请教GSI3.5官网例子运行错误

洛书let

问题已经解决，留个爪印给后面出现同样错误的同学一个参考~
我后来在气象家园看到一个帖子，然后按照她的~/.bashrc改的，之后哦就莫名奇妙的好了，下面给出最后的修改结果，给后来人一个参考
#NETCDF#
export NETCDF=/public/home/huyiwen/netcdf-3.6.3/inter
export NETCDF_LIB=$NETCDF/lib
export NETCDF_INC=$NETCDF/include
export PATH=$NETCDF/bin:$PATH
export MANPATH=$MANPATH:$NETCDF/share/man

然后关于我的报错问题，exit 71，我先把单点实验放下了，先运行的第二个实验，运行成功，然后查看这两个例子的运行报错上有什么差异，单点实验错误出在sed: can't read anavinfo: No such file or directory
也就是说它缺少了一个文件，在输出的结果中，第二个实验结果有anavinfo文件，而第一个实验的这个文件是空的，说明问题在这里
重新回到官网看说明，官网上要求在fix文件夹中修改，../fix/anavinfo_arw_netcdf_glbe文件中所有40,41，改成50,51,。查看自己的fix文件夹，只有anavinfo_arw_netcdf文件，这是第二个实验用的，而没有anavinfo_arw_netcdf_glbe文件。
至此发现错误原因，于是自己创建了anavinfo_arw_netcdf_glbe文件，把内容写进去，然后运行，终于成功~

cinderellaty

洛书let 发表于 2017-10-11 07:36
问题已经解决，留个爪印给后面出现同样错误的同学一个参考~
我后来在气象家园看到一个帖子，然后按照她的~ ...

有始有终才是有意义的问题，谢谢你

洛书let

再次求助，我在运行第3个例子的时候，想设置串行并行数， GSIPROC=8，官网也说这个数字是自己随便设置的，然后就报错如下
+ mpirun -np 8 -machinefile '~/mach' gsi.exe
+ 1> stdout 2>& 1
+ error=1
+ [ 1 -ne 0 ]
+ echo 'ERROR:  crashed  Exit status=1'
ERROR:  crashed  Exit status=1
想请问大家在使用的时候这里是怎么写的呢？觉得应该是和这里有关，但是不会改，求助大神呀~
   'LINUX')
      if [ $GSIPROC = 1 ]; then
         #### Linux workstation - single processor
         RUN_COMMAND=""
      else
         ###### Linux workstation -  mpi run
        RUN_COMMAND="mpirun -np ${GSIPROC} -machinefile ~/mach "

cinderellaty

洛书let 发表于 2017-10-16 17:01
再次求助，我在运行第3个例子的时候，想设置串行并行数， GSIPROC=8，官网也说这个数字是自己随便设置的， ...

不好意思刚看到，这个不太清楚，很久没用了，我记得GSIPROC的值我直接设置是没有问题的，

洛书let

cinderellaty 发表于 2017-10-19 08:17
不好意思刚看到，这个不太清楚，很久没用了，我记得GSIPROC的值我直接设置是没有问题的，

恩恩，这个问题我问其他的学长学姐他们说要找管理员老师问比较好，感谢你的回答，
可以请问一下，运行GSI的观测场文件一般是在哪里下载的呢？比如prepbufr对应的gdas1.t12z.prepbufr；或者，amsuabufr对应的gdas1.t12z.1bamua.tm00.bufr这些，我在官网上看到这个网址，说是1个月内的短时的数据
http://nomads.ncep.noaa.gov/pub/data/nccf/com/gfs/prod/
但是里面不同日期的文件命名都是一样的，这是为什么呢？我想找以前的数据在哪里可以找到呢。
还有，我随便复制一天的数据名字，
Parent Directory                                     -   
gdas.t00z.1bamua.tm00.bufr_d    11-Oct-2017 05:52   13M  
gdas.t00z.1bhrs4.tm00.bufr_d    11-Oct-2017 05:53   28M  
gdas.t00z.1bmhs.tm00.bufr_d     11-Oct-2017 05:53   42M  
gdas.t00z.abias                 11-Oct-2017 06:26  1.0M  
gdas.t00z.abias_air             11-Oct-2017 06:26  1.0M  
gdas.t00z.abias_pc              11-Oct-2017 06:26  1.1M  
gdas.t00z.adpsfc.tm00.bufr_d.nr 11-Oct-2017 05:53   14M  
gdas.t00z.adpupa.tm00.bufr_d    11-Oct-2017 05:50  1.7M  
gdas.t00z.airsev.tm00.bufr_d    11-Oct-2017 05:53  228M  
gdas.t00z.atmanl.nemsio         11-Oct-2017 06:41  6.9G  
gdas.t00z.atms.tm00.bufr_d      11-Oct-2017 05:53   76M  
它里面的数据名字开头是grad没有后面的1。。。。和说明文件上给的例子开头的名字也不一样，我直接下载然后传输到服务器上，官网给的例子解压出来是文件名字是绿色的，这个是白色的，然后运行的个例也没有吧这部分数据同化进去运算，结果错误，
请问这个应该怎么做呢，是我下载的网址不对，还是这里的文件下载了也需要编译，如果可以请您指导我一下，拜谢了

cinderellaty

洛书let 发表于 2017-10-19 13:11
恩恩，这个问题我问其他的学长学姐他们说要找管理员老师问比较好，感谢你的回答，
可以请问一下，运行GS ...

是这个网址呢，文件名不一样没有同化进去，你要看一下程序中读取的文件名是怎么设置的，是不是数据就没有读进去，这个数据是没有问题的，在这个网站上下载的数据只有一段时间，每天都会删除旧的数据，所以如果想要更早之前的观测数据，在RDA的网站上可以下载到

cinderellaty

洛书let 发表于 2017-10-19 13:11
恩恩，这个问题我问其他的学长学姐他们说要找管理员老师问比较好，感谢你的回答，
可以请问一下，运行GS ...

看错误是什么，哪个区域的，你的BE文件用的对不对

洛书let

cinderellaty 发表于 2017-10-19 14:08
看错误是什么，哪个区域的，你的BE文件用的对不对

您说的BE文件指的是？

我是在运行官网3.5版本的第四个例子，4D，EnKF，的例子，我发现这里： ANAL_TIME=2014061706， HH=`echo $ANAL_TIME | cut -c9-10`，那调用${HH}指的就应该是06的吧？
所以官网给的脚本链接obs文件的语句如下：
# Link to the radiance data
ln -s ${OBS_ROOT}/gdas1.t${HH}z.1bamua.tm00.bufr_d amsuabufr
ln -s ${OBS_ROOT}/gdas1.t${HH}z.1bhrs4.tm00.bufr_d hirs4bufr
ln -s ${OBS_ROOT}/gdas1.t${HH}z.1bmhs.tm00.bufr_d mhsbufr
ln -s ${OBS_ROOT}/gdas1.t${HH}z.gpsro.tm00.bufr_d gpsrobufr
ln -s ${OBS_ROOT}/nam.t${HH}z.radwnd.tm00.bufr_d radarbufr
，这样看是不是就应该指的是gdas1.t06z.1bamua.tm00.bufr_d、gdas1.t06z.1bhrs4.tm00.bufr_d等等文件，可是官网例子给的数据还是gdas1.t00z.1bamua.tm00.bufr_d等的文件，我怀疑是不是这里有问题，不知道我想的对不对。
那我去找以前的数据试一下，不过目前还没找到下载的网址ORZ

cinderellaty

洛书let 发表于 2017-10-19 15:30
您说的BE文件指的是？

我是在运行官网3.5版本的第四个例子，4D，EnKF，的例子，我发现这里： ANAL_TIM ...

BE是背景场误差协方差
https://rda.ucar.edu/datasets/ds337.0/

JHONG

请问成功安装后生成的gsi.exe是多大？我发现mpich环境不一样编译得到的gsi.exe的大小不一样，有23M的，有29M的，都跑不通官方的例子，不知道是不是我编译错了。装的3.6版的GSI，用的5.4.0版本的gfortran，其他也都是按它要求的来的。。。