，你注意一下configure里面的OMP FLAGS是怎么写的，gfortran应该是-fopenmp，可能还有其他FLAGS错误；WRF编译错误一般是configure不匹配导致的，修改configure可以解决90%以上的编译错误
再次，openmp单机的效率有时确实比mpi高，比如一些idealized case，像LES；控制核心数用OMP_NUM_THREADS；WRF基于fortran，只能用物理真核，cores，超线程threads在wrf面前没用
最后，集群不能用openmp

淡水河

WPS计算量不大  单核够用了

ljchen1989

同意楼上，二楼正解

bxhwc

淡水河 发表于 2017-6-16 21:30
WPS计算量不大  单核够用了

我的问题是，WRFV3我能安装成功，但是WPS安装只有ungrib.exe，缺少geogrid.exe和metgrid.exe，也就是说WPS的serial版本我也安装不成功

bxhwc

ljchen1989 发表于 2017-6-17 11:36
同意楼上，二楼正解

我的问题是，WRFV3我能安装成功，但是WPS安装只有ungrib.exe，缺少geogrid.exe和metgrid.exe，也就是说WPS的serial版本我也安装不成功。百度了很多也没有说怎么用gfortran进行wrf的smpar版本的安装的

淡水河

bxhwc 发表于 2017-6-17 18:49
我的问题是，WRFV3我能安装成功，但是WPS安装只有ungrib.exe，缺少geogrid.exe和metgrid.exe，也就是说WP ...

囧 我的意思就是实在不行的话就不要安装WPS的serial版本，单核计算就行了

bxhwc

淡水河 发表于 2017-6-17 19:31
囧 我的意思就是实在不行的话就不要安装WPS的serial版本，单核计算就行了

你的意思是我装两套，一套是smpar的WRFV3，另一套是serial的WPS吗？以后先用WPS处理网格，然后用WRFV3调用？这个思路似乎可以！我可以试一下！非常感谢你的回答！
PS：今天我又试了一下dmpar的版本，发现单机计算机还是可以提速的，我的笔记本是4核，
调用2、3、4核提速分别为36%、41%、35%。所以如果你的思路行不通的话我感觉装dmpar版本也可以

bxhwc

淡水河 发表于 2017-6-17 19:31
囧 我的意思就是实在不行的话就不要安装WPS的serial版本，单核计算就行了

按照你的方法我可以运行smpar版本的WRFV3了！！非常感谢！！！
但是我有一个疑问：smpar版本的WRFV3运行wrf.exe时能不能设置控制核数呢？我觉得挺奇怪的，直接运行./wrf.exe就能并行，不需要设置核数；而且这个速度和dmpar版本用3个核的效果差不多。dmpar运行时候是：
mpirun -np 3 ./wrf.exe

bxhwc

ljchen1989 发表于 2017-6-17 21:46
首先，你ungrib.exe编译的也不一定成功，grib2格式的数据你能解压么？
其次，缺少那两个exe一般是config ...

非常感谢你这么仔细的回答，感觉理解又加深了不少
我按照楼上建议WPS用serial版本安装似乎可以运行WRFV3的smpar版本了，所以configure里面这个问题我也就暂时不花时间去解决了。
再次感谢！！！